RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547188.1

PRDM4-202, Transcript of PR/SET domain 4, humanhuman

TSL 3

Gene PRDM4, Length 640 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM4-202ENST00000547188 ADH5P11766 374 aa25.25■■□□□ 1.63
PRDM4-202ENST00000547188 MATKP42679 507 aa25.25■■□□□ 1.63
PRDM4-202ENST00000547188 TSPY1Q01534 308 aa25.25■■□□□ 1.63
PRDM4-202ENST00000547188 KCNC4Q03721 635 aa25.25■■□□□ 1.63
PRDM4-202ENST00000547188 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa25.25■■□□□ 1.63
PRDM4-202ENST00000547188 HLA-BQ31612 363 aa25.25■■□□□ 1.63
PRDM4-202ENST00000547188 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
PRDM4-202ENST00000547188 NAT16Q8N8M0 369 aa25.25■■□□□ 1.63
PRDM4-202ENST00000547188 FOXJ1Q92949 421 aa25.25■■□□□ 1.63
PRDM4-202ENST00000547188 SMPD4Q9NXE4 827 aa25.25■■□□□ 1.63
PRDM4-202ENST00000547188 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa25.25■■□□□ 1.63
PRDM4-202ENST00000547188 MYLKQ15746 1914 aa25.24■■□□□ 1.63
PRDM4-202ENST00000547188 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa25.24■■□□□ 1.63
PRDM4-202ENST00000547188 MEI4A8MW99 385 aa25.24■■□□□ 1.63
PRDM4-202ENST00000547188 FLRT2O43155 660 aa25.24■■□□□ 1.63
PRDM4-202ENST00000547188 FAM189A1O60320 539 aa25.24■■□□□ 1.63
PRDM4-202ENST00000547188 CER1O95813 267 aa25.24■■□□□ 1.63
PRDM4-202ENST00000547188 OR52Z1P0C646 297 aa25.24■■□□□ 1.63
PRDM4-202ENST00000547188 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
PRDM4-202ENST00000547188 TAF6P49848 677 aa25.24■■□□□ 1.63
PRDM4-202ENST00000547188 MYO1EQ12965 1108 aa25.24■■□□□ 1.63
PRDM4-202ENST00000547188 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
PRDM4-202ENST00000547188 RINT1Q6NUQ1 792 aa25.24■■□□□ 1.63
PRDM4-202ENST00000547188 DBX2Q6ZNG2 339 aa25.24■■□□□ 1.63
PRDM4-202ENST00000547188 SCN4BQ8IWT1 228 aa25.24■■□□□ 1.63
PRDM4-202ENST00000547188 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
PRDM4-202ENST00000547188 ADRB2P07550 413 aa25.23■■□□□ 1.63
PRDM4-202ENST00000547188 FDPSP14324 419 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
PRDM4-202ENST00000547188 CLDN6P56747 220 aa25.23■■□□□ 1.63
PRDM4-202ENST00000547188 TMEM132DQ14C87 1099 aa25.23■■□□□ 1.63
PRDM4-202ENST00000547188 C10orf76Q5T2E6 689 aa25.23■■□□□ 1.63
PRDM4-202ENST00000547188 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
PRDM4-202ENST00000547188 FAM181AQ8N9Y4 354 aa25.23■■□□□ 1.63
PRDM4-202ENST00000547188 ACOX2Q99424 681 aa25.23■■□□□ 1.63
PRDM4-202ENST00000547188 RNF38Q9H0F5 515 aa25.23■■□□□ 1.63
PRDM4-202ENST00000547188 CPQQ9Y646 472 aa25.23■■□□□ 1.63
PRDM4-202ENST00000547188 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
PRDM4-202ENST00000547188 CAPN8A6NHC0 703 aa25.22■■□□□ 1.63
PRDM4-202ENST00000547188 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
PRDM4-202ENST00000547188 RRP8O43159 456 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
PRDM4-202ENST00000547188 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
PRDM4-202ENST00000547188 ADH1CP00326 375 aa25.22■■□□□ 1.63
PRDM4-202ENST00000547188 NTSR1P30989 418 aa25.22■■□□□ 1.63
PRDM4-202ENST00000547188 ZNF174Q15697 407 aa25.22■■□□□ 1.63
PRDM4-202ENST00000547188 LY6G5CQ5SRR4 150 aa25.22■■□□□ 1.63
PRDM4-202ENST00000547188 C1orf186Q6ZWK4 172 aa25.22■■□□□ 1.63
PRDM4-202ENST00000547188 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
PRDM4-202ENST00000547188 NXPE2Q96DL1 559 aa25.22■■□□□ 1.63
