RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517083.1

RNU6-548P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 548, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-548P, Length 115 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-548P-201ENST00000517083 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP2.14□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP2.14□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP2.14□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 LIME1Q9H400 295 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 ASF1BQ9NVP2 202 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP2.14□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 RTEL1Q9NZ71 1219 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 COL20A1Q9P218 1284 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP2.14□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP2.14□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 INSL5Q9Y5Q6 135 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 CDY1Q9Y6F8 540 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 MUC2Q02817 5179 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP2.13□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 CCDC187A0A096LP49 1063 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 ARHGEF37A1IGU5 675 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 FRMD3A2A2Y4 597 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 TBC1D3BA6NDS4 549 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 MEIS3P2A8K0S8 358 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP2.13□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP2.13□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 PLD2O14939 933 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 PIN1P1O15428 100 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 SRGAP3O43295 1099 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 TRAPPC3O43617 180 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 PRKAB2O43741 272 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP2.13□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 GPR32O75388 356 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 APPP05067 770 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 APODP05090 189 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 PRKCBP05771 671 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 P4HBP07237 508 aaKnown RBP2.13□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 POLR2MP0CAP2 368 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 FAM157CP0CG43 387 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 ACADMP11310 421 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 DARSP14868 501 aaKnown RBP2.13□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 LIFP15018 202 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 PDE6AP16499 860 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 GABRG2P18507 467 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 PDCP20941 246 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 FGFR4P22455 802 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 OXTRP30559 389 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 CIITAP33076 1130 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 CTSKP43235 329 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 ALDH1A3P47895 512 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 GRIA4P48058 902 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 ATP1A2P50993 1020 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 STAT5BP51692 787 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 EPHB3P54753 998 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 CDC42EP1Q00587 391 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP2.13□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 FUT2Q10981 343 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 TWF1Q12792 350 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 CDC20Q12834 499 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 TRAF1Q13077 416 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP2.13□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 PCOLCEQ15113 449 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 SYCP1Q15431 976 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP2.13□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 DEFB113Q30KQ7 82 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 CHRFAM7AQ494W8 412 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 SBK1Q52WX2 424 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP2.13□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 FAM160B1Q5W0V3 765 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 CTR9Q6PD62 1173 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 BTNL9Q6UXG8 535 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP2.13□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 ANKS3Q6ZW76 656 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 CHSY3Q70JA7 882 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 CATSPER4Q7RTX7 472 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP2.13□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 CAMKMTQ7Z624 323 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 DTX1Q86Y01 620 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 HIPK1Q86Z02 1210 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 MIER1Q8N108 512 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 C3orf56Q8N813 242 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 IL17RCQ8NAC3 791 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 CNNM3Q8NE01 707 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 CADM4Q8NFZ8 388 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZNF461Q8TAF7 563 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP2.13□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 SHKBP1Q8TBC3 707 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 MAPK15Q8TD08 544 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 HASPINQ8TF76 798 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 TBC1D5Q92609 795 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 ARRDC3Q96B67 414 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 MBD6Q96DN6 1003 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP2.13□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP2.13□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP2.13□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 DBNDD2Q9BQY9 259 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 SDF4Q9BRK5 362 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP2.13□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 TRAIPQ9BWF2 469 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP2.13□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.3 ms