RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429968.5

RBM39-212, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 2

Gene RBM39, Length 2,149 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-212ENST00000429968 CCDC14Q49A88 953 aa14.62□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 SYCP2LQ5T4T6 812 aa14.62□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 IQSEC1Q6DN90 963 aa14.62□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 SLC27A1Q6PCB7 646 aa14.62□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 OLFML1Q6UWY5 402 aa14.62□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 ALKAL1Q6UXT8 129 aa14.62□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 TADA2BQ86TJ2 420 aa14.62□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 RFX6Q8HWS3 928 aa14.62□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 SCUBE3Q8IX30 993 aa14.62□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 BBOF1Q8ND07 529 aa14.62□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 TSPYL1Q9H0U9 437 aa14.62□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 RASSF4Q9H2L5 321 aa14.62□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 KIF9Q9HAQ2 790 aa14.62□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 CLUHO75153 1309 aa14.61□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 TCEA3O75764 348 aa14.61□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 ENDOD1O94919 500 aa14.61□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 CYP2C9P11712 490 aa14.61□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 P4HA1P13674 534 aa14.61□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 CCDC130P13994 396 aa14.61□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 PDGFRAP16234 1089 aa14.61□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 IL4RP24394 825 aa14.61□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 ADAM17P78536 824 aa14.61□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 DPYSL3Q14195 570 aa14.61□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP14.61□□□□□ -0.071e-13■■■□□ 18
RBM39-212ENST00000429968 HADHQ16836 314 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 MORN1Q5T089 497 aa14.61□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 PACS2Q86VP3 889 aa14.61□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 ZBED8Q8IZ13 594 aa14.61□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 ANKRD42Q8N9B4 389 aa14.61□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 FAM71DQ8N9W8 422 aa14.61□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 LGALS13Q9UHV8 139 aa14.61□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP14.6□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 DARSP14868 501 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 LMO2P25791 158 aa14.6□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 CDH6P55285 790 aa14.6□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 GPX6P59796 221 aa14.6□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 MORF4L2Q15014 288 aa14.6□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 TMED2Q15363 201 aa14.6□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa14.6□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 C9orf57Q5W0N0 161 aa14.6□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 CPLX4Q7Z7G2 160 aa14.6□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 ARRDC4Q8NCT1 418 aa14.6□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 SLC35F5Q8WV83 523 aa14.6□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa14.6□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 MAML1Q92585 1016 aa14.6□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 CACNG4Q9UBN1 327 aa14.6□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 KYAT1Q16773 422 aa14.6□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 CST9Q5W186 159 aa14.6□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 CROCCP2Q86T23 111 aa14.6□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 TLK2Q86UE8 772 aa14.6□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 NAT8LQ8N9F0 302 aa14.6□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 GDAP1Q8TB36 358 aa14.6□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 CNPY3Q9BT09 278 aa14.6□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 MIS12Q9H081 205 aa14.6□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 CCDC134Q9H6E4 229 aa14.6□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 EFR3BQ9Y2G0 817 aa14.6□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa14.59□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 RNF8O76064 485 aa14.59□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 APOC2P02655 101 aa14.59□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 PDGFRBP09619 1106 aa14.59□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 BRAFP15056 766 aa14.59□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 PCK1P35558 622 aa14.59□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 MFSD10Q14728 455 aa14.59□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 UBXN11Q5T124 520 aa14.59□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 TAOK1Q7L7X3 1001 aa14.59□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 SESTD1Q86VW0 696 aa14.59□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 MICALL1Q8N3F8 863 aa14.59□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 SPATA18Q8TC71 538 aa14.59□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 SLC4A5Q9BY07 1137 aa14.59□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 UBN1Q9NPG3 1134 aa14.59□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 CNTN3Q9P232 1028 aa14.59□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 SLC15A5A6NIM6 579 aa14.59□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 VGLL3A8MV65 326 aa14.59□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa14.59□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 DNM1LO00429 736 aa14.59□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 ALOX15BO15296 676 aa14.59□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 ABHD2P08910 425 aa14.59□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 RBP3P10745 1247 aa14.59□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 SSTR1P30872 391 aa14.59□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 SNX17Q15036 470 aa14.59□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 NOTUMQ6P988 496 aa14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 134.6 ms