RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429738.1

MRPL28-203, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L28, human

TSL 2 BASIC

Gene MRPL28, Length 310 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPL28-203	ENST00000429738	ZACN	Q401N2	412 aa		18.89	■□□□□ 0.61
MRPL28-203	ENST00000429738	N4BP2L1	Q5TBK1	243 aa	Predicted RBP	18.89	■□□□□ 0.61
MRPL28-203	ENST00000429738	TRIM68	Q6AZZ1	485 aa		18.89	■□□□□ 0.61
MRPL28-203	ENST00000429738	FSIP1	Q8NA03	581 aa		18.89	■□□□□ 0.61
MRPL28-203	ENST00000429738	C12orf50	Q8NA57	414 aa	Predicted RBP	18.89	■□□□□ 0.61
MRPL28-203	ENST00000429738	TMC2	Q8TDI7	906 aa		18.89	■□□□□ 0.61
MRPL28-203	ENST00000429738	GAB3	Q8WWW8	586 aa		18.89	■□□□□ 0.61
MRPL28-203	ENST00000429738	C8orf48	Q96LL4	319 aa		18.89	■□□□□ 0.61
MRPL28-203	ENST00000429738	CYP2S1	Q96SQ9	504 aa		18.89	■□□□□ 0.61
MRPL28-203	ENST00000429738	SMYD3	Q9H7B4	428 aa		18.89	■□□□□ 0.61
MRPL28-203	ENST00000429738	TMEM30A	Q9NV96	361 aa		18.89	■□□□□ 0.61
MRPL28-203	ENST00000429738	TRAV19	A0A0A6YYK7	116 aa		18.88	■□□□□ 0.61
MRPL28-203	ENST00000429738	C2orf78	A6NCI8	922 aa		18.88	■□□□□ 0.61
MRPL28-203	ENST00000429738		A8MXQ7	604 aa		18.88	■□□□□ 0.61
MRPL28-203	ENST00000429738		F8VP50	259 aa		18.88	■□□□□ 0.61
MRPL28-203	ENST00000429738	MAPK13	O15264	365 aa		18.88	■□□□□ 0.61
MRPL28-203	ENST00000429738	CALU	O43852	315 aa	Predicted RBP	18.88	■□□□□ 0.61
MRPL28-203	ENST00000429738	RPP40	O75818	363 aa	Known RBP	18.88	■□□□□ 0.61
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF202	O95125	648 aa		18.88	■□□□□ 0.61
MRPL28-203	ENST00000429738	KIF20A	O95235	890 aa		18.88	■□□□□ 0.61
MRPL28-203	ENST00000429738	USP17L7	P0C7H9	530 aa		18.88	■□□□□ 0.61
MRPL28-203	ENST00000429738	PFKL	P17858	780 aa		18.88	■□□□□ 0.61
MRPL28-203	ENST00000429738	RAP1GAP	P47736	663 aa		18.88	■□□□□ 0.61
MRPL28-203	ENST00000429738	CACNA2D1	P54289	1103 aa		18.88	■□□□□ 0.61
MRPL28-203	ENST00000429738	BIRC3	Q13489	604 aa		18.88	■□□□□ 0.61
MRPL28-203	ENST00000429738	KCNB1	Q14721	858 aa		18.88	■□□□□ 0.61
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF699	Q32M78	642 aa		18.88	■□□□□ 0.61
MRPL28-203	ENST00000429738	C1orf220	Q5T0J3	134 aa		18.88	■□□□□ 0.61
MRPL28-203	ENST00000429738	B3GALNT2	Q8NCR0	500 aa		18.88	■□□□□ 0.61
MRPL28-203	ENST00000429738	ELOVL4	Q9GZR5	314 aa		18.88	■□□□□ 0.61
MRPL28-203	ENST00000429738	EBF3	Q9H4W6	596 aa		18.88	■□□□□ 0.61
