RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428064.5

LIMS1-208, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIMS1, Length 637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-208ENST00000428064 LOXL4Q96JB6 756 aa22.33■■□□□ 1.17
LIMS1-208ENST00000428064 SLITRK1Q96PX8 696 aa22.33■■□□□ 1.17
LIMS1-208ENST00000428064 B3GNT5Q9BYG0 378 aa22.33■■□□□ 1.17
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa22.33■■□□□ 1.17
LIMS1-208ENST00000428064 ATP8B3O60423 1300 aa22.32■■□□□ 1.16
LIMS1-208ENST00000428064 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
LIMS1-208ENST00000428064 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
LIMS1-208ENST00000428064 TAF10Q12962 218 aa22.32■■□□□ 1.16
LIMS1-208ENST00000428064 BIRC3Q13489 604 aa22.32■■□□□ 1.16
LIMS1-208ENST00000428064 NCOA4Q13772 614 aa22.32■■□□□ 1.16
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF667Q5HYK9 610 aa22.32■■□□□ 1.16
LIMS1-208ENST00000428064 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
LIMS1-208ENST00000428064 NUP93Q8N1F7 819 aa22.32■■□□□ 1.16
LIMS1-208ENST00000428064 PDZD8Q8NEN9 1154 aa22.32■■□□□ 1.16
LIMS1-208ENST00000428064 NETO1Q8TDF5 533 aa22.32■■□□□ 1.16
LIMS1-208ENST00000428064 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
LIMS1-208ENST00000428064 ACDQ96AP0 544 aa22.32■■□□□ 1.16
LIMS1-208ENST00000428064 TNIP3Q96KP6 325 aa22.32■■□□□ 1.16
LIMS1-208ENST00000428064 EML5Q05BV3 1969 aa22.31■■□□□ 1.16
LIMS1-208ENST00000428064 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa22.31■■□□□ 1.16
LIMS1-208ENST00000428064 RPP40O75818 363 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
LIMS1-208ENST00000428064 HOXC13P31276 330 aa22.31■■□□□ 1.16
LIMS1-208ENST00000428064 PRR23CQ6ZRP0 262 aa22.31■■□□□ 1.16
LIMS1-208ENST00000428064 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP22.31■■□□□ 1.16
LIMS1-208ENST00000428064 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa22.31■■□□□ 1.16
LIMS1-208ENST00000428064 TMC2Q8TDI7 906 aa22.31■■□□□ 1.16
LIMS1-208ENST00000428064 RNF38Q9H0F5 515 aa22.31■■□□□ 1.16
LIMS1-208ENST00000428064 SMYD3Q9H7B4 428 aa22.31■■□□□ 1.16
LIMS1-208ENST00000428064 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
LIMS1-208ENST00000428064 CLDN5O00501 218 aa22.3■■□□□ 1.16
LIMS1-208ENST00000428064 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
LIMS1-208ENST00000428064 MAPK13O15264 365 aa22.3■■□□□ 1.16
LIMS1-208ENST00000428064 VNN1O95497 513 aa22.3■■□□□ 1.16
LIMS1-208ENST00000428064 NR3C1P04150 777 aa22.3■■□□□ 1.16
LIMS1-208ENST00000428064 RPN1P04843 607 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
LIMS1-208ENST00000428064 P4HA1P13674 534 aa22.3■■□□□ 1.16
LIMS1-208ENST00000428064 RAP1GAPP47736 663 aa22.3■■□□□ 1.16
LIMS1-208ENST00000428064 ZACNQ401N2 412 aa22.3■■□□□ 1.16
LIMS1-208ENST00000428064 SNX30Q5VWJ9 437 aa22.3■■□□□ 1.16
LIMS1-208ENST00000428064 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa22.3■■□□□ 1.16
LIMS1-208ENST00000428064 FAM35AQ86V20 835 aa22.3■■□□□ 1.16
LIMS1-208ENST00000428064 TTC16Q8NEE8 873 aa22.3■■□□□ 1.16
LIMS1-208ENST00000428064 TAF4BQ92750 862 aa22.3■■□□□ 1.16
LIMS1-208ENST00000428064 LINC00597Q9H2U6 94 aa22.3■■□□□ 1.16
LIMS1-208ENST00000428064 COMMD8Q9NX08 183 aa22.3■■□□□ 1.16
LIMS1-208ENST00000428064 IL37Q9NZH6 218 aa22.3■■□□□ 1.16
LIMS1-208ENST00000428064 EBF1Q9UH73 591 aa22.3■■□□□ 1.16
LIMS1-208ENST00000428064 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa22.3■■□□□ 1.16
LIMS1-208ENST00000428064 CPQQ9Y646 472 aa22.3■■□□□ 1.16
LIMS1-208ENST00000428064 A0A1B0GVL5 298 aa22.29■■□□□ 1.16
