RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560725.1

TMOD3-208, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 4

Gene TMOD3, Length 544 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-208ENST00000560725 GCC1Q96CN9 775 aa6.87□□□□□ -1.31
TMOD3-208ENST00000560725 C18orf8Q96DM3 657 aa6.87□□□□□ -1.31
TMOD3-208ENST00000560725 SNX27Q96L92 541 aa6.87□□□□□ -1.31
TMOD3-208ENST00000560725 TMEM8AQ9HCN3 771 aa6.87□□□□□ -1.31
TMOD3-208ENST00000560725 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa6.87□□□□□ -1.31
TMOD3-208ENST00000560725 ETAA1Q9NY74 926 aa6.87□□□□□ -1.31
TMOD3-208ENST00000560725 TERF2IPQ9NYB0 399 aa6.87□□□□□ -1.31
TMOD3-208ENST00000560725 DACT1Q9NYF0 836 aa6.87□□□□□ -1.31
TMOD3-208ENST00000560725 SHOC2Q9UQ13 582 aa6.87□□□□□ -1.31
TMOD3-208ENST00000560725 CDYLQ9Y232 598 aa6.87□□□□□ -1.31
TMOD3-208ENST00000560725 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa6.87□□□□□ -1.31
TMOD3-208ENST00000560725 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa6.86□□□□□ -1.31
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TMOD3-208ENST00000560725 NPC1O15118 1278 aa6.86□□□□□ -1.31
TMOD3-208ENST00000560725 FCER1AP12319 257 aa6.86□□□□□ -1.31
TMOD3-208ENST00000560725 GABRB3P28472 473 aa6.86□□□□□ -1.31
TMOD3-208ENST00000560725 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
TMOD3-208ENST00000560725 PPFIA1Q13136 1202 aa6.86□□□□□ -1.31
TMOD3-208ENST00000560725 ARHGEF7Q14155 803 aa6.86□□□□□ -1.31
TMOD3-208ENST00000560725 SPARCL1Q14515 664 aa6.86□□□□□ -1.31
TMOD3-208ENST00000560725 IQCB1Q15051 598 aa6.86□□□□□ -1.31
TMOD3-208ENST00000560725 RALBP1Q15311 655 aa6.86□□□□□ -1.31
TMOD3-208ENST00000560725 RAB30Q15771 203 aa6.86□□□□□ -1.31
TMOD3-208ENST00000560725 NOMO2Q5JPE7 1267 aa6.86□□□□□ -1.31
TMOD3-208ENST00000560725 RRAGBQ5VZM2 374 aa6.86□□□□□ -1.31
TMOD3-208ENST00000560725 RFX8Q6ZV50 586 aa6.86□□□□□ -1.31
TMOD3-208ENST00000560725 POLNQ7Z5Q5 900 aa6.86□□□□□ -1.31
TMOD3-208ENST00000560725 RHOT2Q8IXI1 618 aa6.86□□□□□ -1.31
TMOD3-208ENST00000560725 CFAP52Q8N1V2 620 aa6.86□□□□□ -1.31
TMOD3-208ENST00000560725 PAF1Q8N7H5 531 aa6.86□□□□□ -1.31
TMOD3-208ENST00000560725 FAM71BQ8TC56 605 aa6.86□□□□□ -1.31
TMOD3-208ENST00000560725 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa6.86□□□□□ -1.31
TMOD3-208ENST00000560725 PNKPQ96T60 521 aa6.86□□□□□ -1.31
TMOD3-208ENST00000560725 MESP1Q9BRJ9 268 aa6.86□□□□□ -1.31
TMOD3-208ENST00000560725 PAGR1Q9BTK6 254 aa6.86□□□□□ -1.31
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TMOD3-208ENST00000560725 OBP2BQ9NPH6 170 aa6.86□□□□□ -1.31
TMOD3-208ENST00000560725 TBC1D23Q9NUY8 699 aa6.86□□□□□ -1.31
TMOD3-208ENST00000560725 RGL1Q9NZL6 768 aa6.86□□□□□ -1.31
TMOD3-208ENST00000560725 LRFN1Q9P244 771 aa6.86□□□□□ -1.31
TMOD3-208ENST00000560725 ANAPC4Q9UJX5 808 aa6.86□□□□□ -1.31
TMOD3-208ENST00000560725 CAPN11Q9UMQ6 739 aa6.86□□□□□ -1.31
TMOD3-208ENST00000560725 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
TMOD3-208ENST00000560725 LGALS16A8MUM7 142 aa6.85□□□□□ -1.31
TMOD3-208ENST00000560725 ACKR2O00590 384 aa6.85□□□□□ -1.31
