RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000441222.7

USP46-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 46, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP46, Length 7,954 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46-201ENST00000441222 RPS7P62081 194 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
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USP46-201ENST00000441222 SP8Q8IXZ3 490 aa6.9□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 EID3Q8N140 333 aa6.9□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 MYO1HQ8N1T3 1032 aa6.9□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 NIF3L1Q9GZT8 377 aa6.9□□□□□ -1.3
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USP46-201ENST00000441222 SLC30A5Q8TAD4 765 aa6.9□□□□□ -1.3
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USP46-201ENST00000441222 MACC1Q6ZN28 852 aa6.9□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 RINLQ6ZS11 566 aa6.9□□□□□ -1.3
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USP46-201ENST00000441222 LRRC40Q9H9A6 602 aa6.9□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 SCUBE2Q9NQ36 999 aa6.9□□□□□ -1.3
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USP46-201ENST00000441222 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa6.9□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 HECW2Q9P2P5 1572 aa6.9□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 CST8O60676 142 aa6.9□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
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USP46-201ENST00000441222 CYB5R4Q7L1T6 521 aa6.9□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 SPIRE2Q8WWL2 714 aa6.9□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 SKA1Q96BD8 255 aa6.9□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 EPB41L4BQ9H329 900 aa6.9□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 EVA1BQ9NVM1 165 aa6.9□□□□□ -1.3
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USP46-201ENST00000441222 F5H5T6 163 aa6.9□□□□□ -1.31
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USP46-201ENST00000441222 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 ZBTB39O15060 712 aa6.9□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 NDUFB5O43674 189 aa6.9□□□□□ -1.31
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USP46-201ENST00000441222 HDHD2Q9H0R4 259 aa6.9□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa6.9□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa6.9□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 SPATA2Q9UM82 520 aa6.9□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 BICRAQ9NZM4 1560 aa6.9□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 PRR23AA6NEV1 266 aa6.9□□□□□ -1.31
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USP46-201ENST00000441222 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.31
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USP46-201ENST00000441222 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa6.9□□□□□ -1.31
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USP46-201ENST00000441222 ZFP1Q6P2D0 407 aa6.9□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 BARGINQ6ZT62 677 aa6.9□□□□□ -1.31
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USP46-201ENST00000441222 ULK2Q8IYT8 1036 aa6.9□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 TMEM169Q96HH4 297 aa6.9□□□□□ -1.31
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USP46-201ENST00000441222 COL15A1P39059 1388 aa6.9□□□□□ -1.31
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USP46-201ENST00000441222 PEX1O43933 1283 aa6.9□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 MLH1P40692 756 aa6.9□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 IL12RB1P42701 662 aa6.9□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 KLHL24Q6TFL4 600 aa6.9□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa6.9□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 KLHL25Q9H0H3 589 aa6.9□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 IL1RL2Q9HB29 575 aa6.9□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 GALNT8Q9NY28 637 aa6.9□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa6.9□□□□□ -1.31
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