RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589631.5

GIPC1-211, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

TSL 3

Gene GIPC1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-211ENST00000589631 DGKKQ5KSL6 1271 aa21.42■■□□□ 1.02
GIPC1-211ENST00000589631 FBXL13Q8NEE6 735 aa21.42■■□□□ 1.02
GIPC1-211ENST00000589631 PDZD8Q8NEN9 1154 aa21.42■■□□□ 1.02
GIPC1-211ENST00000589631 EBF3Q9H4W6 596 aa21.42■■□□□ 1.02
GIPC1-211ENST00000589631 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa21.42■■□□□ 1.02
GIPC1-211ENST00000589631 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
GIPC1-211ENST00000589631 HMGXB4Q9UGU5 601 aa21.42■■□□□ 1.02
GIPC1-211ENST00000589631 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
GIPC1-211ENST00000589631 AP1G2O75843 785 aa21.41■■□□□ 1.02
GIPC1-211ENST00000589631 OLFM2O95897 454 aa21.41■■□□□ 1.02
GIPC1-211ENST00000589631 MXI1P50539 228 aa21.41■■□□□ 1.02
GIPC1-211ENST00000589631 SLC7A9P82251 487 aa21.41■■□□□ 1.02
GIPC1-211ENST00000589631 AMPD2Q01433 879 aa21.41■■□□□ 1.02
GIPC1-211ENST00000589631 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
GIPC1-211ENST00000589631 TRIM68Q6AZZ1 485 aa21.41■■□□□ 1.02
GIPC1-211ENST00000589631 KIAA1958Q8N8K9 716 aa21.41■■□□□ 1.02
GIPC1-211ENST00000589631 SLC2A14Q8TDB8 520 aa21.41■■□□□ 1.02
GIPC1-211ENST00000589631 SH3RF2Q8TEC5 729 aa21.41■■□□□ 1.02
GIPC1-211ENST00000589631 OSCP1Q8WVF1 389 aa21.41■■□□□ 1.02
GIPC1-211ENST00000589631 NELL1Q92832 810 aa21.41■■□□□ 1.02
GIPC1-211ENST00000589631 NT5C1AQ9BXI3 368 aa21.41■■□□□ 1.02
GIPC1-211ENST00000589631 DNAI2Q9GZS0 605 aa21.41■■□□□ 1.02
GIPC1-211ENST00000589631 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP21.41■■□□□ 1.024e-8■■■■■ 174.9
GIPC1-211ENST00000589631 RAB20Q9NX57 234 aa21.41■■□□□ 1.02
GIPC1-211ENST00000589631 MAN1B1Q9UKM7 699 aa21.41■■□□□ 1.02
GIPC1-211ENST00000589631 R4GN57 208 aa21.41■■□□□ 1.02
GIPC1-211ENST00000589631 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
GIPC1-211ENST00000589631 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
GIPC1-211ENST00000589631 FAM92AA1XBS5 289 aa21.4■■□□□ 1.02
GIPC1-211ENST00000589631 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
GIPC1-211ENST00000589631 CILPO75339 1184 aa21.4■■□□□ 1.02
GIPC1-211ENST00000589631 OAS1P00973 400 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
GIPC1-211ENST00000589631 ORC1Q13415 861 aa21.4■■□□□ 1.02
GIPC1-211ENST00000589631 PON2Q15165 354 aa21.4■■□□□ 1.02
GIPC1-211ENST00000589631 SNX30Q5VWJ9 437 aa21.4■■□□□ 1.02
GIPC1-211ENST00000589631 SYNPOQ8N3V7 929 aa21.4■■□□□ 1.02
GIPC1-211ENST00000589631 TTC39CQ8N584 583 aa21.4■■□□□ 1.02
GIPC1-211ENST00000589631 C12orf29Q8N999 325 aa21.4■■□□□ 1.02
GIPC1-211ENST00000589631 ZMIZ2Q8NF64 920 aa21.4■■□□□ 1.02
GIPC1-211ENST00000589631 SEMA4DQ92854 862 aa21.4■■□□□ 1.02
GIPC1-211ENST00000589631 TWNKQ96RR1 684 aa21.4■■□□□ 1.02
GIPC1-211ENST00000589631 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
GIPC1-211ENST00000589631 SMOQ99835 787 aa21.4■■□□□ 1.02
GIPC1-211ENST00000589631 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
GIPC1-211ENST00000589631 RNF38Q9H0F5 515 aa21.4■■□□□ 1.02
GIPC1-211ENST00000589631 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
GIPC1-211ENST00000589631 KRT82Q9NSB4 513 aa21.4■■□□□ 1.02
GIPC1-211ENST00000589631 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
GIPC1-211ENST00000589631 COQ4Q9Y3A0 265 aa21.4■■□□□ 1.02
