RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438888.5

PRAME-208, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 4

Gene PRAME, Length 566 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-208ENST00000438888 PXNP49023 591 aaPredicted RBP13.26□□□□□ -0.29
PRAME-208ENST00000438888 FMO5P49326 533 aa13.26□□□□□ -0.29
PRAME-208ENST00000438888 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP13.26□□□□□ -0.29
PRAME-208ENST00000438888 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP13.26□□□□□ -0.29
PRAME-208ENST00000438888 MYL7Q01449 175 aa13.26□□□□□ -0.29
PRAME-208ENST00000438888 PPP3CAQ08209 521 aa13.26□□□□□ -0.29
PRAME-208ENST00000438888 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa13.26□□□□□ -0.29
PRAME-208ENST00000438888 SV2CQ496J9 727 aa13.26□□□□□ -0.29
PRAME-208ENST00000438888 PKN3Q6P5Z2 889 aa13.26□□□□□ -0.29
PRAME-208ENST00000438888 LONP2Q86WA8 852 aa13.26□□□□□ -0.29
PRAME-208ENST00000438888 WDR49Q8IV35 697 aa13.26□□□□□ -0.29
PRAME-208ENST00000438888 ZNF560Q96MR9 790 aa13.26□□□□□ -0.29
PRAME-208ENST00000438888 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa13.26□□□□□ -0.29
PRAME-208ENST00000438888 PI4K2AQ9BTU6 479 aa13.26□□□□□ -0.29
PRAME-208ENST00000438888 SLC46A2Q9BY10 475 aa13.26□□□□□ -0.29
PRAME-208ENST00000438888 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa13.26□□□□□ -0.29
PRAME-208ENST00000438888 MMRN2Q9H8L6 949 aa13.26□□□□□ -0.29
PRAME-208ENST00000438888 TMEM8AQ9HCN3 771 aa13.26□□□□□ -0.29
PRAME-208ENST00000438888 GKN1Q9NS71 199 aa13.26□□□□□ -0.29
PRAME-208ENST00000438888 SEMA4GQ9NTN9 838 aa13.26□□□□□ -0.29
PRAME-208ENST00000438888 TMLHEQ9NVH6 421 aa13.26□□□□□ -0.29
PRAME-208ENST00000438888 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP13.26□□□□□ -0.29
PRAME-208ENST00000438888 OBP2AQ9NY56 170 aa13.26□□□□□ -0.29
PRAME-208ENST00000438888 HSFX1Q9UBD0 423 aa13.26□□□□□ -0.29
PRAME-208ENST00000438888 CCL26Q9Y258 94 aa13.26□□□□□ -0.29
PRAME-208ENST00000438888 EPG5Q9HCE0 2579 aa13.26□□□□□ -0.29
PRAME-208ENST00000438888 PTPRJQ12913 1337 aa13.25□□□□□ -0.29
PRAME-208ENST00000438888 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP13.25□□□□□ -0.29
PRAME-208ENST00000438888 TEX33O43247 280 aa13.25□□□□□ -0.29
PRAME-208ENST00000438888 ITGB3P05106 788 aa13.25□□□□□ -0.29
PRAME-208ENST00000438888 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP13.25□□□□□ -0.29
PRAME-208ENST00000438888 MXI1P50539 228 aa13.25□□□□□ -0.29
PRAME-208ENST00000438888 AP3M2P53677 418 aa13.25□□□□□ -0.29
PRAME-208ENST00000438888 TSPY1Q01534 308 aa13.25□□□□□ -0.29
PRAME-208ENST00000438888 CETN1Q12798 172 aa13.25□□□□□ -0.29
PRAME-208ENST00000438888 CCINQ13939 588 aa13.25□□□□□ -0.29
PRAME-208ENST00000438888 CCDC142Q17RM4 750 aa13.25□□□□□ -0.29
PRAME-208ENST00000438888 CBWD6Q4V339 395 aa13.25□□□□□ -0.29
PRAME-208ENST00000438888 CBWD3Q5JTY5 395 aa13.25□□□□□ -0.29
PRAME-208ENST00000438888 CBWD5Q5RIA9 395 aa13.25□□□□□ -0.29
PRAME-208ENST00000438888 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP13.25□□□□□ -0.29
PRAME-208ENST00000438888 KRT39Q6A163 491 aa13.25□□□□□ -0.29
PRAME-208ENST00000438888 TXNDC8Q6A555 127 aa13.25□□□□□ -0.29
PRAME-208ENST00000438888 NT5DC4Q86YG4 428 aa13.25□□□□□ -0.29
PRAME-208ENST00000438888 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP13.25□□□□□ -0.29
PRAME-208ENST00000438888 CMTM8Q8IZV2 173 aa13.25□□□□□ -0.29
PRAME-208ENST00000438888 SPPL2BQ8TCT7 592 aa13.25□□□□□ -0.29
PRAME-208ENST00000438888 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP13.25□□□□□ -0.29
PRAME-208ENST00000438888 RTKNQ9BST9 563 aa13.25□□□□□ -0.29
