RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530727.5

PTPRC-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 1,962 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-214ENST00000530727 FAM204AQ9H8W3 233 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-214ENST00000530727 KIAA1586Q9HCI6 787 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-214ENST00000530727 SRRDQ9UH36 339 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-214ENST00000530727 TPCN1Q9ULQ1 816 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-214ENST00000530727 LRCH1Q9Y2L9 728 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-214ENST00000530727 A0A1B0GVC2 190 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-214ENST00000530727 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-214ENST00000530727 FAM20BO75063 409 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-214ENST00000530727 CAPN3P20807 821 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-214ENST00000530727 ECHS1P30084 290 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-214ENST00000530727 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-214ENST00000530727 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-214ENST00000530727 ZBED6P86452 979 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-214ENST00000530727 HLFQ16534 295 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-214ENST00000530727 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-214ENST00000530727 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-214ENST00000530727 TTLL5Q6EMB2 1281 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-214ENST00000530727 TTC14Q96N46 770 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-214ENST00000530727 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-214ENST00000530727 ADI1Q9BV57 179 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-214ENST00000530727 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
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PTPRC-214ENST00000530727 ARFGAP3Q9NP61 516 aa4.73□□□□□ -1.65
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PTPRC-214ENST00000530727 CDC23Q9UJX2 597 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-214ENST00000530727 CLCA2Q9UQC9 943 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-214ENST00000530727 POLHQ9Y253 713 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-214ENST00000530727 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-214ENST00000530727 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-214ENST00000530727 UBR3Q6ZT12 1888 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-214ENST00000530727 SCN7AQ01118 1682 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-214ENST00000530727 CASZ1Q86V15 1759 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-214ENST00000530727 ADCY6O43306 1168 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-214ENST00000530727 CAMTA2O94983 1202 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-214ENST00000530727 RPN1P04843 607 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-214ENST00000530727 C4BP0C0L5 1744 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-214ENST00000530727 PTPN7P35236 360 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-214ENST00000530727 MTNR1BP49286 362 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-214ENST00000530727 PER3P56645 1201 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-214ENST00000530727 MALLQ13021 153 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-214ENST00000530727 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-214ENST00000530727 RABL3Q5HYI8 236 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-214ENST00000530727 METTL24Q5JXM2 366 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-214ENST00000530727 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-214ENST00000530727 TSHZ3Q63HK5 1081 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-214ENST00000530727 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-214ENST00000530727 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-214ENST00000530727 TLDC1Q6P9B6 456 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-214ENST00000530727 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-214ENST00000530727 ZNF34Q8IZ26 560 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-214ENST00000530727 OR52N2Q8NGI0 321 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-214ENST00000530727 TEKT5Q96M29 485 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-214ENST00000530727 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-214ENST00000530727 NELL2Q99435 816 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-214ENST00000530727 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-214ENST00000530727 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
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PTPRC-214ENST00000530727 DMRT3Q9NQL9 472 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-214ENST00000530727 RASSF1Q9NS23 344 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-214ENST00000530727 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-214ENST00000530727 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-214ENST00000530727 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-214ENST00000530727 TRPS1Q9UHF7 1281 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-214ENST00000530727 SORCS3Q9UPU3 1222 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-214ENST00000530727 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-214ENST00000530727 GPR45Q9Y5Y3 372 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-214ENST00000530727 LAMB2P55268 1798 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-214ENST00000530727 C4AP0C0L4 1744 aa4.71□□□□□ -1.65
PTPRC-214ENST00000530727 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.65
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PTPRC-214ENST00000530727 K7ENM7 598 aa4.71□□□□□ -1.66
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PTPRC-214ENST00000530727 HRGP04196 525 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 AKAP5P24588 427 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 MCM7P33993 719 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 BTKQ06187 659 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 ABHD18Q0P651 414 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 PPFIA1Q13136 1202 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 SEMA5AQ13591 1074 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 NOMO1Q15155 1222 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 BMP2KLQ5H9B9 411 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 ATAT1Q5SQI0 421 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 OVCH2Q7RTZ1 564 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 KRT27Q7Z3Y8 459 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 OR7D4Q8NG98 312 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 PPP1R35Q8TAP8 253 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 NELL1Q92832 810 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 TBC1D20Q96BZ9 403 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 RIPOR3Q96MK2 946 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 BHMT2Q9H2M3 363 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 BCO1Q9HAY6 547 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 SCOCQ9UIL1 159 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 COL24A1Q17RW2 1714 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 UBN2Q6ZU65 1347 aa4.71□□□□□ -1.66
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