RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
PTPRC-212ENST00000491302 TAF5Q15542 800 aa8.9□□□□□ -0.98
PTPRC-212ENST00000491302 TAF12Q16514 161 aa8.9□□□□□ -0.98
PTPRC-212ENST00000491302 ANKRD45Q5TZF3 282 aa8.9□□□□□ -0.98
PTPRC-212ENST00000491302 TEX19Q8NA77 164 aa8.9□□□□□ -0.98
PTPRC-212ENST00000491302 CHST13Q8NET6 341 aa8.9□□□□□ -0.98
PTPRC-212ENST00000491302 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
PTPRC-212ENST00000491302 UBXN10Q96LJ8 280 aa8.9□□□□□ -0.98
PTPRC-212ENST00000491302 RTKNQ9BST9 563 aa8.9□□□□□ -0.98
PTPRC-212ENST00000491302 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa8.9□□□□□ -0.98
PTPRC-212ENST00000491302 SERTAD3Q9UJW9 196 aa8.9□□□□□ -0.98
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PTPRC-212ENST00000491302 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa8.9□□□□□ -0.98
PTPRC-212ENST00000491302 CDKL5O76039 1030 aa8.89□□□□□ -0.99
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PTPRC-212ENST00000491302 ARP10275 920 aa8.89□□□□□ -0.99
PTPRC-212ENST00000491302 UQCRC1P31930 480 aa8.89□□□□□ -0.99
PTPRC-212ENST00000491302 MTHFSP49914 203 aa8.89□□□□□ -0.99
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PTPRC-212ENST00000491302 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa8.89□□□□□ -0.99
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PTPRC-212ENST00000491302 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
PTPRC-212ENST00000491302 TTC9BQ8N6N2 239 aa8.89□□□□□ -0.99
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PTPRC-212ENST00000491302 WDR60Q8WVS4 1066 aa8.89□□□□□ -0.99
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PTPRC-212ENST00000491302 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
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PTPRC-212ENST00000491302 LOXL4Q96JB6 756 aa8.89□□□□□ -0.99
PTPRC-212ENST00000491302 NUDT22Q9BRQ3 303 aa8.89□□□□□ -0.99
PTPRC-212ENST00000491302 PARPBPQ9NWS1 579 aa8.89□□□□□ -0.99
PTPRC-212ENST00000491302 VPS51Q9UID3 782 aa8.89□□□□□ -0.99
PTPRC-212ENST00000491302 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa8.89□□□□□ -0.99
PTPRC-212ENST00000491302 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
PTPRC-212ENST00000491302 ANXA6P08133 673 aa8.88□□□□□ -0.99
PTPRC-212ENST00000491302 HGFP14210 728 aa8.88□□□□□ -0.99
PTPRC-212ENST00000491302 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP8.88□□□□□ -0.99
PTPRC-212ENST00000491302 CST5P28325 142 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
PTPRC-212ENST00000491302 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP8.88□□□□□ -0.99
PTPRC-212ENST00000491302 BEAN1Q3B7T3 259 aa8.88□□□□□ -0.99
PTPRC-212ENST00000491302 FBXO47Q5MNV8 452 aa8.88□□□□□ -0.99
PTPRC-212ENST00000491302 ABRAQ8N0Z2 381 aa8.88□□□□□ -0.99
PTPRC-212ENST00000491302 SPPL3Q8TCT6 385 aa8.88□□□□□ -0.99
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM171Q8WVE6 324 aa8.88□□□□□ -0.99
PTPRC-212ENST00000491302 TPSD1Q9BZJ3 242 aa8.88□□□□□ -0.99
PTPRC-212ENST00000491302 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
PTPRC-212ENST00000491302 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
PTPRC-212ENST00000491302 USP22Q9UPT9 525 aa8.88□□□□□ -0.99
PTPRC-212ENST00000491302 PCDH17O14917 1159 aa8.87□□□□□ -0.99
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PTPRC-212ENST00000491302 RINLQ6ZS11 566 aa8.87□□□□□ -0.99
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PTPRC-212ENST00000491302 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
PTPRC-212ENST00000491302 EPS8L2Q9H6S3 715 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRC-212ENST00000491302 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
PTPRC-212ENST00000491302 PRDM8Q9NQV8 689 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRC-212ENST00000491302 GJD2Q9UKL4 321 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRC-212ENST00000491302 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa8.86□□□□□ -0.99
PTPRC-212ENST00000491302 HMX3A6NHT5 357 aa8.86□□□□□ -0.99
PTPRC-212ENST00000491302 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP8.86□□□□□ -0.99
PTPRC-212ENST00000491302 FAM155BO75949 473 aa8.86□□□□□ -0.99
PTPRC-212ENST00000491302 CD19P15391 556 aa8.86□□□□□ -0.99
PTPRC-212ENST00000491302 LAG3P18627 525 aa8.86□□□□□ -0.99
PTPRC-212ENST00000491302 RBL1P28749 1068 aa8.86□□□□□ -0.99
PTPRC-212ENST00000491302 ADORA2AP29274 412 aa8.86□□□□□ -0.99
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PTPRC-212ENST00000491302 DEPDC1Q5TB30 811 aa8.86□□□□□ -0.99
PTPRC-212ENST00000491302 LVRNQ6Q4G3 990 aa8.86□□□□□ -0.99
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PTPRC-212ENST00000491302 IZUMO1Q8IYV9 350 aa8.86□□□□□ -0.99
PTPRC-212ENST00000491302 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa8.86□□□□□ -0.99
PTPRC-212ENST00000491302 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
PTPRC-212ENST00000491302 SDCCAG3Q96C92 435 aa8.86□□□□□ -0.99
PTPRC-212ENST00000491302 BDH2Q9BUT1 245 aa8.86□□□□□ -0.99
PTPRC-212ENST00000491302 ACTRT3Q9BYD9 372 aa8.86□□□□□ -0.99
PTPRC-212ENST00000491302 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
PTPRC-212ENST00000491302 J3KTA2 159 aa8.85□□□□□ -0.99
PTPRC-212ENST00000491302 MUSKO15146 869 aa8.85□□□□□ -0.99
PTPRC-212ENST00000491302 FAM20BO75063 409 aa8.85□□□□□ -0.99
PTPRC-212ENST00000491302 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
PTPRC-212ENST00000491302 ITIH3Q06033 890 aa8.85□□□□□ -0.99
PTPRC-212ENST00000491302 SCAPQ12770 1279 aa8.85□□□□□ -0.99
PTPRC-212ENST00000491302 CLCA4Q14CN2 919 aa8.85□□□□□ -0.99
PTPRC-212ENST00000491302 RINT1Q6NUQ1 792 aa8.85□□□□□ -0.99
PTPRC-212ENST00000491302 RAB11FIP2Q7L804 512 aa8.85□□□□□ -0.99
PTPRC-212ENST00000491302 DTX2Q86UW9 622 aa8.85□□□□□ -0.99
PTPRC-212ENST00000491302 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa8.85□□□□□ -0.99
PTPRC-212ENST00000491302 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
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