RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476231.1

SYF2-204, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SYF2, Length 1,962 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-204ENST00000476231 ADGRF2Q8IZF7 708 aa20.02■□□□□ 0.8
SYF2-204ENST00000476231 PGBD4Q96DM1 585 aa20.02■□□□□ 0.8
SYF2-204ENST00000476231 FOXP3Q9BZS1 431 aa20.02■□□□□ 0.8
SYF2-204ENST00000476231 UBN1Q9NPG3 1134 aa20.02■□□□□ 0.8
SYF2-204ENST00000476231 NEU2Q9Y3R4 380 aa20.02■□□□□ 0.8
SYF2-204ENST00000476231 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa20.02■□□□□ 0.8
SYF2-204ENST00000476231 TP73O15350 636 aa20.01■□□□□ 0.79
SYF2-204ENST00000476231 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
SYF2-204ENST00000476231 SSR1P43307 286 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
SYF2-204ENST00000476231 LMNB2Q03252 620 aa20.01■□□□□ 0.79
SYF2-204ENST00000476231 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa20.01■□□□□ 0.79
SYF2-204ENST00000476231 TTC30AQ86WT1 665 aa20.01■□□□□ 0.79
SYF2-204ENST00000476231 RCOR2Q8IZ40 523 aa20.01■□□□□ 0.79
SYF2-204ENST00000476231 STK32AQ8WU08 396 aa20.01■□□□□ 0.79
SYF2-204ENST00000476231 ADAM2Q99965 735 aa20.01■□□□□ 0.79
SYF2-204ENST00000476231 TRPV6Q9H1D0 765 aa20.01■□□□□ 0.79
SYF2-204ENST00000476231 DPEP3Q9H4B8 488 aa20.01■□□□□ 0.79
SYF2-204ENST00000476231 CHST7Q9NS84 486 aa20.01■□□□□ 0.79
SYF2-204ENST00000476231 FAM49BQ9NUQ9 324 aa20.01■□□□□ 0.79
SYF2-204ENST00000476231 PHF24Q9UPV7 400 aa20.01■□□□□ 0.79
SYF2-204ENST00000476231 RPL9P32969 192 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
SYF2-204ENST00000476231 SEC24CP53992 1094 aa20.01■□□□□ 0.79
SYF2-204ENST00000476231 SNX16P57768 344 aa20.01■□□□□ 0.79
SYF2-204ENST00000476231 COPS2P61201 443 aa20.01■□□□□ 0.79
SYF2-204ENST00000476231 HTRA3P83110 453 aa20.01■□□□□ 0.79
SYF2-204ENST00000476231 ERMARDQ5T6L9 678 aa20.01■□□□□ 0.79
SYF2-204ENST00000476231 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
SYF2-204ENST00000476231 TADA2BQ86TJ2 420 aa20.01■□□□□ 0.79
SYF2-204ENST00000476231 RELL1Q8IUW5 271 aa20.01■□□□□ 0.79
SYF2-204ENST00000476231 JOSD2Q8TAC2 188 aa20.01■□□□□ 0.79
SYF2-204ENST00000476231 RAPGEF5Q92565 580 aa20.01■□□□□ 0.79
SYF2-204ENST00000476231 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
SYF2-204ENST00000476231 TNIP3Q96KP6 325 aa20.01■□□□□ 0.79
SYF2-204ENST00000476231 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa20.01■□□□□ 0.79
SYF2-204ENST00000476231 OSBPL8Q9BZF1 889 aa20.01■□□□□ 0.79
SYF2-204ENST00000476231 RSAD1Q9HA92 442 aa20.01■□□□□ 0.79
SYF2-204ENST00000476231 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
SYF2-204ENST00000476231 MIOSQ9NXC5 875 aa20.01■□□□□ 0.79
SYF2-204ENST00000476231 ASIC3Q9UHC3 531 aa20.01■□□□□ 0.79
SYF2-204ENST00000476231 KBTBD13C9JR72 458 aa20■□□□□ 0.79
SYF2-204ENST00000476231 F8VP50 259 aa20■□□□□ 0.79
SYF2-204ENST00000476231 CYB561D2O14569 222 aa20■□□□□ 0.79
SYF2-204ENST00000476231 CAPN15O75808 1086 aa20■□□□□ 0.79
SYF2-204ENST00000476231 PDGFRBP09619 1106 aa20■□□□□ 0.79
SYF2-204ENST00000476231 PSMA2P25787 234 aa20■□□□□ 0.79
SYF2-204ENST00000476231 SCNN1GP51170 649 aa20■□□□□ 0.79
SYF2-204ENST00000476231 CCDC89Q8N998 374 aa20■□□□□ 0.79
SYF2-204ENST00000476231 CCHCR1Q8TD31 782 aa20■□□□□ 0.79
SYF2-204ENST00000476231 SLC35F5Q8WV83 523 aa20■□□□□ 0.79