PRAME-208ENST00000438888 EBF3Q9H4W6 596 aa13.25□□□□□ -0.29
PRAME-208ENST00000438888 AGAP1Q9UPQ3 857 aa13.25□□□□□ -0.29
PRAME-208ENST00000438888 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa13.25□□□□□ -0.29
PRAME-208ENST00000438888 TPRP12270 2363 aaKnown RBP13.25□□□□□ -0.29
PRAME-208ENST00000438888 SCN1AP35498 2009 aa13.24□□□□□ -0.29
PRAME-208ENST00000438888 A0A1W2PQC6 194 aa13.24□□□□□ -0.29
PRAME-208ENST00000438888 PMM2O15305 246 aa13.24□□□□□ -0.29
PRAME-208ENST00000438888 P4HA2O15460 535 aa13.24□□□□□ -0.29
PRAME-208ENST00000438888 GDF9O60383 454 aa13.24□□□□□ -0.29
PRAME-208ENST00000438888 TNNC2P02585 160 aa13.24□□□□□ -0.29
PRAME-208ENST00000438888 KRT19P08727 400 aa13.24□□□□□ -0.29
PRAME-208ENST00000438888 TMEM191BP0C7N4 346 aa13.24□□□□□ -0.29
PRAME-208ENST00000438888 ARSAP15289 507 aa13.24□□□□□ -0.29
PRAME-208ENST00000438888 CDC25BP30305 580 aa13.24□□□□□ -0.29
PRAME-208ENST00000438888 CCDC6Q16204 474 aa13.24□□□□□ -0.29
PRAME-208ENST00000438888 DDR2Q16832 855 aa13.24□□□□□ -0.29
PRAME-208ENST00000438888 DUOXA2Q1HG44 320 aa13.24□□□□□ -0.29
PRAME-208ENST00000438888 SCARA3Q6AZY7 606 aa13.24□□□□□ -0.29
PRAME-208ENST00000438888 GBP6Q6ZN66 633 aa13.24□□□□□ -0.29
PRAME-208ENST00000438888 PRR23CQ6ZRP0 262 aa13.24□□□□□ -0.29
PRAME-208ENST00000438888 TMEM150AQ86TG1 271 aa13.24□□□□□ -0.29
PRAME-208ENST00000438888 PDCL2Q8N4E4 241 aa13.24□□□□□ -0.29
PRAME-208ENST00000438888 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP13.24□□□□□ -0.29
PRAME-208ENST00000438888 OR5B17Q8NGF7 314 aa13.24□□□□□ -0.29
PRAME-208ENST00000438888 NETO1Q8TDF5 533 aa13.24□□□□□ -0.29
PRAME-208ENST00000438888 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP13.24□□□□□ -0.29
PRAME-208ENST00000438888 ZNF516Q92618 1163 aa13.24□□□□□ -0.29
PRAME-208ENST00000438888 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP13.24□□□□□ -0.29
PRAME-208ENST00000438888 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa13.24□□□□□ -0.29
PRAME-208ENST00000438888 ERGIC2Q96RQ1 377 aa13.24□□□□□ -0.29
PRAME-208ENST00000438888 TRPC7Q9HCX4 862 aa13.24□□□□□ -0.29
PRAME-208ENST00000438888 HPS4Q9NQG7 708 aa13.24□□□□□ -0.29
PRAME-208ENST00000438888 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP13.24□□□□□ -0.29
PRAME-208ENST00000438888 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP13.24□□□□□ -0.29
PRAME-208ENST00000438888 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP13.23□□□□□ -0.29
PRAME-208ENST00000438888 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP13.23□□□□□ -0.29
PRAME-208ENST00000438888 HCRTO43612 131 aa13.23□□□□□ -0.29
PRAME-208ENST00000438888 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP13.23□□□□□ -0.29
PRAME-208ENST00000438888 F11P03951 625 aa13.23□□□□□ -0.29
PRAME-208ENST00000438888 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP13.23□□□□□ -0.29
PRAME-208ENST00000438888 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP13.23□□□□□ -0.29
PRAME-208ENST00000438888 CNR2P34972 360 aa13.23□□□□□ -0.29
PRAME-208ENST00000438888 PBX1P40424 430 aa13.23□□□□□ -0.29
PRAME-208ENST00000438888 SMARCB1Q12824 385 aa13.23□□□□□ -0.29
PRAME-208ENST00000438888 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP13.23□□□□□ -0.29
PRAME-208ENST00000438888 BIRC3Q13489 604 aa13.23□□□□□ -0.29
PRAME-208ENST00000438888 RUNX3Q13761 415 aa13.23□□□□□ -0.29
PRAME-208ENST00000438888 SYCP1Q15431 976 aa13.23□□□□□ -0.29
PRAME-208ENST00000438888 ZACNQ401N2 412 aa13.23□□□□□ -0.29
PRAME-208ENST00000438888 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP13.23□□□□□ -0.29
PRAME-208ENST00000438888 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.1 ms