MRPL28-203	ENST00000429738	TRPC7	Q9HCX4	862 aa		18.88	■□□□□ 0.61
MRPL28-203	ENST00000429738	CEP295	Q9C0D2	2601 aa		18.88	■□□□□ 0.61
MRPL28-203	ENST00000429738	IKBKB	O14920	756 aa		18.87	■□□□□ 0.61
MRPL28-203	ENST00000429738	ATG13	O75143	517 aa		18.87	■□□□□ 0.61
MRPL28-203	ENST00000429738	EPN2	O95208	641 aa		18.87	■□□□□ 0.61
MRPL28-203	ENST00000429738	CKM	P06732	381 aa		18.87	■□□□□ 0.61
MRPL28-203	ENST00000429738	ANXA13	P27216	316 aa		18.87	■□□□□ 0.61
MRPL28-203	ENST00000429738	CDH8	P55286	799 aa		18.87	■□□□□ 0.61
MRPL28-203	ENST00000429738	SHC2	P98077	582 aa		18.87	■□□□□ 0.61
MRPL28-203	ENST00000429738	MTF1	Q14872	753 aa		18.87	■□□□□ 0.61
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF667	Q5HYK9	610 aa		18.87	■□□□□ 0.61
MRPL28-203	ENST00000429738	SV2A	Q7L0J3	742 aa		18.87	■□□□□ 0.61
MRPL28-203	ENST00000429738	ARL14EP	Q8N8R7	260 aa	Predicted RBP	18.87	■□□□□ 0.61
MRPL28-203	ENST00000429738	B3GNT5	Q9BYG0	378 aa		18.87	■□□□□ 0.61
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF518B	Q9C0D4	1074 aa		18.87	■□□□□ 0.61
MRPL28-203	ENST00000429738	SDCBP2	Q9H190	292 aa		18.87	■□□□□ 0.61
MRPL28-203	ENST00000429738	GDPD2	Q9HCC8	539 aa		18.87	■□□□□ 0.61
MRPL28-203	ENST00000429738	EHD2	Q9NZN4	543 aa		18.87	■□□□□ 0.61
MRPL28-203	ENST00000429738	ARHGAP26	Q9UNA1	814 aa		18.87	■□□□□ 0.61
MRPL28-203	ENST00000429738	TRDMT1	O14717	391 aa	Known RBP	18.86	■□□□□ 0.61
MRPL28-203	ENST00000429738	ARSA	P15289	507 aa		18.86	■□□□□ 0.61
MRPL28-203	ENST00000429738	PPP3CC	P48454	512 aa		18.86	■□□□□ 0.61
MRPL28-203	ENST00000429738	PXN	P49023	591 aa	Predicted RBP	18.86	■□□□□ 0.61
MRPL28-203	ENST00000429738	MCCD1	P59942	119 aa	Predicted RBP	18.86	■□□□□ 0.61
MRPL28-203	ENST00000429738	GRSF1	Q12849	480 aa	Known RBP eCLIP	18.86	■□□□□ 0.61
MRPL28-203	ENST00000429738	PDGFRL	Q15198	375 aa		18.86	■□□□□ 0.61
MRPL28-203	ENST00000429738	CCDC6	Q16204	474 aa		18.86	■□□□□ 0.61
MRPL28-203	ENST00000429738	SGSM1	Q2NKQ1	1148 aa		18.86	■□□□□ 0.61
MRPL28-203	ENST00000429738	TMEM196	Q5HYL7	178 aa		18.86	■□□□□ 0.61
MRPL28-203	ENST00000429738	STPG1	Q5TH74	334 aa		18.86	■□□□□ 0.61
MRPL28-203	ENST00000429738	CEP135	Q66GS9	1140 aa		18.86	■□□□□ 0.61
MRPL28-203	ENST00000429738	PKN3	Q6P5Z2	889 aa		18.86	■□□□□ 0.61
MRPL28-203	ENST00000429738	KBTBD6	Q86V97	674 aa		18.86	■□□□□ 0.61
MRPL28-203	ENST00000429738	GUF1	Q8N442	669 aa	Known RBP	18.86	■□□□□ 0.61
MRPL28-203	ENST00000429738	OSCP1	Q8WVF1	389 aa		18.86	■□□□□ 0.61
