RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP26.15■■□□□ 1.78
CAPNS1-215ENST00000628018 RASGEF1CQ8N431 466 aa26.15■■□□□ 1.78
CAPNS1-215ENST00000628018 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa26.15■■□□□ 1.78
CAPNS1-215ENST00000628018 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP26.15■■□□□ 1.78
CAPNS1-215ENST00000628018 USTQ9Y2C2 406 aa26.15■■□□□ 1.78
CAPNS1-215ENST00000628018 TKTL1P51854 596 aa26.14■■□□□ 1.78
CAPNS1-215ENST00000628018 TAS2R40P59535 323 aa26.14■■□□□ 1.78
CAPNS1-215ENST00000628018 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP26.14■■□□□ 1.78
CAPNS1-215ENST00000628018 ACAP1Q15027 740 aa26.14■■□□□ 1.78
CAPNS1-215ENST00000628018 CCDC181Q5TID7 509 aa26.14■■□□□ 1.78
CAPNS1-215ENST00000628018 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP26.14■■□□□ 1.78
CAPNS1-215ENST00000628018 HERVK_113Q902F9 699 aa26.14■■□□□ 1.78
CAPNS1-215ENST00000628018 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP26.14■■□□□ 1.78
CAPNS1-215ENST00000628018 PNPLA8Q9NP80 782 aa26.14■■□□□ 1.78
CAPNS1-215ENST00000628018 CHST7Q9NS84 486 aa26.14■■□□□ 1.78
CAPNS1-215ENST00000628018 EHD2Q9NZN4 543 aa26.14■■□□□ 1.78
CAPNS1-215ENST00000628018 CTAGE15A4D2H0 777 aa26.14■■□□□ 1.77
CAPNS1-215ENST00000628018 CTIFO43310 598 aaKnown RBP26.14■■□□□ 1.77
CAPNS1-215ENST00000628018 CEP104O60308 925 aa26.14■■□□□ 1.77
CAPNS1-215ENST00000628018 TADA3O75528 432 aa26.14■■□□□ 1.77
CAPNS1-215ENST00000628018 GRAP2O75791 330 aa26.14■■□□□ 1.77
CAPNS1-215ENST00000628018 CTAGE8P0CG41 777 aa26.14■■□□□ 1.77
CAPNS1-215ENST00000628018 GPD1P21695 349 aa26.14■■□□□ 1.77
CAPNS1-215ENST00000628018 FLT3P36888 993 aa26.14■■□□□ 1.77
CAPNS1-215ENST00000628018 PAFAH1B1P43034 410 aa26.14■■□□□ 1.77
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP26.14■■□□□ 1.77
CAPNS1-215ENST00000628018 RABGGTBP53611 331 aa26.14■■□□□ 1.77
CAPNS1-215ENST00000628018 EFHC1Q5JVL4 640 aa26.14■■□□□ 1.77
CAPNS1-215ENST00000628018 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP26.14■■□□□ 1.77
CAPNS1-215ENST00000628018 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa26.14■■□□□ 1.77
CAPNS1-215ENST00000628018 CTAGE6Q86UF2 777 aa26.14■■□□□ 1.77
CAPNS1-215ENST00000628018 CTAGE4Q8IX94 777 aa26.14■■□□□ 1.77
CAPNS1-215ENST00000628018 RHOT1Q8IXI2 618 aa26.14■■□□□ 1.77
CAPNS1-215ENST00000628018 ACTRT1Q8TDG2 376 aa26.14■■□□□ 1.77
CAPNS1-215ENST00000628018 RXFP2Q8WXD0 754 aa26.14■■□□□ 1.77
CAPNS1-215ENST00000628018 PSTPIP1O43586 416 aa26.13■■□□□ 1.77
CAPNS1-215ENST00000628018 PDGFRAP16234 1089 aa26.13■■□□□ 1.77
CAPNS1-215ENST00000628018 CYP2F1P24903 491 aa26.13■■□□□ 1.77
CAPNS1-215ENST00000628018 NDUFV1P49821 464 aa26.13■■□□□ 1.77
CAPNS1-215ENST00000628018 RWDD2BP57060 319 aa26.13■■□□□ 1.77
CAPNS1-215ENST00000628018 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP26.13■■□□□ 1.77
CAPNS1-215ENST00000628018 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa26.13■■□□□ 1.77
CAPNS1-215ENST00000628018 TMEM169Q96HH4 297 aa26.13■■□□□ 1.77
CAPNS1-215ENST00000628018 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa26.13■■□□□ 1.77
CAPNS1-215ENST00000628018 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa26.13■■□□□ 1.77
CAPNS1-215ENST00000628018 SPG21Q9NZD8 308 aa26.13■■□□□ 1.77
CAPNS1-215ENST00000628018 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP26.13■■□□□ 1.77
CAPNS1-215ENST00000628018 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP26.13■■□□□ 1.77
CAPNS1-215ENST00000628018 KIAA1671Q9BY89 1806 aa26.13■■□□□ 1.77
CAPNS1-215ENST00000628018 PATJQ8NI35 1801 aa26.12■■□□□ 1.77
