RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552295.5

BEST3-211, Transcript of bestrophin 3, humanhuman

TSL 5

Gene BEST3, Length 720 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST3-211ENST00000552295 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
BEST3-211ENST00000552295 COQ4Q9Y3A0 265 aa8.67□□□□□ -1.02
BEST3-211ENST00000552295 TTC3P53804 2025 aa8.66□□□□□ -1.02
BEST3-211ENST00000552295 PTPRSQ13332 1948 aa8.66□□□□□ -1.02
BEST3-211ENST00000552295 DNAH12Q6ZR08 3092 aa8.66□□□□□ -1.02
BEST3-211ENST00000552295 ENPP3O14638 875 aa8.66□□□□□ -1.02
BEST3-211ENST00000552295 EPHB6O15197 1021 aa8.66□□□□□ -1.02
BEST3-211ENST00000552295 FANCGO15287 622 aa8.66□□□□□ -1.02
BEST3-211ENST00000552295 LRRN2O75325 713 aa8.66□□□□□ -1.02
BEST3-211ENST00000552295 VNN1O95497 513 aa8.66□□□□□ -1.02
BEST3-211ENST00000552295 ITGA4P13612 1032 aa8.66□□□□□ -1.02
BEST3-211ENST00000552295 RAG1P15918 1043 aa8.66□□□□□ -1.02
BEST3-211ENST00000552295 SLC9A1P19634 815 aa8.66□□□□□ -1.02
BEST3-211ENST00000552295 PON1P27169 355 aa8.66□□□□□ -1.02
BEST3-211ENST00000552295 NTF4P34130 210 aa8.66□□□□□ -1.02
BEST3-211ENST00000552295 RAP1GAPP47736 663 aa8.66□□□□□ -1.02
BEST3-211ENST00000552295 AP3M2P53677 418 aa8.66□□□□□ -1.02
BEST3-211ENST00000552295 FAM189BP81408 668 aa8.66□□□□□ -1.02
BEST3-211ENST00000552295 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
BEST3-211ENST00000552295 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
BEST3-211ENST00000552295 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP8.66□□□□□ -1.02
BEST3-211ENST00000552295 MFSD5Q6N075 450 aa8.66□□□□□ -1.02
BEST3-211ENST00000552295 TRIM65Q6PJ69 517 aa8.66□□□□□ -1.02
BEST3-211ENST00000552295 AGMOQ6ZNB7 445 aa8.66□□□□□ -1.02
BEST3-211ENST00000552295 SLC24A5Q71RS6 500 aa8.66□□□□□ -1.02
BEST3-211ENST00000552295 UBE3DQ7Z6J8 389 aa8.66□□□□□ -1.02
BEST3-211ENST00000552295 DEFB128Q7Z7B8 93 aa8.66□□□□□ -1.02
BEST3-211ENST00000552295 NT5DC4Q86YG4 428 aa8.66□□□□□ -1.02
BEST3-211ENST00000552295 DRC7Q8IY82 874 aa8.66□□□□□ -1.02
BEST3-211ENST00000552295 HACE1Q8IYU2 909 aa8.66□□□□□ -1.02
BEST3-211ENST00000552295 SPC24Q8NBT2 197 aa8.66□□□□□ -1.02
BEST3-211ENST00000552295 KCT2Q8NC54 265 aa8.66□□□□□ -1.02
BEST3-211ENST00000552295 TAS1R2Q8TE23 839 aa8.66□□□□□ -1.02
BEST3-211ENST00000552295 SEMA4DQ92854 862 aa8.66□□□□□ -1.02
BEST3-211ENST00000552295 LPPQ93052 612 aa8.66□□□□□ -1.02
BEST3-211ENST00000552295 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
BEST3-211ENST00000552295 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
BEST3-211ENST00000552295 TTYH3Q9C0H2 523 aa8.66□□□□□ -1.02
BEST3-211ENST00000552295 MTMR12Q9C0I1 747 aa8.66□□□□□ -1.02
BEST3-211ENST00000552295 GANQ9H2C0 597 aa8.66□□□□□ -1.02
BEST3-211ENST00000552295 SIX2Q9NPC8 291 aa8.66□□□□□ -1.02
BEST3-211ENST00000552295 PLCB1Q9NQ66 1216 aa8.66□□□□□ -1.02
BEST3-211ENST00000552295 C1orf112Q9NSG2 853 aa8.66□□□□□ -1.02
BEST3-211ENST00000552295 LMCD1Q9NZU5 365 aa8.66□□□□□ -1.02
BEST3-211ENST00000552295 GCNT4Q9P109 453 aa8.66□□□□□ -1.02
BEST3-211ENST00000552295 PARP2Q9UGN5 583 aa8.66□□□□□ -1.02
BEST3-211ENST00000552295 DERAQ9Y315 318 aa8.66□□□□□ -1.02
BEST3-211ENST00000552295 C2CD2Q9Y426 696 aa8.66□□□□□ -1.02
BEST3-211ENST00000552295 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
BEST3-211ENST00000552295 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa8.65□□□□□ -1.02