SYF2-204ENST00000476231 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP20■□□□□ 0.79
SYF2-204ENST00000476231 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
SYF2-204ENST00000476231 TRIM17Q9Y577 477 aa20■□□□□ 0.79
SYF2-204ENST00000476231 HTTP42858 3142 aa20■□□□□ 0.79
SYF2-204ENST00000476231 DCDC2CA8MYV0 355 aa19.99■□□□□ 0.79
SYF2-204ENST00000476231 ARVCFO00192 962 aa19.99■□□□□ 0.79
SYF2-204ENST00000476231 RASGRF2O14827 1237 aa19.99■□□□□ 0.79
SYF2-204ENST00000476231 TCEA3O75764 348 aa19.99■□□□□ 0.79
SYF2-204ENST00000476231 KIAA0754O94854 1291 aa19.99■□□□□ 0.79
SYF2-204ENST00000476231 RALAP11233 206 aa19.99■□□□□ 0.79
SYF2-204ENST00000476231 YY1P25490 414 aa19.99■□□□□ 0.79
SYF2-204ENST00000476231 LMO2P25791 158 aa19.99■□□□□ 0.79
SYF2-204ENST00000476231 PTPN7P35236 360 aa19.99■□□□□ 0.79
SYF2-204ENST00000476231 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
SYF2-204ENST00000476231 SKIDA1Q1XH10 827 aa19.99■□□□□ 0.79
SYF2-204ENST00000476231 TRAF7Q6Q0C0 670 aa19.99■□□□□ 0.79
SYF2-204ENST00000476231 C6orf89Q6UWU4 347 aa19.99■□□□□ 0.79
SYF2-204ENST00000476231 SERPINB12Q96P63 405 aa19.99■□□□□ 0.79
SYF2-204ENST00000476231 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
SYF2-204ENST00000476231 SLC4A5Q9BY07 1137 aa19.99■□□□□ 0.79
SYF2-204ENST00000476231 RABEP2Q9H5N1 569 aa19.99■□□□□ 0.79
SYF2-204ENST00000476231 CCDC134Q9H6E4 229 aa19.99■□□□□ 0.79
SYF2-204ENST00000476231 AAASQ9NRG9 546 aa19.99■□□□□ 0.79
SYF2-204ENST00000476231 DNAH12Q6ZR08 3092 aa19.99■□□□□ 0.79
SYF2-204ENST00000476231 E5RJQ4 531 aa19.99■□□□□ 0.79
SYF2-204ENST00000476231 ATF2P15336 505 aa19.99■□□□□ 0.79
SYF2-204ENST00000476231 BCAT1P54687 386 aa19.99■□□□□ 0.79
SYF2-204ENST00000476231 ACAP1Q15027 740 aa19.99■□□□□ 0.79
SYF2-204ENST00000476231 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
SYF2-204ENST00000476231 TAOK1Q7L7X3 1001 aa19.99■□□□□ 0.79
SYF2-204ENST00000476231 TMEM110Q86TL2 294 aa19.99■□□□□ 0.79
SYF2-204ENST00000476231 ANKRD52Q8NB46 1076 aa19.99■□□□□ 0.79
SYF2-204ENST00000476231 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
SYF2-204ENST00000476231 HCRTO43612 131 aa19.98■□□□□ 0.79
SYF2-204ENST00000476231 CLCNKBP51801 687 aa19.98■□□□□ 0.79
SYF2-204ENST00000476231 BST2Q10589 180 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
SYF2-204ENST00000476231 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP19.98■□□□□ 0.79
SYF2-204ENST00000476231 PMF1Q6P1K2 205 aa19.98■□□□□ 0.79
SYF2-204ENST00000476231 POLNQ7Z5Q5 900 aa19.98■□□□□ 0.79
SYF2-204ENST00000476231 CCDC50Q8IVM0 306 aa19.98■□□□□ 0.79
SYF2-204ENST00000476231 RNF169Q8NCN4 708 aa19.98■□□□□ 0.79
SYF2-204ENST00000476231 SENP8Q96LD8 212 aa19.98■□□□□ 0.79
SYF2-204ENST00000476231 HERPUD2Q9BSE4 406 aa19.98■□□□□ 0.79
SYF2-204ENST00000476231 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
SYF2-204ENST00000476231 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa19.98■□□□□ 0.79
SYF2-204ENST00000476231 GABRDO14764 452 aa19.97■□□□□ 0.79
SYF2-204ENST00000476231 NDC80O14777 642 aa19.97■□□□□ 0.79
SYF2-204ENST00000476231 ATP5DP30049 168 aa19.97■□□□□ 0.79
SYF2-204ENST00000476231 PDE4CQ08493 712 aa19.97■□□□□ 0.79
SYF2-204ENST00000476231 SNX1Q13596 522 aa19.97■□□□□ 0.79
SYF2-204ENST00000476231 AUHQ13825 339 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.6 ms