PRDM4-202ENST00000547188 TSPAN18Q96SJ8 248 aa25.22■■□□□ 1.63
PRDM4-202ENST00000547188 ARID3AQ99856 593 aa25.22■■□□□ 1.63
PRDM4-202ENST00000547188 C17orf75Q9HAS0 396 aa25.22■■□□□ 1.63
PRDM4-202ENST00000547188 CD248Q9HCU0 757 aa25.22■■□□□ 1.63
PRDM4-202ENST00000547188 GTF3C4Q9UKN8 822 aa25.22■■□□□ 1.63
PRDM4-202ENST00000547188 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
PRDM4-202ENST00000547188 E9PAM4 449 aa25.21■■□□□ 1.63
PRDM4-202ENST00000547188 TRIM24O15164 1050 aa25.21■■□□□ 1.63
PRDM4-202ENST00000547188 PDIA5Q14554 519 aa25.21■■□□□ 1.63
PRDM4-202ENST00000547188 PTPRNQ16849 979 aa25.21■■□□□ 1.63
PRDM4-202ENST00000547188 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
PRDM4-202ENST00000547188 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa25.21■■□□□ 1.63
PRDM4-202ENST00000547188 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
PRDM4-202ENST00000547188 SPIRE2Q8WWL2 714 aa25.21■■□□□ 1.63
PRDM4-202ENST00000547188 WASF1Q92558 559 aa25.21■■□□□ 1.63
PRDM4-202ENST00000547188 CFAP97Q9P2B7 532 aa25.21■■□□□ 1.63
PRDM4-202ENST00000547188 RAD54BQ9Y620 910 aa25.21■■□□□ 1.63
PRDM4-202ENST00000547188 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
PRDM4-202ENST00000547188 OGTO15294 1046 aa25.2■■□□□ 1.62
PRDM4-202ENST00000547188 TNFSF14O43557 240 aa25.2■■□□□ 1.62
PRDM4-202ENST00000547188 PDE6CP51160 858 aa25.2■■□□□ 1.62
PRDM4-202ENST00000547188 CXADRP78310 365 aa25.2■■□□□ 1.62
PRDM4-202ENST00000547188 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
PRDM4-202ENST00000547188 DNASE2BQ8WZ79 361 aa25.2■■□□□ 1.62
PRDM4-202ENST00000547188 ABCB6Q9NP58 842 aa25.2■■□□□ 1.62
PRDM4-202ENST00000547188 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa25.2■■□□□ 1.62
PRDM4-202ENST00000547188 AK5Q9Y6K8 562 aa25.2■■□□□ 1.62
PRDM4-202ENST00000547188 KPNA7A9QM74 516 aa25.19■■□□□ 1.62
PRDM4-202ENST00000547188 SMTNP53814 917 aa25.19■■□□□ 1.62
PRDM4-202ENST00000547188 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP25.19■■□□□ 1.62
PRDM4-202ENST00000547188 KYAT1Q16773 422 aa25.19■■□□□ 1.62
PRDM4-202ENST00000547188 KCNV2Q8TDN2 545 aa25.19■■□□□ 1.62
PRDM4-202ENST00000547188 SNX29Q8TEQ0 813 aa25.19■■□□□ 1.62
PRDM4-202ENST00000547188 SEMA4CQ9C0C4 833 aa25.19■■□□□ 1.62
PRDM4-202ENST00000547188 CCSER1Q9C0I3 900 aa25.19■■□□□ 1.62
PRDM4-202ENST00000547188 DPP3Q9NY33 737 aa25.19■■□□□ 1.62
PRDM4-202ENST00000547188 LRWD1Q9UFC0 647 aa25.19■■□□□ 1.62
PRDM4-202ENST00000547188 DNM3Q9UQ16 869 aa25.19■■□□□ 1.62
PRDM4-202ENST00000547188 HCRTO43612 131 aa25.18■■□□□ 1.62
PRDM4-202ENST00000547188 TULP3O75386 442 aa25.18■■□□□ 1.62
PRDM4-202ENST00000547188 PLS3P13797 630 aa25.18■■□□□ 1.62
PRDM4-202ENST00000547188 LIG4P49917 911 aa25.18■■□□□ 1.62
PRDM4-202ENST00000547188 USP46P62068 366 aa25.18■■□□□ 1.62
PRDM4-202ENST00000547188 SLC7A9P82251 487 aa25.18■■□□□ 1.62
PRDM4-202ENST00000547188 CD302Q8IX05 232 aa25.18■■□□□ 1.62
PRDM4-202ENST00000547188 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa25.18■■□□□ 1.62
PRDM4-202ENST00000547188 MRGPRX1Q96LB2 322 aa25.18■■□□□ 1.62
PRDM4-202ENST00000547188 PKMYT1Q99640 499 aa25.18■■□□□ 1.62
PRDM4-202ENST00000547188 GPR174Q9BXC1 333 aa25.18■■□□□ 1.62
PRDM4-202ENST00000547188 PDRG1Q9NUG6 133 aa25.18■■□□□ 1.62
PRDM4-202ENST00000547188 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
PRDM4-202ENST00000547188 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.5 ms