RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561991.5

PKD1-224, Transcript of polycystin 1, transient receptor potential channel interacting, human

TSL 5

Gene PKD1, Length 964 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PKD1-224	ENST00000561991	UBXN1	Q04323	297 aa		18.71	■□□□□ 0.59
PKD1-224	ENST00000561991	PDE4C	Q08493	712 aa		18.71	■□□□□ 0.59
PKD1-224	ENST00000561991	RAPGEF1	Q13905	1077 aa		18.71	■□□□□ 0.59
PKD1-224	ENST00000561991	SLC44A3	Q8N4M1	653 aa		18.71	■□□□□ 0.59
PKD1-224	ENST00000561991	ANKRD52	Q8NB46	1076 aa		18.71	■□□□□ 0.59
PKD1-224	ENST00000561991	NAP1L5	Q96NT1	182 aa	Predicted RBP	18.71	■□□□□ 0.59
PKD1-224	ENST00000561991	CYP2S1	Q96SQ9	504 aa		18.71	■□□□□ 0.59
PKD1-224	ENST00000561991	DNAI2	Q9GZS0	605 aa		18.71	■□□□□ 0.59
PKD1-224	ENST00000561991	TASP1	Q9H6P5	420 aa		18.71	■□□□□ 0.59
PKD1-224	ENST00000561991	TRPC7	Q9HCX4	862 aa		18.71	■□□□□ 0.59
PKD1-224	ENST00000561991	FAM207A	Q9NSI2	230 aa	Predicted RBP	18.71	■□□□□ 0.59
PKD1-224	ENST00000561991	IL37	Q9NZH6	218 aa		18.71	■□□□□ 0.59
PKD1-224	ENST00000561991	UXT	Q9UBK9	157 aa	Predicted RBP	18.71	■□□□□ 0.59
PKD1-224	ENST00000561991	WDR3	Q9UNX4	943 aa	Known RBP eCLIP	18.71	■□□□□ 0.59
PKD1-224	ENST00000561991	NCOR1	O75376	2440 aa		18.71	■□□□□ 0.59
PKD1-224	ENST00000561991	ZNF840P	A6NDX5	716 aa		18.7	■□□□□ 0.58
PKD1-224	ENST00000561991	PI4K2B	G5E9Z4	385 aa		18.7	■□□□□ 0.58
PKD1-224	ENST00000561991	CYP26A1	O43174	497 aa		18.7	■□□□□ 0.58
PKD1-224	ENST00000561991	DCX	O43602	365 aa		18.7	■□□□□ 0.58
PKD1-224	ENST00000561991	YWHAQ	P27348	245 aa		18.7	■□□□□ 0.58
PKD1-224	ENST00000561991	DRAP1	Q14919	205 aa	Predicted RBP	18.7	■□□□□ 0.58
PKD1-224	ENST00000561991	PKDCC	Q504Y2	493 aa		18.7	■□□□□ 0.58
PKD1-224	ENST00000561991	ARHGAP15	Q53QZ3	475 aa		18.7	■□□□□ 0.58
PKD1-224	ENST00000561991	LRSAM1	Q6UWE0	723 aa		18.7	■□□□□ 0.58
PKD1-224	ENST00000561991	LCLAT1	Q6UWP7	414 aa		18.7	■□□□□ 0.58
PKD1-224	ENST00000561991	PIGZ	Q86VD9	579 aa		18.7	■□□□□ 0.58
PKD1-224	ENST00000561991	ARID3B	Q8IVW6	561 aa	Predicted RBP	18.7	■□□□□ 0.58
PKD1-224	ENST00000561991	SMARCD2	Q92925	531 aa		18.7	■□□□□ 0.58
PKD1-224	ENST00000561991	FBXO32	Q969P5	355 aa		18.7	■□□□□ 0.58
PKD1-224	ENST00000561991	LRRC3B	Q96PB8	259 aa		18.7	■□□□□ 0.58
PKD1-224	ENST00000561991	PLCB1	Q9NQ66	1216 aa		18.7	■□□□□ 0.58