GIPC1-211ENST00000589631 FAM186AA6NE01 2351 aa21.4■■□□□ 1.02
GIPC1-211ENST00000589631 TRIM49BA6NDI0 452 aa21.39■■□□□ 1.01
GIPC1-211ENST00000589631 CCDC130P13994 396 aa21.39■■□□□ 1.01
GIPC1-211ENST00000589631 ARSAP15289 507 aa21.39■■□□□ 1.01
GIPC1-211ENST00000589631 CCR3P51677 355 aa21.39■■□□□ 1.01
GIPC1-211ENST00000589631 SLC5A3P53794 718 aa21.39■■□□□ 1.01
GIPC1-211ENST00000589631 CCINQ13939 588 aa21.39■■□□□ 1.01
GIPC1-211ENST00000589631 PPP2R5DQ14738 602 aa21.39■■□□□ 1.01
GIPC1-211ENST00000589631 WDR44Q5JSH3 913 aa21.39■■□□□ 1.01
GIPC1-211ENST00000589631 ISM2Q6H9L7 571 aa21.39■■□□□ 1.01
GIPC1-211ENST00000589631 FOXR2Q6PJQ5 311 aa21.39■■□□□ 1.01
GIPC1-211ENST00000589631 SPEM1Q8N4L4 309 aa21.39■■□□□ 1.01
GIPC1-211ENST00000589631 SCAMP5Q8TAC9 235 aa21.39■■□□□ 1.01
GIPC1-211ENST00000589631 WHAMMQ8TF30 809 aa21.39■■□□□ 1.01
GIPC1-211ENST00000589631 ATP2A3Q93084 1043 aa21.39■■□□□ 1.01
GIPC1-211ENST00000589631 FBXO32Q969P5 355 aa21.39■■□□□ 1.01
GIPC1-211ENST00000589631 CYFIP2Q96F07 1278 aa21.39■■□□□ 1.01
GIPC1-211ENST00000589631 CEP63Q96MT8 703 aa21.39■■□□□ 1.01
GIPC1-211ENST00000589631 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
GIPC1-211ENST00000589631 FAM49BQ9NUQ9 324 aa21.39■■□□□ 1.01
GIPC1-211ENST00000589631 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
GIPC1-211ENST00000589631 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa21.39■■□□□ 1.01
GIPC1-211ENST00000589631 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
GIPC1-211ENST00000589631 BEST1O76090 585 aa21.38■■□□□ 1.01
GIPC1-211ENST00000589631 ABL1P00519 1130 aa21.38■■□□□ 1.01
GIPC1-211ENST00000589631 CD44P16070 742 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
GIPC1-211ENST00000589631 IFNAR2P48551 515 aa21.38■■□□□ 1.01
GIPC1-211ENST00000589631 ZXDBP98169 803 aa21.38■■□□□ 1.01
GIPC1-211ENST00000589631 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
GIPC1-211ENST00000589631 MORC3Q14149 939 aa21.38■■□□□ 1.01
GIPC1-211ENST00000589631 GAS6Q14393 721 aa21.38■■□□□ 1.01
GIPC1-211ENST00000589631 TCERG1LQ5VWI1 586 aa21.38■■□□□ 1.01
GIPC1-211ENST00000589631 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa21.38■■□□□ 1.01
GIPC1-211ENST00000589631 CPA6Q8N4T0 437 aa21.38■■□□□ 1.01
GIPC1-211ENST00000589631 ZBTB44Q8NCP5 570 aa21.38■■□□□ 1.01
GIPC1-211ENST00000589631 FBXO44Q9H4M3 255 aa21.38■■□□□ 1.01
GIPC1-211ENST00000589631 ECT2Q9H8V3 914 aa21.38■■□□□ 1.01
GIPC1-211ENST00000589631 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
GIPC1-211ENST00000589631 ZSCAN32Q9NX65 697 aa21.38■■□□□ 1.01
GIPC1-211ENST00000589631 CHMP5Q9NZZ3 219 aa21.38■■□□□ 1.01
GIPC1-211ENST00000589631 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
GIPC1-211ENST00000589631 LEFTY2O00292 366 aa21.37■■□□□ 1.01
GIPC1-211ENST00000589631 LMNAP02545 664 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
GIPC1-211ENST00000589631 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa21.37■■□□□ 1.01
GIPC1-211ENST00000589631 FAM200BP0CF97 657 aa21.37■■□□□ 1.01
GIPC1-211ENST00000589631 CD58P19256 250 aa21.37■■□□□ 1.01
GIPC1-211ENST00000589631 BMP6P22004 513 aa21.37■■□□□ 1.01
GIPC1-211ENST00000589631 CXCL12P48061 93 aa21.37■■□□□ 1.01
GIPC1-211ENST00000589631 MAP3K7CLP57077 242 aa21.37■■□□□ 1.01
GIPC1-211ENST00000589631 EML3Q32P44 896 aa21.37■■□□□ 1.01
GIPC1-211ENST00000589631 CBWD6Q4V339 395 aa21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.1 ms