RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000452550.5

SH3BGR-208, Transcript of SH3 domain binding glutamate rich protein, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5

Gene SH3BGR, Length 865 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGR-208ENST00000452550 ALCAMQ13740 583 aa6.64□□□□□ -1.35
SH3BGR-208ENST00000452550 AUHQ13825 339 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
SH3BGR-208ENST00000452550 SLC39A14Q15043 492 aa6.64□□□□□ -1.35
SH3BGR-208ENST00000452550 KARSQ15046 597 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
SH3BGR-208ENST00000452550 USP41Q3LFD5 358 aa6.64□□□□□ -1.35
SH3BGR-208ENST00000452550 SLFN12LQ6IEE8 588 aa6.64□□□□□ -1.35
SH3BGR-208ENST00000452550 ZPBP2Q6X784 338 aa6.64□□□□□ -1.35
SH3BGR-208ENST00000452550 C1orf186Q6ZWK4 172 aa6.64□□□□□ -1.35
SH3BGR-208ENST00000452550 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
SH3BGR-208ENST00000452550 IQUBQ8NA54 791 aa6.64□□□□□ -1.35
SH3BGR-208ENST00000452550 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
SH3BGR-208ENST00000452550 RAD54LQ92698 747 aa6.64□□□□□ -1.35
SH3BGR-208ENST00000452550 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
SH3BGR-208ENST00000452550 RIPOR3Q96MK2 946 aa6.64□□□□□ -1.35
SH3BGR-208ENST00000452550 UROC1Q96N76 676 aa6.64□□□□□ -1.35
SH3BGR-208ENST00000452550 NECTIN4Q96NY8 510 aa6.64□□□□□ -1.35
SH3BGR-208ENST00000452550 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
SH3BGR-208ENST00000452550 CUEDC2Q9H467 287 aa6.64□□□□□ -1.35
SH3BGR-208ENST00000452550 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa6.64□□□□□ -1.35
SH3BGR-208ENST00000452550 FAM86C1Q9NVL1 165 aa6.64□□□□□ -1.35
SH3BGR-208ENST00000452550 ACTR10Q9NZ32 417 aa6.64□□□□□ -1.35
SH3BGR-208ENST00000452550 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa6.64□□□□□ -1.35
SH3BGR-208ENST00000452550 SEL1LQ9UBV2 794 aa6.64□□□□□ -1.35
SH3BGR-208ENST00000452550 DUSP13Q9UII6 198 aa6.64□□□□□ -1.35
SH3BGR-208ENST00000452550 MTMR6Q9Y217 621 aa6.64□□□□□ -1.35
SH3BGR-208ENST00000452550 TNFSF13BQ9Y275 285 aa6.64□□□□□ -1.35
SH3BGR-208ENST00000452550 GDAQ9Y2T3 454 aa6.64□□□□□ -1.35
SH3BGR-208ENST00000452550 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP6.64□□□□□ -1.353e-9■■■■■ 206.8
SH3BGR-208ENST00000452550 VCANP13611 3396 aa6.64□□□□□ -1.35
SH3BGR-208ENST00000452550 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa6.63□□□□□ -1.35
SH3BGR-208ENST00000452550 K7ENM7 598 aa6.63□□□□□ -1.35
SH3BGR-208ENST00000452550 NRP1O14786 923 aa6.63□□□□□ -1.35
SH3BGR-208ENST00000452550 PER2O15055 1255 aa6.63□□□□□ -1.35
SH3BGR-208ENST00000452550 B4GALT5O43286 388 aa6.63□□□□□ -1.35
SH3BGR-208ENST00000452550 CUTAO60888 179 aa6.63□□□□□ -1.35
SH3BGR-208ENST00000452550 RECQL4O94761 1208 aa6.63□□□□□ -1.35
SH3BGR-208ENST00000452550 YEATS4O95619 227 aa6.63□□□□□ -1.35
SH3BGR-208ENST00000452550 SOD2P04179 222 aa6.63□□□□□ -1.35
SH3BGR-208ENST00000452550 CTSAP10619 480 aa6.63□□□□□ -1.35
SH3BGR-208ENST00000452550 ALADP13716 330 aa6.63□□□□□ -1.35
SH3BGR-208ENST00000452550 IDEP14735 1019 aa6.63□□□□□ -1.35
SH3BGR-208ENST00000452550 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
SH3BGR-208ENST00000452550 PBX3P40426 434 aa6.63□□□□□ -1.35
SH3BGR-208ENST00000452550 SLC11A1P49279 550 aa6.63□□□□□ -1.35
SH3BGR-208ENST00000452550 GLUD2P49448 558 aa6.63□□□□□ -1.35
SH3BGR-208ENST00000452550 SLC12A3P55017 1021 aa6.63□□□□□ -1.35
SH3BGR-208ENST00000452550 ERVFC1P60507 584 aa6.63□□□□□ -1.35
SH3BGR-208ENST00000452550 ITIH3Q06033 890 aa6.63□□□□□ -1.35