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TMOD3-208ENST00000560725 NDST3O95803 873 aa6.85□□□□□ -1.31
TMOD3-208ENST00000560725 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
TMOD3-208ENST00000560725 SERPINF1P36955 418 aa6.85□□□□□ -1.31
TMOD3-208ENST00000560725 CPT1AP50416 773 aa6.85□□□□□ -1.31
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TMOD3-208ENST00000560725 PTK2BQ14289 1009 aa6.85□□□□□ -1.31
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TMOD3-208ENST00000560725 TAPT1Q6NXT6 567 aa6.85□□□□□ -1.31
TMOD3-208ENST00000560725 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa6.85□□□□□ -1.31
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TMOD3-208ENST00000560725 SLC46A1Q96NT5 459 aa6.85□□□□□ -1.31
TMOD3-208ENST00000560725 GNRHR2Q96P88 292 aa6.85□□□□□ -1.31
TMOD3-208ENST00000560725 TRIB1Q96RU8 372 aa6.85□□□□□ -1.31
TMOD3-208ENST00000560725 MAF1Q9H063 256 aa6.85□□□□□ -1.31
TMOD3-208ENST00000560725 MAGEH1Q9H213 219 aa6.85□□□□□ -1.31
TMOD3-208ENST00000560725 FAM83DQ9H4H8 585 aa6.85□□□□□ -1.31
TMOD3-208ENST00000560725 NEU2Q9Y3R4 380 aa6.85□□□□□ -1.31
TMOD3-208ENST00000560725 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
TMOD3-208ENST00000560725 NINLQ9Y2I6 1382 aa6.84□□□□□ -1.31
TMOD3-208ENST00000560725 QRICH2Q9H0J4 1663 aa6.84□□□□□ -1.31
TMOD3-208ENST00000560725 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa6.84□□□□□ -1.31
TMOD3-208ENST00000560725 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa6.84□□□□□ -1.31
TMOD3-208ENST00000560725 AQP7P3A6NL99 342 aa6.84□□□□□ -1.31
TMOD3-208ENST00000560725 DIRC3C9JPN6 131 aa6.84□□□□□ -1.31
TMOD3-208ENST00000560725 RAB27BO00194 218 aa6.84□□□□□ -1.31
TMOD3-208ENST00000560725 TRIM13O60858 407 aa6.84□□□□□ -1.31
TMOD3-208ENST00000560725 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
TMOD3-208ENST00000560725 TPH1P17752 444 aa6.84□□□□□ -1.31
TMOD3-208ENST00000560725 EGR1P18146 543 aa6.84□□□□□ -1.31
TMOD3-208ENST00000560725 HK1P19367 917 aa6.84□□□□□ -1.31
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TMOD3-208ENST00000560725 TXNRD1Q16881 649 aa6.84□□□□□ -1.31
TMOD3-208ENST00000560725 PLA1AQ53H76 456 aa6.84□□□□□ -1.31
TMOD3-208ENST00000560725 CCDC70Q6NSX1 233 aa6.84□□□□□ -1.31
TMOD3-208ENST00000560725 LAYNQ6UX15 382 aa6.84□□□□□ -1.31
TMOD3-208ENST00000560725 HTR3DQ70Z44 454 aa6.84□□□□□ -1.31
TMOD3-208ENST00000560725 FUKQ8N0W3 1084 aa6.84□□□□□ -1.31
TMOD3-208ENST00000560725 GLIS1Q8NBF1 620 aa6.84□□□□□ -1.31
TMOD3-208ENST00000560725 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
TMOD3-208ENST00000560725 TOX2Q96NM4 488 aa6.84□□□□□ -1.31
TMOD3-208ENST00000560725 MED15Q96RN5 788 aa6.84□□□□□ -1.31
TMOD3-208ENST00000560725 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP6.84□□□□□ -1.31
TMOD3-208ENST00000560725 RNPEPQ9H4A4 650 aa6.84□□□□□ -1.31
TMOD3-208ENST00000560725 GRHPRQ9UBQ7 328 aa6.84□□□□□ -1.31
TMOD3-208ENST00000560725 PGAP2Q9UHJ9 254 aa6.84□□□□□ -1.31
TMOD3-208ENST00000560725 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
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