RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482056.2

C9orf3-218, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene C9orf3, Length 1,951 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-218ENST00000482056 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
C9orf3-218ENST00000482056 CEP120Q8N960 986 aa16.04■□□□□ 0.16
C9orf3-218ENST00000482056 TRPM4Q8TD43 1214 aa16.04■□□□□ 0.16
C9orf3-218ENST00000482056 MZB1Q8WU39 189 aa16.04■□□□□ 0.16
C9orf3-218ENST00000482056 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
C9orf3-218ENST00000482056 ANKRD27Q96NW4 1050 aa16.04■□□□□ 0.16
C9orf3-218ENST00000482056 NFKBIZQ9BYH8 718 aa16.04■□□□□ 0.16
C9orf3-218ENST00000482056 TRIM55Q9BYV6 548 aa16.04■□□□□ 0.16
C9orf3-218ENST00000482056 ELOVL4Q9GZR5 314 aa16.04■□□□□ 0.16
C9orf3-218ENST00000482056 SDCBP2Q9H190 292 aa16.04■□□□□ 0.16
C9orf3-218ENST00000482056 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
C9orf3-218ENST00000482056 SMYD3Q9H7B4 428 aa16.04■□□□□ 0.16
C9orf3-218ENST00000482056 MANSC1Q9H8J5 431 aa16.04■□□□□ 0.16
C9orf3-218ENST00000482056 NPHS2Q9NP85 383 aa16.04■□□□□ 0.16
C9orf3-218ENST00000482056 CHMP2BQ9UQN3 213 aa16.04■□□□□ 0.16
C9orf3-218ENST00000482056 PTPRFP10586 1907 aa16.04■□□□□ 0.16
C9orf3-218ENST00000482056 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa16.04■□□□□ 0.16
C9orf3-218ENST00000482056 CFAP69A5D8W1 941 aa16.04■□□□□ 0.16
C9orf3-218ENST00000482056 LACTBL1A8MY62 500 aa16.04■□□□□ 0.16
C9orf3-218ENST00000482056 H7C0C1 242 aa16.04■□□□□ 0.16
C9orf3-218ENST00000482056 CHADO15335 359 aa16.04■□□□□ 0.16
C9orf3-218ENST00000482056 PRPSAP2O60256 369 aa16.04■□□□□ 0.16
C9orf3-218ENST00000482056 NFICP08651 508 aa16.04■□□□□ 0.16
C9orf3-218ENST00000482056 RPSAP08865 295 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
C9orf3-218ENST00000482056 STAG3L1P0CL83 205 aa16.04■□□□□ 0.16
C9orf3-218ENST00000482056 ATP5OP48047 213 aa16.04■□□□□ 0.16
C9orf3-218ENST00000482056 PTK7Q13308 1070 aa16.04■□□□□ 0.16
C9orf3-218ENST00000482056 VGLL4Q14135 290 aa16.04■□□□□ 0.16
C9orf3-218ENST00000482056 HSDL1Q3SXM5 330 aa16.04■□□□□ 0.16
C9orf3-218ENST00000482056 JADE1Q6IE81 842 aa16.04■□□□□ 0.16
C9orf3-218ENST00000482056 GADL1Q6ZQY3 521 aa16.04■□□□□ 0.16
C9orf3-218ENST00000482056 ADAM33Q9BZ11 813 aa16.04■□□□□ 0.16
C9orf3-218ENST00000482056 ASB7Q9H672 318 aa16.04■□□□□ 0.16
C9orf3-218ENST00000482056 VRTNQ9H8Y1 702 aa16.04■□□□□ 0.16
C9orf3-218ENST00000482056 PAK5Q9P286 719 aa16.04■□□□□ 0.16
C9orf3-218ENST00000482056 KIAA1257Q9ULG3 409 aa16.04■□□□□ 0.16
C9orf3-218ENST00000482056 CSADQ9Y600 493 aa16.04■□□□□ 0.16
C9orf3-218ENST00000482056 MGAMO43451 1857 aa16.03■□□□□ 0.16
C9orf3-218ENST00000482056 USP2O75604 605 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
C9orf3-218ENST00000482056 ARIH2O95376 493 aa16.03■□□□□ 0.16
C9orf3-218ENST00000482056 NEFHP12036 1026 aa16.03■□□□□ 0.16
C9orf3-218ENST00000482056 ELK3P41970 407 aa16.03■□□□□ 0.16
C9orf3-218ENST00000482056 GPD2P43304 727 aa16.03■□□□□ 0.16
C9orf3-218ENST00000482056 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP16.03■□□□□ 0.16
C9orf3-218ENST00000482056 ORC1Q13415 861 aa16.03■□□□□ 0.16
C9orf3-218ENST00000482056 KRT81Q14533 505 aa16.03■□□□□ 0.16
C9orf3-218ENST00000482056 FAF2Q96CS3 445 aa16.03■□□□□ 0.16
C9orf3-218ENST00000482056 APOPT1Q96IL0 206 aa16.03■□□□□ 0.16
C9orf3-218ENST00000482056 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP16.03■□□□□ 0.16
C9orf3-218ENST00000482056 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