SH3BGR-208ENST00000452550 HYAL1Q12794 435 aa6.63□□□□□ -1.35
SH3BGR-208ENST00000452550 RESTQ13127 1097 aa6.63□□□□□ -1.35
SH3BGR-208ENST00000452550 ADAM15Q13444 863 aa6.63□□□□□ -1.35
SH3BGR-208ENST00000452550 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP6.63□□□□□ -1.35
SH3BGR-208ENST00000452550 POSTNQ15063 836 aa6.63□□□□□ -1.35
SH3BGR-208ENST00000452550 IL17AQ16552 155 aa6.63□□□□□ -1.35
SH3BGR-208ENST00000452550 DUSP6Q16828 381 aa6.63□□□□□ -1.35
SH3BGR-208ENST00000452550 TMEM119Q4V9L6 283 aa6.63□□□□□ -1.35
SH3BGR-208ENST00000452550 ATAT1Q5SQI0 421 aa6.63□□□□□ -1.35
SH3BGR-208ENST00000452550 UBXN11Q5T124 520 aa6.63□□□□□ -1.35
SH3BGR-208ENST00000452550 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
SH3BGR-208ENST00000452550 EYSQ5T1H1 3165 aa6.63□□□□□ -1.35
SH3BGR-208ENST00000452550 MPZL3Q6UWV2 235 aa6.63□□□□□ -1.35
SH3BGR-208ENST00000452550 LRRC55Q6ZSA7 311 aa6.63□□□□□ -1.35
SH3BGR-208ENST00000452550 HAUS6Q7Z4H7 955 aa6.63□□□□□ -1.35
SH3BGR-208ENST00000452550 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
SH3BGR-208ENST00000452550 CCDC65Q8IXS2 484 aa6.63□□□□□ -1.35
SH3BGR-208ENST00000452550 GPR65Q8IYL9 337 aa6.63□□□□□ -1.35
SH3BGR-208ENST00000452550 CEP57L1Q8IYX8 460 aa6.63□□□□□ -1.35
SH3BGR-208ENST00000452550 SYCP3Q8IZU3 236 aa6.63□□□□□ -1.35
SH3BGR-208ENST00000452550 KLHL6Q8WZ60 621 aa6.63□□□□□ -1.35
SH3BGR-208ENST00000452550 TSPAN18Q96SJ8 248 aa6.63□□□□□ -1.35
SH3BGR-208ENST00000452550 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
SH3BGR-208ENST00000452550 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
SH3BGR-208ENST00000452550 KIFC3Q9BVG8 833 aa6.63□□□□□ -1.35
SH3BGR-208ENST00000452550 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa6.63□□□□□ -1.35
SH3BGR-208ENST00000452550 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
SH3BGR-208ENST00000452550 PDZD7Q9H5P4 517 aa6.63□□□□□ -1.35
SH3BGR-208ENST00000452550 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
SH3BGR-208ENST00000452550 BRWD1Q9NSI6 2320 aa6.63□□□□□ -1.35
SH3BGR-208ENST00000452550 SNTG2Q9NY99 539 aa6.63□□□□□ -1.35
SH3BGR-208ENST00000452550 PRR13Q9NZ81 148 aa6.63□□□□□ -1.35
SH3BGR-208ENST00000452550 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa6.63□□□□□ -1.35
SH3BGR-208ENST00000452550 FBXL21Q9UKT6 434 aa6.63□□□□□ -1.35
SH3BGR-208ENST00000452550 PCDHB10Q9UN67 800 aa6.63□□□□□ -1.35
SH3BGR-208ENST00000452550 NR2E1Q9Y466 385 aa6.63□□□□□ -1.35
SH3BGR-208ENST00000452550 HES2Q9Y543 173 aa6.63□□□□□ -1.35
SH3BGR-208ENST00000452550 NUB1Q9Y5A7 615 aa6.63□□□□□ -1.35
SH3BGR-208ENST00000452550 IRAK3Q9Y616 596 aa6.63□□□□□ -1.35
SH3BGR-208ENST00000452550 CLIC4Q9Y696 253 aa6.63□□□□□ -1.35
SH3BGR-208ENST00000452550 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
SH3BGR-208ENST00000452550 MYO7AQ13402 2215 aa6.62□□□□□ -1.35
SH3BGR-208ENST00000452550 INPPL1O15357 1258 aa6.62□□□□□ -1.35
SH3BGR-208ENST00000452550 B3GAT3O94766 335 aa6.62□□□□□ -1.35
SH3BGR-208ENST00000452550 PRAMEF1O95521 474 aa6.62□□□□□ -1.35
SH3BGR-208ENST00000452550 GLUD1P00367 558 aa6.62□□□□□ -1.35
SH3BGR-208ENST00000452550 TP53P04637 393 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
SH3BGR-208ENST00000452550 CLTAP09496 248 aa6.62□□□□□ -1.35
SH3BGR-208ENST00000452550 LINC00271P0C7V0 271 aa6.62□□□□□ -1.35
SH3BGR-208ENST00000452550 PAX3P23760 479 aa6.62□□□□□ -1.35
SH3BGR-208ENST00000452550 RPL9P32969 192 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
SH3BGR-208ENST00000452550 MTHFRP42898 656 aa6.62□□□□□ -1.35
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