RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000599560.5

NUP62-216, Transcript of nucleoporin 62, human

TSL 2

Gene NUP62, Length 562 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NUP62-216	ENST00000599560	HLA-B	Q31612	363 aa		13.02	□□□□□ -0.33
NUP62-216	ENST00000599560	LY6G5C	Q5SRR4	150 aa		13.02	□□□□□ -0.33
NUP62-216	ENST00000599560	SLC39A4	Q6P5W5	647 aa		13.02	□□□□□ -0.33
NUP62-216	ENST00000599560	OSTM1	Q86WC4	334 aa		13.02	□□□□□ -0.33
NUP62-216	ENST00000599560	METTL23	Q86XA0	190 aa		13.02	□□□□□ -0.33
NUP62-216	ENST00000599560	DCP1B	Q8IZD4	617 aa	Known RBP	13.02	□□□□□ -0.33
NUP62-216	ENST00000599560	FAM84A	Q96KN4	292 aa		13.02	□□□□□ -0.33
NUP62-216	ENST00000599560	CLMP	Q9H6B4	373 aa		13.02	□□□□□ -0.33
NUP62-216	ENST00000599560	RPF1	Q9H9Y2	349 aa	Known RBP	13.02	□□□□□ -0.33
NUP62-216	ENST00000599560	GTF3C4	Q9UKN8	822 aa		13.02	□□□□□ -0.33
NUP62-216	ENST00000599560	DSE	Q9UL01	958 aa		13.02	□□□□□ -0.33
NUP62-216	ENST00000599560	RAD54B	Q9Y620	910 aa		13.02	□□□□□ -0.33
NUP62-216	ENST00000599560	TRIM66	O15016	1216 aa		13.01	□□□□□ -0.33
NUP62-216	ENST00000599560	PFKFB2	O60825	505 aa		13.01	□□□□□ -0.33
NUP62-216	ENST00000599560	ADH5	P11766	374 aa		13.01	□□□□□ -0.33
NUP62-216	ENST00000599560	MUT	P22033	750 aa		13.01	□□□□□ -0.33
NUP62-216	ENST00000599560	CDC25A	P30304	524 aa		13.01	□□□□□ -0.33
NUP62-216	ENST00000599560	EIF2D	P41214	584 aa	Known RBP	13.01	□□□□□ -0.33
NUP62-216	ENST00000599560	SEMG2	Q02383	582 aa		13.01	□□□□□ -0.33
NUP62-216	ENST00000599560	PDIA5	Q14554	519 aa		13.01	□□□□□ -0.33
NUP62-216	ENST00000599560	ETFBKMT	Q8IXQ9	262 aa		13.01	□□□□□ -0.33
NUP62-216	ENST00000599560	GALNT15	Q8N3T1	639 aa		13.01	□□□□□ -0.33
NUP62-216	ENST00000599560	C4orf32	Q8N8J7	132 aa		13.01	□□□□□ -0.33
NUP62-216	ENST00000599560	IPO4	Q8TEX9	1081 aa	Known RBP	13.01	□□□□□ -0.33
NUP62-216	ENST00000599560	SPIRE2	Q8WWL2	714 aa		13.01	□□□□□ -0.33
NUP62-216	ENST00000599560	DRC1	Q96MC2	740 aa		13.01	□□□□□ -0.33
NUP62-216	ENST00000599560	TRIM9	Q9C026	710 aa		13.01	□□□□□ -0.33
NUP62-216	ENST00000599560	CCSER1	Q9C0I3	900 aa		13.01	□□□□□ -0.33
NUP62-216	ENST00000599560	FAM124B	Q9H5Z6	455 aa	Predicted RBP	13.01	□□□□□ -0.33
NUP62-216	ENST00000599560	GMIP	Q9P107	970 aa		13.01	□□□□□ -0.33
NUP62-216	ENST00000599560	CPSF3	Q9UKF6	684 aa	Known RBP	13.01	□□□□□ -0.33
