RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540109.5

PTPRD-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PTPRD, Length 6,210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-214ENST00000540109 P4HA1P13674 534 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 ATP6V1C1P21283 382 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 KRT20P35900 424 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 GTF2BQ00403 316 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 XRCC4Q13426 336 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 PLS1Q14651 629 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 HGSNATQ68CP4 663 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 JADE1Q6IE81 842 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 C16orf89Q6UX73 402 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP6.29□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 PALB2Q86YC2 1186 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 XXYLT1Q8NBI6 393 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 STK32AQ8WU08 396 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 HDAC7Q8WUI4 952 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 HPS1Q92902 700 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 PGM2Q96G03 612 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 FAM167AQ96KS9 214 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 TMEM237Q96Q45 408 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 CITED4Q96RK1 184 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 FNBP1Q96RU3 617 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 ADAM33Q9BZ11 813 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 GRIP2Q9C0E4 1043 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 PXMP2Q9NR77 195 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 GAS2O43903 313 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 DGAT1O75907 488 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP6.29□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 FCGR1AP12314 374 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 S100A5P33763 92 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 RPL5P46777 297 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 FMO5P49326 533 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 AP3M2P53677 418 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 NCKAP1LP55160 1127 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP6.29□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 ADAM17P78536 824 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 PGM5Q15124 567 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 MICALL2Q8IY33 904 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 ATP8B4Q8TF62 1192 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 ACAP3Q96P50 834 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 PDCD2LQ9BRP1 358 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 FAM8A1Q9UBU6 413 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 DNAJB4Q9UDY4 337 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 B2RBV5 119 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 CRCPO75575 148 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 BAIAP3O94812 1187 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 PGM3O95394 542 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 APOA4P06727 396 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 MYL4P12829 197 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 IL12AP29459 219 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 LRPAP1P30533 357 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 SOX5P35711 763 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 JAM2P57087 298 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 CYP4A11Q02928 519 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 BFSP1Q12934 665 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 KYNUQ16719 465 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 CASC4Q6P4E1 433 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 GPC2Q8N158 579 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 DLG3Q92796 817 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 RXFP1Q9HBX9 757 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 RNF146Q9NTX7 359 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 NCANO14594 1321 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 VWA5AO00534 786 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 GPC4O75487 556 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 SLC4A1P02730 911 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 PON1P27169 355 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 ICAM3P32942 547 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 PTGS2P35354 604 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 HADHBP55084 474 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 WDR44Q5JSH3 913 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 ASZ1Q8WWH4 475 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 RMDN3Q96TC7 470 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 SPEF1Q9Y4P9 236 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 IPPQ9Y573 584 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 H3BRJ5 948 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 EML1O00423 815 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 GNGT2O14610 69 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 TMEM253P0C7T8 217 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 MYBP10242 640 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 NAT2P11245 290 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 VDRP11473 427 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 GARTP22102 1010 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 CDH3P22223 829 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 PTPN4P29074 926 aa6.29□□□□□ -1.4
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