RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636616.1

EFHC1-223, Transcript of EF-hand domain containing 1, human

TSL 5

Gene EFHC1, Length 1,636 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFHC1-223	ENST00000636616	NSUN4	Q96CB9	384 aa	Known RBP	5.5	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	NEIL1	Q96FI4	390 aa	Predicted RBP	5.5	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	TOE1	Q96GM8	510 aa	Known RBP	5.5	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	TWNK	Q96RR1	684 aa		5.5	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	FOXB1	Q99853	325 aa		5.5	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	ADPGK	Q9BRR6	497 aa		5.5	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	OSBPL6	Q9BZF3	934 aa		5.5	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	PABPC3	Q9H361	631 aa	Known RBP	5.5	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	EPB41L4A	Q9HCS5	686 aa	Predicted RBP	5.5	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	TDP1	Q9NUW8	608 aa		5.5	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	FEZ2	Q9UHY8	353 aa	Predicted RBP	5.5	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	HERC5	Q9UII4	1024 aa	Known RBP	5.5	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	NCAPD2	Q15021	1401 aa		5.5	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	COL5A2	P05997	1499 aa	Predicted RBP	5.49	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	BCL9L	Q86UU0	1499 aa		5.49	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	KDR	P35968	1356 aa		5.49	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616		A0A087WZ62	844 aa		5.49	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	TRIM64	A6NGJ6	449 aa		5.49	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	TRIM64B	A6NI03	449 aa		5.49	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	OPHN1	O60890	802 aa		5.49	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	MLYCD	O95822	493 aa		5.49	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	LRG1	P02750	347 aa		5.49	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	APOA4	P06727	396 aa		5.49	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	ITGA2B	P08514	1039 aa		5.49	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	MED14OS	P0DP75	135 aa		5.49	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	GLDC	P23378	1020 aa		5.49	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	CHM	P24386	653 aa		5.49	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	IGFBP6	P24592	240 aa	Predicted RBP	5.49	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	PSMA3	P25788	255 aa		5.49	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	MC3R	P41968	323 aa		5.49	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	ARF3	P61204	181 aa	Predicted RBP	5.49	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	ARF1	P84077	181 aa	Known RBP	5.49	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	TLE1	Q04724	770 aa		5.49	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	5.49	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	NOLC1	Q14978	699 aa	Known RBP eCLIP	5.49	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	MAN2A1	Q16706	1144 aa		5.49	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	UBXN11	Q5T124	520 aa		5.49	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF648	Q5T619	568 aa	Predicted RBP	5.49	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	SNX30	Q5VWJ9	437 aa		5.49	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	BBS12	Q6ZW61	710 aa		5.49	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	USP49	Q70CQ1	688 aa		5.49	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	RNF44	Q7L0R7	432 aa		5.49	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	VGLL2	Q8N8G2	317 aa		5.49	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	APPL2	Q8NEU8	664 aa		5.49	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	BRIX1	Q8TDN6	353 aa	Known RBP	5.49	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	SECISBP2L	Q93073	1101 aa	Known RBP	5.49	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	FDXACB1	Q9BRP7	624 aa	Predicted RBP	5.49	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	MRPL9	Q9BYD2	267 aa	Known RBP	5.49	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	RNPEP	Q9H4A4	650 aa		5.49	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	DBNDD1	Q9H9R9	158 aa		5.49	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	BTBD7	Q9P203	1132 aa		5.49	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	ADD3	Q9UEY8	706 aa	Known RBP	5.49	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	WASF3	Q9UPY6	502 aa		5.49	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	PCDHB6	Q9Y5E3	794 aa		5.49	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	EP400	Q96L91	3159 aa		5.49	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	LRP6	O75581	1613 aa		5.49	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	IGSF1	Q8N6C5	1336 aa		5.49	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF521	Q96K83	1311 aa		5.49	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	COL3A1	P02461	1466 aa	Predicted RBP	5.49	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	NT5C1B-RDH14	C9J2C7	533 aa		5.48	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	SPTLC2	O15270	562 aa		5.48	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	IGHD	P01880	384 aa		5.48	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	AHSG	P02765	367 aa		5.48	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	KRT1	P04264	644 aa		5.48	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	C8B	P07358	591 aa		5.48	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	CSF1	P09603	554 aa		5.48	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	FAH	P16930	419 aa		5.48	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	IL11	P20809	199 aa		5.48	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	CCT4	P50991	539 aa	Known RBP	5.48	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	CCR9	P51686	369 aa		5.48	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	ROM1	Q03395	351 aa		5.48	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	CR1L	Q2VPA4	569 aa		5.48	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	CD300LD	Q6UXZ3	194 aa		5.48	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	HSCB	Q8IWL3	235 aa		5.48	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	CDYL2	Q8N8U2	506 aa		5.48	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	SCAMP5	Q8TAC9	235 aa		5.48	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF384	Q8TF68	577 aa		5.48	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	SLC38A3	Q99624	504 aa		5.48	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	PRPF18	Q99633	342 aa	Known RBP	5.48	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	PITHD1	Q9GZP4	211 aa	Predicted RBP	5.48	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	MRPL46	Q9H2W6	279 aa	Known RBP	5.48	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	PRDM8	Q9NQV8	689 aa		5.48	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	SLTM	Q9NWH9	1034 aa	Known RBP eCLIP	5.48	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	HSPBP1	Q9NZL4	362 aa		5.48	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	LPAR3	Q9UBY5	353 aa		5.48	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	TRPC5	Q9UL62	973 aa	Predicted RBP	5.48	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF711	Q9Y462	761 aa		5.48	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	HS3ST4	Q9Y661	456 aa		5.48	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	CRB1	P82279	1406 aa		5.48	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	FAM208A	Q9UK61	1670 aa	Known RBP	5.48	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	TNKS1BP1	Q9C0C2	1729 aa	Known RBP	5.48	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	PEAK1	Q9H792	1746 aa		5.48	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	BTN3A1	O00481	513 aa		5.48	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	NFIB	O00712	420 aa		5.48	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	FCHO1	O14526	889 aa		5.48	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	FSBP	O95073	299 aa		5.48	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	TK1	P04183	234 aa		5.48	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	CLTB	P09497	229 aa		5.48	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	HDC	P19113	662 aa		5.48	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	RXRA	P19793	462 aa		5.48	□□□□□ -1.53

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