RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574234.1

TRIM25-208, Transcript of tripartite motif containing 25, humanhuman

TSL 2

Gene TRIM25, Length 471 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25-208ENST00000574234 MAD2L2Q9UI95 211 aa5.71□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP5.71□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP5.71□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 SPEF1Q9Y4P9 236 aa5.71□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 SLC38A8A6NNN8 435 aa5.7□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 B4E1Z4 1266 aa5.7□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 E9PAM4 449 aa5.7□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 LINC01387J3KSC0 135 aa5.7□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 GABRDO14764 452 aa5.7□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 OPA1O60313 960 aa5.7□□□□□ -1.5
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TRIM25-208ENST00000574234 RFPL1O75677 317 aa5.7□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 LDHAP00338 332 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 POMCP01189 267 aa5.7□□□□□ -1.5
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TRIM25-208ENST00000574234 FTH1P19P0C7X4 201 aa5.7□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 BPIP17213 487 aa5.7□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 CEBPBP17676 345 aa5.7□□□□□ -1.5
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TRIM25-208ENST00000574234 RPL17P18621 184 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
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TRIM25-208ENST00000574234 HOXD12P35452 270 aa5.7□□□□□ -1.5
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TRIM25-208ENST00000574234 CLCN3P51790 818 aa5.7□□□□□ -1.5
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TRIM25-208ENST00000574234 MLC1Q15049 377 aa5.7□□□□□ -1.5
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TRIM25-208ENST00000574234 LONRF3Q496Y0 759 aa5.7□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 ANKRD39Q53RE8 183 aa5.7□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 COLEC12Q5KU26 742 aa5.7□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 ZBTB37Q5TC79 503 aa5.7□□□□□ -1.5
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TRIM25-208ENST00000574234 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa5.7□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa5.7□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 GLRX5Q86SX6 157 aa5.7□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 ZBTB46Q86UZ6 589 aa5.7□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 PHACTR4Q8IZ21 702 aa5.7□□□□□ -1.5
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TRIM25-208ENST00000574234 SPATA18Q8TC71 538 aa5.7□□□□□ -1.5
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TRIM25-208ENST00000574234 B3GALT6Q96L58 329 aa5.7□□□□□ -1.5
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TRIM25-208ENST00000574234 PIGSQ96S52 555 aa5.7□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 PI4K2AQ9BTU6 479 aa5.7□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 GPR62Q9BZJ7 368 aa5.7□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 LY9Q9HBG7 655 aa5.7□□□□□ -1.5
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TRIM25-208ENST00000574234 ADAM28Q9UKQ2 775 aa5.7□□□□□ -1.5
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TRIM25-208ENST00000574234 SALL3Q9BXA9 1300 aa5.7□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa5.69□□□□□ -1.5
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TRIM25-208ENST00000574234 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 NEMP1O14524 444 aa5.69□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 ZNF197O14709 1029 aa5.69□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 DCLK1O15075 740 aa5.69□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 FANCGO15287 622 aa5.69□□□□□ -1.5
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TRIM25-208ENST00000574234 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 PPP4R4Q6NUP7 873 aa5.69□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 SYT13Q7L8C5 426 aa5.69□□□□□ -1.5
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TRIM25-208ENST00000574234 ZNF410Q86VK4 478 aa5.69□□□□□ -1.5
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TRIM25-208ENST00000574234 HID1Q8IV36 788 aa5.69□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 SIRT2Q8IXJ6 389 aa5.69□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 CNTD1Q8N815 330 aa5.69□□□□□ -1.5
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