RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546160.5

PDE4D-226, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PDE4D, Length 7,690 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-226ENST00000546160 CHRM3P20309 590 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 FGFR4P22455 802 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 PON1P27169 355 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 BST2Q10589 180 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 DMC1Q14565 340 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 GRAMD4Q6IC98 578 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 DPF2Q92785 391 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 FAM162AQ96A26 154 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 TMEM176AQ96HP8 235 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 CLPBQ9H078 707 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 RIOX1Q9H6W3 641 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 KANSL1LA0AUZ9 987 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 SDR42E2A6NKP2 422 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 PHF20L1A8MW92 1017 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 PDHXO00330 501 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 VPS26AO75436 327 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 KLRC1P26715 233 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 CCR1P32246 355 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 PGM1P36871 562 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 MAGEA4P43358 317 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 RXRGP48443 463 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 TMEM86AQ8N2M4 240 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 DPF3Q92784 378 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 CHST12Q9NRB3 414 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 RAD18Q9NS91 495 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 WWOXQ9NZC7 414 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 SPASTQ9UBP0 616 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 GTF3C4Q9UKN8 822 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 DYRK1BQ9Y463 629 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 NR2E3Q9Y5X4 410 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 H3BRB1 525 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 CST8O60676 142 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 CYP11B1P15538 503 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 BRD2P25440 801 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 HERVK_113P62684 666 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 LRRC74AQ0VAA2 488 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 CUL3Q13618 768 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 C16orf72Q14CZ0 275 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 KIZQ2M2Z5 673 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 DACH2Q96NX9 599 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 MTMR12Q9C0I1 747 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 MAN1C1Q9NR34 630 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 AHSPQ9NZD4 102 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 COMTP21964 271 aa6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 AP1ARQ63HQ0 302 aa6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 LZTR1Q8N653 840 aa6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 OTULINQ96BN8 352 aa6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 PRRG3Q9BZD7 231 aa6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 ELOVL4Q9GZR5 314 aa6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 CCDC90BQ9GZT6 254 aa6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 EPC1Q9H2F5 836 aa6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 LRRC40Q9H9A6 602 aa6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 RRAGCQ9HB90 399 aa6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 SYTL2Q9HCH5 934 aa6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 TMEM39AQ9NV64 488 aa6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 ADAM21Q9UKJ8 722 aa6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 BCL9O00512 1426 aa6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 ADGRA2Q96PE1 1338 aa6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 CKMP06732 381 aa6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 PGK2P07205 417 aa6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 TUFMP49411 452 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 GRIK4Q16099 956 aa6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 PPP4R4Q6NUP7 873 aa6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 SPATA21Q7Z572 469 aa6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 EXD1Q8NHP7 514 aa6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 MS4A14Q96JA4 679 aa6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 CHP1Q99653 195 aa6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 SCN3BQ9NY72 215 aa6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 RGPD1P0DJD0 1748 aa6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 NCK2O43639 380 aa6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 GLRA3O75311 464 aa6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 FBXO47Q5MNV8 452 aa6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 ISCUQ9H1K1 167 aa6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 RBP3P10745 1247 aa6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 KLRC2P26717 231 aa6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 AVPR1AP37288 418 aa6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 FKBP1BP68106 108 aa6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 STARD3Q14849 445 aa6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 FAM117BQ6P1L5 589 aa6.62□□□□□ -1.35
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