PKD1-224	ENST00000561991	GMIP	Q9P107	970 aa		18.7	■□□□□ 0.58
PKD1-224	ENST00000561991	IGSF9	Q9P2J2	1179 aa		18.7	■□□□□ 0.58
PKD1-224	ENST00000561991	CHORDC1	Q9UHD1	332 aa	Predicted RBP	18.7	■□□□□ 0.58
PKD1-224	ENST00000561991	KIAA1257	Q9ULG3	409 aa		18.7	■□□□□ 0.58
PKD1-224	ENST00000561991	SORCS3	Q9UPU3	1222 aa		18.7	■□□□□ 0.58
PKD1-224	ENST00000561991	ANAPC1	Q9H1A4	1944 aa		18.7	■□□□□ 0.58
PKD1-224	ENST00000561991	MYO16	Q9Y6X6	1858 aa		18.69	■□□□□ 0.58
PKD1-224	ENST00000561991	RTN3	O95197	1032 aa	Predicted RBP	18.69	■□□□□ 0.58
PKD1-224	ENST00000561991	ABL1	P00519	1130 aa		18.69	■□□□□ 0.58
PKD1-224	ENST00000561991	CLCN1	P35523	988 aa		18.69	■□□□□ 0.58
PKD1-224	ENST00000561991	ZXDA	P98168	799 aa		18.69	■□□□□ 0.58
PKD1-224	ENST00000561991	TDG	Q13569	410 aa		18.69	■□□□□ 0.58
PKD1-224	ENST00000561991	GRM2	Q14416	872 aa		18.69	■□□□□ 0.58
PKD1-224	ENST00000561991	CNGA2	Q16280	664 aa		18.69	■□□□□ 0.58
PKD1-224	ENST00000561991	DENND1B	Q6P3S1	775 aa		18.69	■□□□□ 0.58
PKD1-224	ENST00000561991	VIT	Q6UXI7	678 aa		18.69	■□□□□ 0.58
PKD1-224	ENST00000561991	MTSS1L	Q765P7	747 aa		18.69	■□□□□ 0.58
PKD1-224	ENST00000561991	RIN3	Q8TB24	985 aa		18.69	■□□□□ 0.58
PKD1-224	ENST00000561991	MRPS31	Q92665	395 aa	Known RBP	18.69	■□□□□ 0.58
PKD1-224	ENST00000561991	SECISBP2L	Q93073	1101 aa	Known RBP	18.69	■□□□□ 0.58
PKD1-224	ENST00000561991	FAM81B	Q96LP2	452 aa		18.69	■□□□□ 0.58
PKD1-224	ENST00000561991	TSPY26P	Q9H489	355 aa		18.69	■□□□□ 0.58
PKD1-224	ENST00000561991	RTN4	Q9NQC3	1192 aa	Known RBP	18.69	■□□□□ 0.58
PKD1-224	ENST00000561991	CCL26	Q9Y258	94 aa		18.69	■□□□□ 0.58
PKD1-224	ENST00000561991	CUL9	Q8IWT3	2517 aa		18.68	■□□□□ 0.58
PKD1-224	ENST00000561991	FAM92A	A1XBS5	289 aa		18.68	■□□□□ 0.58
PKD1-224	ENST00000561991		M0QYV0	167 aa		18.68	■□□□□ 0.58
PKD1-224	ENST00000561991	GABBR2	O75899	941 aa		18.68	■□□□□ 0.58
PKD1-224	ENST00000561991	GNA15	P30679	374 aa		18.68	■□□□□ 0.58
PKD1-224	ENST00000561991	KIF11	P52732	1056 aa		18.68	■□□□□ 0.58
PKD1-224	ENST00000561991	BCAT1	P54687	386 aa		18.68	■□□□□ 0.58
PKD1-224	ENST00000561991	POLR2F	P61218	127 aa	Known RBP	18.68	■□□□□ 0.58
PKD1-224	ENST00000561991	BST2	Q10589	180 aa	Known RBP	18.68	■□□□□ 0.58
PKD1-224	ENST00000561991	SLC47A2	Q86VL8	602 aa		18.68	■□□□□ 0.58
PKD1-224	ENST00000561991	MON1A	Q86VX9	555 aa		18.68	■□□□□ 0.58
