RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436066.3

PLEKHF1-201, Transcript of pleckstrin homology and FYVE domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PLEKHF1, Length 2,084 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLEKHF1-201ENST00000436066 UNC93AQ86WB7 457 aa26.45■■□□□ 1.82
PLEKHF1-201ENST00000436066 SCUBE3Q8IX30 993 aa26.45■■□□□ 1.82
PLEKHF1-201ENST00000436066 SLC35F5Q8WV83 523 aa26.45■■□□□ 1.82
PLEKHF1-201ENST00000436066 TTC25Q96NG3 672 aa26.45■■□□□ 1.82
PLEKHF1-201ENST00000436066 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP26.45■■□□□ 1.82
PLEKHF1-201ENST00000436066 GGA2Q9UJY4 613 aa26.45■■□□□ 1.82
PLEKHF1-201ENST00000436066 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa26.45■■□□□ 1.82
PLEKHF1-201ENST00000436066 HAS3O00219 553 aa26.44■■□□□ 1.82
PLEKHF1-201ENST00000436066 HCRTO43612 131 aa26.44■■□□□ 1.82
PLEKHF1-201ENST00000436066 SETSIPP0DME0 302 aa26.44■■□□□ 1.82
PLEKHF1-201ENST00000436066 CPT1AP50416 773 aa26.44■■□□□ 1.82
PLEKHF1-201ENST00000436066 CENPUQ71F23 418 aa26.44■■□□□ 1.82
PLEKHF1-201ENST00000436066 UNC45BQ8IWX7 931 aa26.44■■□□□ 1.82
PLEKHF1-201ENST00000436066 ZBED8Q8IZ13 594 aa26.44■■□□□ 1.82
PLEKHF1-201ENST00000436066 C7orf31Q8N865 590 aa26.44■■□□□ 1.82
PLEKHF1-201ENST00000436066 SEC16BQ96JE7 1060 aa26.44■■□□□ 1.82
PLEKHF1-201ENST00000436066 LGALS13Q9UHV8 139 aa26.44■■□□□ 1.82
PLEKHF1-201ENST00000436066 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP26.44■■□□□ 1.82
PLEKHF1-201ENST00000436066 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa26.43■■□□□ 1.82
PLEKHF1-201ENST00000436066 TMEM120BA0PK00 339 aa26.43■■□□□ 1.82
PLEKHF1-201ENST00000436066 GOLGA8MH3BSY2 632 aa26.43■■□□□ 1.82
PLEKHF1-201ENST00000436066 ENDOD1O94919 500 aa26.43■■□□□ 1.82
PLEKHF1-201ENST00000436066 CYP2B6P20813 491 aa26.43■■□□□ 1.82
PLEKHF1-201ENST00000436066 IFNAR2P48551 515 aa26.43■■□□□ 1.82
PLEKHF1-201ENST00000436066 HUNKP57058 714 aa26.43■■□□□ 1.82
PLEKHF1-201ENST00000436066 SLC6A3Q01959 620 aa26.43■■□□□ 1.82
PLEKHF1-201ENST00000436066 FBXO47Q5MNV8 452 aa26.43■■□□□ 1.82
PLEKHF1-201ENST00000436066 SCYL2Q6P3W7 929 aa26.43■■□□□ 1.82
PLEKHF1-201ENST00000436066 TMEM110Q86TL2 294 aa26.43■■□□□ 1.82
PLEKHF1-201ENST00000436066 SESTD1Q86VW0 696 aa26.43■■□□□ 1.82
PLEKHF1-201ENST00000436066 SPATA18Q8TC71 538 aa26.43■■□□□ 1.82
PLEKHF1-201ENST00000436066 MCF2LO15068 1137 aa26.43■■□□□ 1.82
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PLEKHF1-201ENST00000436066 MAGEA9P43362 315 aa26.43■■□□□ 1.82
PLEKHF1-201ENST00000436066 IFT88Q13099 833 aa26.43■■□□□ 1.82
PLEKHF1-201ENST00000436066 DPYSL3Q14195 570 aa26.43■■□□□ 1.82
PLEKHF1-201ENST00000436066 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
PLEKHF1-201ENST00000436066 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
PLEKHF1-201ENST00000436066 VSTM1Q6UX27 236 aa26.43■■□□□ 1.82
PLEKHF1-201ENST00000436066 NPNTQ6UXI9 565 aa26.43■■□□□ 1.82
PLEKHF1-201ENST00000436066 PPIL6Q8IXY8 311 aa26.43■■□□□ 1.82
PLEKHF1-201ENST00000436066 RNF39Q9H2S5 420 aa26.43■■□□□ 1.82
PLEKHF1-201ENST00000436066 KCNK9Q9NPC2 374 aa26.43■■□□□ 1.82
PLEKHF1-201ENST00000436066 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
PLEKHF1-201ENST00000436066 PIRO00625 290 aa26.42■■□□□ 1.82
PLEKHF1-201ENST00000436066 PDGFRBP09619 1106 aa26.42■■□□□ 1.82
PLEKHF1-201ENST00000436066 RBP3P10745 1247 aa26.42■■□□□ 1.82
