RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420138.5

GPC1-202, Transcript of glypican 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene GPC1, Length 1,835 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1-202ENST00000420138 URGCPQ8TCY9 931 aa22.01■■□□□ 1.11
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GPC1-202ENST00000420138 ACBD6Q9BR61 282 aa22.01■■□□□ 1.11
GPC1-202ENST00000420138 TMEM39AQ9NV64 488 aa22.01■■□□□ 1.11
GPC1-202ENST00000420138 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP22.01■■□□□ 1.11
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GPC1-202ENST00000420138 SCNN1AP37088 669 aa22■■□□□ 1.11
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GPC1-202ENST00000420138 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
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GPC1-202ENST00000420138 SMTNL2Q2TAL5 461 aa21.97■■□□□ 1.11
GPC1-202ENST00000420138 OVOS1Q6IE37 1185 aa21.97■■□□□ 1.11
GPC1-202ENST00000420138 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
GPC1-202ENST00000420138 C1orf54Q8WWF1 131 aa21.97■■□□□ 1.11
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