PKD1-224	ENST00000561991	CMTM8	Q8IZV2	173 aa		18.68	■□□□□ 0.58
PKD1-224	ENST00000561991	ARL14EP	Q8N8R7	260 aa	Predicted RBP	18.68	■□□□□ 0.58
PKD1-224	ENST00000561991	NDRG1	Q92597	394 aa	Known RBP	18.68	■□□□□ 0.58
PKD1-224	ENST00000561991	ELSPBP1	Q96BH3	223 aa		18.68	■□□□□ 0.58
PKD1-224	ENST00000561991	PCMTD1	Q96MG8	357 aa	Predicted RBP	18.68	■□□□□ 0.58
PKD1-224	ENST00000561991	TRPV4	Q9HBA0	871 aa		18.68	■□□□□ 0.58
PKD1-224	ENST00000561991	ZFP14	Q9HCL3	533 aa		18.68	■□□□□ 0.58
PKD1-224	ENST00000561991	PNPLA8	Q9NP80	782 aa		18.68	■□□□□ 0.58
PKD1-224	ENST00000561991	NLRC4	Q9NPP4	1024 aa		18.68	■□□□□ 0.58
PKD1-224	ENST00000561991	TRPM5	Q9NZQ8	1165 aa		18.68	■□□□□ 0.58
PKD1-224	ENST00000561991	HESX1	Q9UBX0	185 aa		18.68	■□□□□ 0.58
PKD1-224	ENST00000561991	NUP210	Q8TEM1	1887 aa	Predicted RBP	18.68	■□□□□ 0.58
PKD1-224	ENST00000561991	COL4A3	Q01955	1670 aa		18.67	■□□□□ 0.58
PKD1-224	ENST00000561991		A0A1B0GTH6	734 aa		18.67	■□□□□ 0.58
PKD1-224	ENST00000561991	HEPACAM2	A8MVW5	462 aa		18.67	■□□□□ 0.58
PKD1-224	ENST00000561991		F8VZ95	297 aa		18.67	■□□□□ 0.58
PKD1-224	ENST00000561991	PIK3R2	O00459	728 aa		18.67	■□□□□ 0.58
PKD1-224	ENST00000561991	XPO1	O14980	1071 aa	Known RBP	18.67	■□□□□ 0.58
PKD1-224	ENST00000561991	THAP12	O43422	761 aa		18.67	■□□□□ 0.58
PKD1-224	ENST00000561991	ECI2	O75521	394 aa		18.67	■□□□□ 0.58
PKD1-224	ENST00000561991	RGS7	P49802	495 aa		18.67	■□□□□ 0.58
PKD1-224	ENST00000561991	GPC5	P78333	572 aa		18.67	■□□□□ 0.58
PKD1-224	ENST00000561991	FANCC	Q00597	558 aa		18.67	■□□□□ 0.58
PKD1-224	ENST00000561991	RAB41	Q5JT25	222 aa		18.67	■□□□□ 0.58
PKD1-224	ENST00000561991	IER5L	Q5T953	404 aa		18.67	■□□□□ 0.58
PKD1-224	ENST00000561991	FAM71A	Q8IYT1	594 aa		18.67	■□□□□ 0.58
PKD1-224	ENST00000561991	RNF214	Q8ND24	703 aa		18.67	■□□□□ 0.58
PKD1-224	ENST00000561991	ZNF606	Q8WXB4	792 aa		18.67	■□□□□ 0.58
PKD1-224	ENST00000561991	EDA	Q92838	391 aa		18.67	■□□□□ 0.58
PKD1-224	ENST00000561991	USP13	Q92995	863 aa	Predicted RBP	18.67	■□□□□ 0.58
PKD1-224	ENST00000561991	SLITRK1	Q96PX8	696 aa		18.67	■□□□□ 0.58
PKD1-224	ENST00000561991	ERGIC2	Q96RQ1	377 aa		18.67	■□□□□ 0.58
PKD1-224	ENST00000561991	RNF38	Q9H0F5	515 aa		18.67	■□□□□ 0.58
PKD1-224	ENST00000561991	NMUR1	Q9HB89	426 aa		18.67	■□□□□ 0.58

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.4 ms