C9orf3-218ENST00000482056 WDR91A4D1P6 747 aa16.02■□□□□ 0.16
C9orf3-218ENST00000482056 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
C9orf3-218ENST00000482056 PEX10O60683 326 aa16.02■□□□□ 0.16
C9orf3-218ENST00000482056 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
C9orf3-218ENST00000482056 KCNJ11Q14654 390 aa16.02■□□□□ 0.16
C9orf3-218ENST00000482056 PDK2Q15119 407 aa16.02■□□□□ 0.16
C9orf3-218ENST00000482056 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
C9orf3-218ENST00000482056 OR6B2Q6IFH4 312 aa16.02■□□□□ 0.16
C9orf3-218ENST00000482056 ZNF449Q6P9G9 518 aa16.02■□□□□ 0.16
C9orf3-218ENST00000482056 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
C9orf3-218ENST00000482056 CHSY1Q86X52 802 aa16.02■□□□□ 0.16
C9orf3-218ENST00000482056 SLC44A1Q8WWI5 657 aa16.02■□□□□ 0.16
C9orf3-218ENST00000482056 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
C9orf3-218ENST00000482056 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
C9orf3-218ENST00000482056 TSSK1BQ9BXA7 367 aa16.02■□□□□ 0.16
C9orf3-218ENST00000482056 BATF3Q9NR55 127 aa16.02■□□□□ 0.16
C9orf3-218ENST00000482056 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
C9orf3-218ENST00000482056 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa16.02■□□□□ 0.16
C9orf3-218ENST00000482056 E7ENQ6 273 aa16.02■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 GOLGA8RI6L899 631 aa16.02■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 DIAPH2O60879 1101 aa16.02■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 ENDOD1O94919 500 aa16.02■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 PDGFRAP16234 1089 aa16.02■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 PTPN4P29074 926 aa16.02■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 CLCN3P51790 818 aa16.02■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 POU5F1BQ06416 359 aa16.02■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 STILQ15468 1287 aa16.02■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 TAF5Q15542 800 aa16.02■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 FAM187BQ17R55 369 aa16.02■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 LGSNQ5TDP6 509 aa16.02■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 LONP2Q86WA8 852 aa16.02■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 TMEM192Q8IY95 271 aa16.02■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 FBXO41Q8TF61 875 aa16.02■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa16.02■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 HPDLQ96IR7 371 aa16.02■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 TWNKQ96RR1 684 aa16.02■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 PNPLA8Q9NP80 782 aa16.02■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 GPRC5DQ9NZD1 345 aa16.02■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 HMGXB4Q9UGU5 601 aa16.02■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 TEX264Q9Y6I9 313 aa16.02■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa16.01■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 KBTBD13C9JR72 458 aa16.01■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 GPR25O00155 361 aa16.01■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 TGM2P21980 687 aa16.01■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 CBLBQ13191 982 aa16.01■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 CRYMQ14894 314 aa16.01■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 TMEM132DQ14C87 1099 aa16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.6 ms