BEST3-211ENST00000552295 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
BEST3-211ENST00000552295 PTGESO14684 152 aa8.65□□□□□ -1.02
BEST3-211ENST00000552295 NOL4O94818 638 aa8.65□□□□□ -1.02
BEST3-211ENST00000552295 HLA-DRAP01903 254 aa8.65□□□□□ -1.02
BEST3-211ENST00000552295 TNNC2P02585 160 aa8.65□□□□□ -1.02
BEST3-211ENST00000552295 GYPCP04921 128 aa8.65□□□□□ -1.02
BEST3-211ENST00000552295 TMEM191BP0C7N4 346 aa8.65□□□□□ -1.02
BEST3-211ENST00000552295 ACTN1P12814 892 aa8.65□□□□□ -1.02
BEST3-211ENST00000552295 KCNE1P15382 129 aa8.65□□□□□ -1.02
BEST3-211ENST00000552295 CSF2RAP15509 400 aa8.65□□□□□ -1.02
BEST3-211ENST00000552295 MLH1P40692 756 aa8.65□□□□□ -1.02
BEST3-211ENST00000552295 APBA1Q02410 837 aa8.65□□□□□ -1.02
BEST3-211ENST00000552295 TMEM132DQ14C87 1099 aa8.65□□□□□ -1.02
BEST3-211ENST00000552295 ZBTB6Q15916 424 aa8.65□□□□□ -1.02
BEST3-211ENST00000552295 EXOC3L4Q17RC7 722 aa8.65□□□□□ -1.02
BEST3-211ENST00000552295 FIGNQ5HY92 759 aa8.65□□□□□ -1.02
BEST3-211ENST00000552295 GLRA4Q5JXX5 417 aa8.65□□□□□ -1.02
BEST3-211ENST00000552295 ZBTB37Q5TC79 503 aa8.65□□□□□ -1.02
BEST3-211ENST00000552295 SCARA3Q6AZY7 606 aa8.65□□□□□ -1.02
BEST3-211ENST00000552295 CNKSR3Q6P9H4 555 aa8.65□□□□□ -1.02
BEST3-211ENST00000552295 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa8.65□□□□□ -1.02
BEST3-211ENST00000552295 TMC7Q7Z402 723 aa8.65□□□□□ -1.02
BEST3-211ENST00000552295 C12orf40Q86WS4 652 aa8.65□□□□□ -1.02
BEST3-211ENST00000552295 C7orf61Q8IZ16 206 aa8.65□□□□□ -1.02
BEST3-211ENST00000552295 GSTCDQ8NEC7 633 aa8.65□□□□□ -1.02
BEST3-211ENST00000552295 FBXL13Q8NEE6 735 aa8.65□□□□□ -1.02
BEST3-211ENST00000552295 CXorf38Q8TB03 319 aa8.65□□□□□ -1.02
BEST3-211ENST00000552295 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa8.65□□□□□ -1.02
BEST3-211ENST00000552295 PGBD4Q96DM1 585 aa8.65□□□□□ -1.02
BEST3-211ENST00000552295 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
BEST3-211ENST00000552295 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa8.65□□□□□ -1.02
BEST3-211ENST00000552295 TSPAN18Q96SJ8 248 aa8.65□□□□□ -1.02
BEST3-211ENST00000552295 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
BEST3-211ENST00000552295 FOXQ1Q9C009 403 aa8.65□□□□□ -1.02
BEST3-211ENST00000552295 CEP44Q9C0F1 390 aa8.65□□□□□ -1.02
BEST3-211ENST00000552295 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
BEST3-211ENST00000552295 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
BEST3-211ENST00000552295 RNF19AQ9NV58 838 aa8.65□□□□□ -1.02
BEST3-211ENST00000552295 IMPACTQ9P2X3 320 aa8.65□□□□□ -1.02
BEST3-211ENST00000552295 GIT1Q9Y2X7 761 aa8.65□□□□□ -1.02
BEST3-211ENST00000552295 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP8.65□□□□□ -1.02
BEST3-211ENST00000552295 SCN1AP35498 2009 aa8.64□□□□□ -1.03
BEST3-211ENST00000552295 ARL5CA6NH57 179 aa8.64□□□□□ -1.03
BEST3-211ENST00000552295 INPPL1O15357 1258 aa8.64□□□□□ -1.03
BEST3-211ENST00000552295 EOMESO95936 686 aa8.64□□□□□ -1.03
BEST3-211ENST00000552295 CST3P01034 146 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
BEST3-211ENST00000552295 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
BEST3-211ENST00000552295 PIK3CAP42336 1068 aa8.64□□□□□ -1.03
BEST3-211ENST00000552295 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP8.64□□□□□ -1.03
BEST3-211ENST00000552295 GUCY2FP51841 1108 aa8.64□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.5 ms