NUP62-216	ENST00000599560	CPQ	Q9Y646	472 aa		13.01	□□□□□ -0.33
NUP62-216	ENST00000599560	CYP46A1	Q9Y6A2	500 aa		13.01	□□□□□ -0.33
NUP62-216	ENST00000599560	DOPEY2	Q9Y3R5	2298 aa		13	□□□□□ -0.33
NUP62-216	ENST00000599560	NPHP3-ACAD11	A0A0J9YXS1	232 aa		13	□□□□□ -0.33
NUP62-216	ENST00000599560		A0A1B0GTW7	788 aa		13	□□□□□ -0.33
NUP62-216	ENST00000599560	TBC1D3B	A6NDS4	549 aa		13	□□□□□ -0.33
NUP62-216	ENST00000599560	TISP43	B9A030	160 aa		13	□□□□□ -0.33
NUP62-216	ENST00000599560	OGT	O15294	1046 aa		13	□□□□□ -0.33
NUP62-216	ENST00000599560	XPOT	O43592	962 aa	Known RBP	13	□□□□□ -0.33
NUP62-216	ENST00000599560	CDKL5	O76039	1030 aa		13	□□□□□ -0.33
NUP62-216	ENST00000599560	ZNF883	P0CG24	379 aa		13	□□□□□ -0.33
NUP62-216	ENST00000599560	HLA-E	P13747	358 aa		13	□□□□□ -0.33
NUP62-216	ENST00000599560	TAF6	P49848	677 aa		13	□□□□□ -0.33
NUP62-216	ENST00000599560	TMEM132D	Q14C87	1099 aa		13	□□□□□ -0.33
NUP62-216	ENST00000599560	C10orf76	Q5T2E6	689 aa		13	□□□□□ -0.33
NUP62-216	ENST00000599560	FMNL3	Q8IVF7	1028 aa		13	□□□□□ -0.33
NUP62-216	ENST00000599560	SCN4B	Q8IWT1	228 aa		13	□□□□□ -0.33
NUP62-216	ENST00000599560	PDCL2	Q8N4E4	241 aa		13	□□□□□ -0.33
NUP62-216	ENST00000599560	FAM181A	Q8N9Y4	354 aa		13	□□□□□ -0.33
NUP62-216	ENST00000599560	LEO1	Q8WVC0	666 aa	Predicted RBP	13	□□□□□ -0.33
NUP62-216	ENST00000599560	DNASE2B	Q8WZ79	361 aa		13	□□□□□ -0.33
NUP62-216	ENST00000599560	WBP2	Q969T9	261 aa		13	□□□□□ -0.33
NUP62-216	ENST00000599560	MRGPRX1	Q96LB2	322 aa		13	□□□□□ -0.33
NUP62-216	ENST00000599560	MIR1-1HG	Q9H1L0	117 aa		13	□□□□□ -0.33
NUP62-216	ENST00000599560	CFAP97	Q9P2B7	532 aa		13	□□□□□ -0.33
NUP62-216	ENST00000599560	SUSD2	Q9UGT4	822 aa		13	□□□□□ -0.33
NUP62-216	ENST00000599560	L1RE1	Q9UN81	338 aa		13	□□□□□ -0.33
NUP62-216	ENST00000599560	KPNA7	A9QM74	516 aa		12.99	□□□□□ -0.33
NUP62-216	ENST00000599560	KCNJ18	B7U540	433 aa		12.99	□□□□□ -0.33
NUP62-216	ENST00000599560	WASH3P	C4AMC7	463 aa		12.99	□□□□□ -0.33
NUP62-216	ENST00000599560	KCNK3	O14649	394 aa		12.99	□□□□□ -0.33
NUP62-216	ENST00000599560	ATP2C2	O75185	946 aa		12.99	□□□□□ -0.33
NUP62-216	ENST00000599560	NDUFS2	O75306	463 aa		12.99	□□□□□ -0.33
NUP62-216	ENST00000599560	TULP3	O75386	442 aa		12.99	□□□□□ -0.33
NUP62-216	ENST00000599560	PLS3	P13797	630 aa		12.99	□□□□□ -0.33