MRPL28-203	ENST00000429738	CCDC47	Q96A33	483 aa	Known RBP	18.86	■□□□□ 0.61
MRPL28-203	ENST00000429738	ELMO3	Q96BJ8	720 aa		18.86	■□□□□ 0.61
MRPL28-203	ENST00000429738	RXFP3	Q9NSD7	469 aa		18.86	■□□□□ 0.61
MRPL28-203	ENST00000429738	SLC8A2	Q9UPR5	921 aa		18.86	■□□□□ 0.61
MRPL28-203	ENST00000429738	FRMD4B	Q9Y2L6	1034 aa		18.86	■□□□□ 0.61
MRPL28-203	ENST00000429738	PCDHGA5	Q9Y5G8	931 aa		18.86	■□□□□ 0.61
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF840P	A6NDX5	716 aa		18.85	■□□□□ 0.61
MRPL28-203	ENST00000429738	CLDN5	O00501	218 aa		18.85	■□□□□ 0.61
MRPL28-203	ENST00000429738	AKAP3	O75969	853 aa		18.85	■□□□□ 0.61
MRPL28-203	ENST00000429738	OLFM2	O95897	454 aa		18.85	■□□□□ 0.61
MRPL28-203	ENST00000429738	ASS1	P00966	412 aa	Known RBP	18.85	■□□□□ 0.61
MRPL28-203	ENST00000429738	CCDC192	P0DO97	292 aa		18.85	■□□□□ 0.61
MRPL28-203	ENST00000429738	HDC	P19113	662 aa		18.85	■□□□□ 0.61
MRPL28-203	ENST00000429738	NR2F2	P24468	414 aa		18.85	■□□□□ 0.61
MRPL28-203	ENST00000429738	PDE6C	P51160	858 aa		18.85	■□□□□ 0.61
MRPL28-203	ENST00000429738	ZXDB	P98169	803 aa		18.85	■□□□□ 0.61
MRPL28-203	ENST00000429738	ENPEP	Q07075	957 aa		18.85	■□□□□ 0.61
MRPL28-203	ENST00000429738	ZCWPW2	Q504Y3	356 aa		18.85	■□□□□ 0.61
MRPL28-203	ENST00000429738	PLA2G2C	Q5R387	149 aa		18.85	■□□□□ 0.61
MRPL28-203	ENST00000429738	CC2D1A	Q6P1N0	951 aa	Predicted RBP	18.85	■□□□□ 0.61
MRPL28-203	ENST00000429738	PAQR9	Q6ZVX9	377 aa		18.85	■□□□□ 0.61
MRPL28-203	ENST00000429738	SH3RF2	Q8TEC5	729 aa		18.85	■□□□□ 0.61
MRPL28-203	ENST00000429738	TAF4B	Q92750	862 aa		18.85	■□□□□ 0.61
MRPL28-203	ENST00000429738	ZC3H10	Q96K80	434 aa	Known RBP	18.85	■□□□□ 0.61
MRPL28-203	ENST00000429738	TRPM5	Q9NZQ8	1165 aa		18.85	■□□□□ 0.61
MRPL28-203	ENST00000429738	MYH10	P35580	1976 aa		18.84	■□□□□ 0.61
MRPL28-203	ENST00000429738	VAMP7	P51809	220 aa		18.84	■□□□□ 0.61
MRPL28-203	ENST00000429738	EML3	Q32P44	896 aa		18.84	■□□□□ 0.61
MRPL28-203	ENST00000429738	FSTL4	Q6MZW2	842 aa		18.84	■□□□□ 0.61
MRPL28-203	ENST00000429738	SCARA5	Q6ZMJ2	495 aa		18.84	■□□□□ 0.61
MRPL28-203	ENST00000429738	INTS8	Q75QN2	995 aa	Known RBP	18.84	■□□□□ 0.61
MRPL28-203	ENST00000429738	FAM35A	Q86V20	835 aa		18.84	■□□□□ 0.61
MRPL28-203	ENST00000429738	CAMKK1	Q8N5S9	505 aa		18.84	■□□□□ 0.61
MRPL28-203	ENST00000429738	TNIP3	Q96KP6	325 aa		18.84	■□□□□ 0.61

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