LIMS1-208ENST00000428064 FAM92AA1XBS5 289 aa22.29■■□□□ 1.16
LIMS1-208ENST00000428064 IKBKBO14920 756 aa22.29■■□□□ 1.16
LIMS1-208ENST00000428064 KIF20AO95235 890 aa22.29■■□□□ 1.16
LIMS1-208ENST00000428064 YWHAQP27348 245 aa22.29■■□□□ 1.16
LIMS1-208ENST00000428064 OPRD1P41143 372 aa22.29■■□□□ 1.16
LIMS1-208ENST00000428064 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
LIMS1-208ENST00000428064 CDH8P55286 799 aa22.29■■□□□ 1.16
LIMS1-208ENST00000428064 KRT85P78386 507 aa22.29■■□□□ 1.16
LIMS1-208ENST00000428064 NFIL3Q16649 462 aa22.29■■□□□ 1.16
LIMS1-208ENST00000428064 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa22.29■■□□□ 1.16
LIMS1-208ENST00000428064 GAB4Q2WGN9 574 aa22.29■■□□□ 1.16
LIMS1-208ENST00000428064 SMARCD1Q96GM5 515 aa22.29■■□□□ 1.16
LIMS1-208ENST00000428064 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
LIMS1-208ENST00000428064 SPATA32Q96LK8 384 aa22.29■■□□□ 1.16
LIMS1-208ENST00000428064 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
LIMS1-208ENST00000428064 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
LIMS1-208ENST00000428064 TNFRSF10BO14763 440 aa22.28■■□□□ 1.16
LIMS1-208ENST00000428064 SLC30A4O14863 429 aa22.28■■□□□ 1.16
LIMS1-208ENST00000428064 EPN2O95208 641 aa22.28■■□□□ 1.16
LIMS1-208ENST00000428064 PXNP49023 591 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
LIMS1-208ENST00000428064 TUBP50607 506 aa22.28■■□□□ 1.16
LIMS1-208ENST00000428064 DLG4P78352 724 aa22.28■■□□□ 1.16
LIMS1-208ENST00000428064 PAQR9Q6ZVX9 377 aa22.28■■□□□ 1.16
LIMS1-208ENST00000428064 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa22.28■■□□□ 1.16
LIMS1-208ENST00000428064 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa22.28■■□□□ 1.16
LIMS1-208ENST00000428064 SDCBP2Q9H190 292 aa22.28■■□□□ 1.16
LIMS1-208ENST00000428064 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa22.28■■□□□ 1.16
LIMS1-208ENST00000428064 AXIN1O15169 862 aa22.27■■□□□ 1.16
LIMS1-208ENST00000428064 CALUO43852 315 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
LIMS1-208ENST00000428064 RHOBTB3O94955 611 aa22.27■■□□□ 1.16
LIMS1-208ENST00000428064 APBB3O95704 486 aa22.27■■□□□ 1.16
LIMS1-208ENST00000428064 CYP17A1P05093 508 aa22.27■■□□□ 1.16
LIMS1-208ENST00000428064 CCDC192P0DO97 292 aa22.27■■□□□ 1.16
LIMS1-208ENST00000428064 ENPEPQ07075 957 aa22.27■■□□□ 1.16
LIMS1-208ENST00000428064 DMC1Q14565 340 aa22.27■■□□□ 1.16
LIMS1-208ENST00000428064 UNC93AQ86WB7 457 aa22.27■■□□□ 1.16
LIMS1-208ENST00000428064 FUKQ8N0W3 1084 aa22.27■■□□□ 1.16
LIMS1-208ENST00000428064 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa22.27■■□□□ 1.16
LIMS1-208ENST00000428064 FBXO32Q969P5 355 aa22.27■■□□□ 1.16
LIMS1-208ENST00000428064 HHIPQ96QV1 700 aa22.27■■□□□ 1.16
LIMS1-208ENST00000428064 KCNK16Q96T55 309 aa22.27■■□□□ 1.16
LIMS1-208ENST00000428064 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa22.27■■□□□ 1.16
LIMS1-208ENST00000428064 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa22.27■■□□□ 1.16
LIMS1-208ENST00000428064 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa22.26■■□□□ 1.15
LIMS1-208ENST00000428064 SPAG17Q6Q759 2223 aa22.26■■□□□ 1.15
LIMS1-208ENST00000428064 E2F8A0AVK6 867 aa22.26■■□□□ 1.15
LIMS1-208ENST00000428064 ABL1P00519 1130 aa22.26■■□□□ 1.15
LIMS1-208ENST00000428064 ASS1P00966 412 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
LIMS1-208ENST00000428064 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa22.26■■□□□ 1.15
LIMS1-208ENST00000428064 SYKP43405 635 aa22.26■■□□□ 1.15
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