NUP62-216	ENST00000599560	GNS	P15586	552 aa		12.99	□□□□□ -0.33
NUP62-216	ENST00000599560	NTSR1	P30989	418 aa		12.99	□□□□□ -0.33
NUP62-216	ENST00000599560	MATK	P42679	507 aa		12.99	□□□□□ -0.33
NUP62-216	ENST00000599560	ACOT2	P49753	483 aa		12.99	□□□□□ -0.33
NUP62-216	ENST00000599560	WNT7B	P56706	349 aa		12.99	□□□□□ -0.33
NUP62-216	ENST00000599560	RPL10A	P62906	217 aa	Known RBP	12.99	□□□□□ -0.33
NUP62-216	ENST00000599560	SLC7A9	P82251	487 aa		12.99	□□□□□ -0.33
NUP62-216	ENST00000599560	INTS6L	Q5JSJ4	861 aa	Known RBP	12.99	□□□□□ -0.33
NUP62-216	ENST00000599560	HAUS3	Q68CZ6	603 aa		12.99	□□□□□ -0.33
NUP62-216	ENST00000599560	GPR155	Q7Z3F1	870 aa		12.99	□□□□□ -0.33
NUP62-216	ENST00000599560	NECAB1	Q8N987	351 aa		12.99	□□□□□ -0.33
NUP62-216	ENST00000599560	C1orf216	Q8TAB5	229 aa		12.99	□□□□□ -0.33
NUP62-216	ENST00000599560	SNX29	Q8TEQ0	813 aa		12.99	□□□□□ -0.33
NUP62-216	ENST00000599560	BICD1	Q96G01	975 aa		12.99	□□□□□ -0.33
NUP62-216	ENST00000599560	CDC6	Q99741	560 aa		12.99	□□□□□ -0.33
NUP62-216	ENST00000599560	ZDHHC5	Q9C0B5	715 aa		12.99	□□□□□ -0.33
NUP62-216	ENST00000599560	IKZF4	Q9H2S9	585 aa		12.99	□□□□□ -0.33
NUP62-216	ENST00000599560	C17orf75	Q9HAS0	396 aa		12.99	□□□□□ -0.33
NUP62-216	ENST00000599560	BRMS1	Q9HCU9	246 aa		12.99	□□□□□ -0.33
NUP62-216	ENST00000599560	ABCB6	Q9NP58	842 aa		12.99	□□□□□ -0.33
NUP62-216	ENST00000599560	PDRG1	Q9NUG6	133 aa		12.99	□□□□□ -0.33
NUP62-216	ENST00000599560	DPP3	Q9NY33	737 aa		12.99	□□□□□ -0.33
NUP62-216	ENST00000599560	DACH1	Q9UI36	760 aa		12.99	□□□□□ -0.33
NUP62-216	ENST00000599560	PIEZO2	Q9H5I5	2752 aa		12.99	□□□□□ -0.33
NUP62-216	ENST00000599560		A0A0B4J269	797 aa		12.98	□□□□□ -0.33
NUP62-216	ENST00000599560	TEX51	A0A1B0GUA7	166 aa		12.98	□□□□□ -0.33
NUP62-216	ENST00000599560		A0A1B0GVT2	93 aa		12.98	□□□□□ -0.33
NUP62-216	ENST00000599560	MEI4	A8MW99	385 aa		12.98	□□□□□ -0.33
NUP62-216	ENST00000599560	CBX4	O00257	560 aa		12.98	□□□□□ -0.33
NUP62-216	ENST00000599560	CAPN9	O14815	690 aa		12.98	□□□□□ -0.33
NUP62-216	ENST00000599560	FLRT2	O43155	660 aa		12.98	□□□□□ -0.33
NUP62-216	ENST00000599560	JAK2	O60674	1132 aa		12.98	□□□□□ -0.33
NUP62-216	ENST00000599560	ZNF217	O75362	1048 aa		12.98	□□□□□ -0.33
NUP62-216	ENST00000599560	OLFM2	O95897	454 aa		12.98	□□□□□ -0.33

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