CAPNS1-215ENST00000628018 EFCAB8A8MWE9 144 aa26.12■■□□□ 1.77
CAPNS1-215ENST00000628018 DPYSL4O14531 572 aa26.12■■□□□ 1.77
CAPNS1-215ENST00000628018 FBXO21O94952 628 aa26.12■■□□□ 1.77
CAPNS1-215ENST00000628018 SOD2P04179 222 aa26.12■■□□□ 1.77
CAPNS1-215ENST00000628018 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP26.12■■□□□ 1.77
CAPNS1-215ENST00000628018 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa26.12■■□□□ 1.77
CAPNS1-215ENST00000628018 PIK3R5Q8WYR1 880 aa26.12■■□□□ 1.77
CAPNS1-215ENST00000628018 CNPY3Q9BT09 278 aa26.12■■□□□ 1.77
CAPNS1-215ENST00000628018 CNGB3Q9NQW8 809 aa26.12■■□□□ 1.77
CAPNS1-215ENST00000628018 ASNSD1Q9NWL6 643 aa26.12■■□□□ 1.77
CAPNS1-215ENST00000628018 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP26.12■■□□□ 1.77
CAPNS1-215ENST00000628018 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa26.12■■□□□ 1.77
CAPNS1-215ENST00000628018 UQCRHLA0A096LP55 91 aa26.11■■□□□ 1.77
CAPNS1-215ENST00000628018 UQCRHP07919 91 aa26.11■■□□□ 1.77
CAPNS1-215ENST00000628018 ITIH3Q06033 890 aa26.11■■□□□ 1.77
CAPNS1-215ENST00000628018 GPR17Q13304 367 aa26.11■■□□□ 1.77
CAPNS1-215ENST00000628018 LRRC38Q5VT99 294 aa26.11■■□□□ 1.77
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC9A7Q96T83 725 aa26.11■■□□□ 1.77
CAPNS1-215ENST00000628018 ULBP1Q9BZM6 244 aa26.11■■□□□ 1.77
CAPNS1-215ENST00000628018 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP26.11■■□□□ 1.77
CAPNS1-215ENST00000628018 MTRRQ9UBK8 725 aa26.11■■□□□ 1.77
CAPNS1-215ENST00000628018 INSL6Q9Y581 213 aa26.11■■□□□ 1.77
CAPNS1-215ENST00000628018 BACE2Q9Y5Z0 518 aa26.11■■□□□ 1.77
CAPNS1-215ENST00000628018 LRCH4O75427 683 aa26.1■■□□□ 1.77
CAPNS1-215ENST00000628018 LINC00271P0C7V0 271 aa26.1■■□□□ 1.77
CAPNS1-215ENST00000628018 TCF4P15884 667 aa26.1■■□□□ 1.77
CAPNS1-215ENST00000628018 DAOAP59103 153 aa26.1■■□□□ 1.77
CAPNS1-215ENST00000628018 SMARCB1Q12824 385 aa26.1■■□□□ 1.77
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
CAPNS1-215ENST00000628018 CCDC14Q49A88 953 aa26.1■■□□□ 1.77
CAPNS1-215ENST00000628018 VSTM1Q6UX27 236 aa26.1■■□□□ 1.77
CAPNS1-215ENST00000628018 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa26.1■■□□□ 1.77
CAPNS1-215ENST00000628018 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
CAPNS1-215ENST00000628018 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
CAPNS1-215ENST00000628018 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
CAPNS1-215ENST00000628018 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa26.1■■□□□ 1.77
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa26.1■■□□□ 1.77
CAPNS1-215ENST00000628018 HSF2BPO75031 334 aa26.09■■□□□ 1.77
CAPNS1-215ENST00000628018 GLI1P08151 1106 aa26.09■■□□□ 1.77
CAPNS1-215ENST00000628018 PYGMP11217 842 aa26.09■■□□□ 1.77
CAPNS1-215ENST00000628018 CPB1P15086 417 aa26.09■■□□□ 1.77
CAPNS1-215ENST00000628018 GRIK1P39086 918 aa26.09■■□□□ 1.77
CAPNS1-215ENST00000628018 SSR1P43307 286 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
CAPNS1-215ENST00000628018 MAGEA11P43364 429 aa26.09■■□□□ 1.77
CAPNS1-215ENST00000628018 PSMD5Q16401 504 aa26.09■■□□□ 1.77
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC8B1Q6J4K2 584 aa26.09■■□□□ 1.77
CAPNS1-215ENST00000628018 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
CAPNS1-215ENST00000628018 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
CAPNS1-215ENST00000628018 HERC6Q8IVU3 1022 aa26.09■■□□□ 1.77
CAPNS1-215ENST00000628018 SCML4Q8N228 414 aa26.09■■□□□ 1.77
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