PLEKHF1-201ENST00000436066 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
PLEKHF1-201ENST00000436066 CCDC142Q17RM4 750 aa26.42■■□□□ 1.82
PLEKHF1-201ENST00000436066 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
PLEKHF1-201ENST00000436066 MGARPQ8TDB4 240 aa26.42■■□□□ 1.82
PLEKHF1-201ENST00000436066 CPT1BQ92523 772 aa26.42■■□□□ 1.82
PLEKHF1-201ENST00000436066 B3GNT5Q9BYG0 378 aa26.42■■□□□ 1.82
PLEKHF1-201ENST00000436066 AP5M1Q9H0R1 490 aa26.42■■□□□ 1.82
PLEKHF1-201ENST00000436066 RASSF4Q9H2L5 321 aa26.42■■□□□ 1.82
PLEKHF1-201ENST00000436066 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa26.42■■□□□ 1.82
PLEKHF1-201ENST00000436066 DPYSL4O14531 572 aa26.42■■□□□ 1.82
PLEKHF1-201ENST00000436066 ALOX15BO15296 676 aa26.42■■□□□ 1.82
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PLEKHF1-201ENST00000436066 CD4P01730 458 aa26.42■■□□□ 1.82
PLEKHF1-201ENST00000436066 SDC4P31431 198 aa26.42■■□□□ 1.82
PLEKHF1-201ENST00000436066 KRT81Q14533 505 aa26.42■■□□□ 1.82
PLEKHF1-201ENST00000436066 LRRC14Q15048 493 aa26.42■■□□□ 1.82
PLEKHF1-201ENST00000436066 CAPN12Q6ZSI9 719 aa26.42■■□□□ 1.82
PLEKHF1-201ENST00000436066 OTUD6BQ8N6M0 293 aa26.42■■□□□ 1.82
PLEKHF1-201ENST00000436066 FAM71DQ8N9W8 422 aa26.42■■□□□ 1.82
PLEKHF1-201ENST00000436066 FAM172AQ8WUF8 416 aa26.42■■□□□ 1.82
PLEKHF1-201ENST00000436066 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP26.42■■□□□ 1.82
PLEKHF1-201ENST00000436066 CCDC134Q9H6E4 229 aa26.42■■□□□ 1.82
PLEKHF1-201ENST00000436066 KPNA7A9QM74 516 aa26.41■■□□□ 1.82
PLEKHF1-201ENST00000436066 GABBR2O75899 941 aa26.41■■□□□ 1.82
PLEKHF1-201ENST00000436066 BRAFP15056 766 aa26.41■■□□□ 1.82
PLEKHF1-201ENST00000436066 UBXN11Q5T124 520 aa26.41■■□□□ 1.82
PLEKHF1-201ENST00000436066 ANKRD22Q5VYY1 191 aa26.41■■□□□ 1.82
PLEKHF1-201ENST00000436066 ARHGAP17Q68EM7 881 aa26.41■■□□□ 1.82
PLEKHF1-201ENST00000436066 C6orf89Q6UWU4 347 aa26.41■■□□□ 1.82
PLEKHF1-201ENST00000436066 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa26.41■■□□□ 1.82
PLEKHF1-201ENST00000436066 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa26.41■■□□□ 1.82
PLEKHF1-201ENST00000436066 VPS37BQ9H9H4 285 aa26.41■■□□□ 1.82
PLEKHF1-201ENST00000436066 EURLQ9NYK6 297 aa26.41■■□□□ 1.82
PLEKHF1-201ENST00000436066 SPTLC1O15269 473 aa26.4■■□□□ 1.82
PLEKHF1-201ENST00000436066 FGFR1P11362 822 aa26.4■■□□□ 1.82
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PLEKHF1-201ENST00000436066 SNX16P57768 344 aa26.4■■□□□ 1.82
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PLEKHF1-201ENST00000436066 HIF1AQ16665 826 aa26.4■■□□□ 1.82
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PLEKHF1-201ENST00000436066 NAT8LQ8N9F0 302 aa26.4■■□□□ 1.82
PLEKHF1-201ENST00000436066 DYDC1Q8WWB3 177 aa26.4■■□□□ 1.82
PLEKHF1-201ENST00000436066 P3H4Q92791 437 aa26.4■■□□□ 1.82
PLEKHF1-201ENST00000436066 CABS1Q96KC9 395 aa26.4■■□□□ 1.82
PLEKHF1-201ENST00000436066 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa26.4■■□□□ 1.82
PLEKHF1-201ENST00000436066 C17orf102A2RUQ5 167 aa26.4■■□□□ 1.82
PLEKHF1-201ENST00000436066 BANF1O75531 89 aa26.4■■□□□ 1.82
PLEKHF1-201ENST00000436066 LMO2P25791 158 aa26.4■■□□□ 1.82
PLEKHF1-201ENST00000436066 RDXP35241 583 aaKnown RBP26.4■■□□□ 1.82
PLEKHF1-201ENST00000436066 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
PLEKHF1-201ENST00000436066 TFDP2Q14188 446 aa26.4■■□□□ 1.82
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