RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416021.5

SH3BP4-204, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 593 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-204ENST00000416021 UBR7Q8N806 425 aa22.33■■□□□ 1.17
SH3BP4-204ENST00000416021 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa22.33■■□□□ 1.17
SH3BP4-204ENST00000416021 OVCA2Q8WZ82 227 aa22.33■■□□□ 1.17
SH3BP4-204ENST00000416021 ZFYVE19Q96K21 471 aa22.33■■□□□ 1.17
SH3BP4-204ENST00000416021 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
SH3BP4-204ENST00000416021 KCNH6Q9H252 994 aa22.33■■□□□ 1.17
SH3BP4-204ENST00000416021 KIF9Q9HAQ2 790 aa22.33■■□□□ 1.17
SH3BP4-204ENST00000416021 GKN1Q9NS71 199 aa22.33■■□□□ 1.17
SH3BP4-204ENST00000416021 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
SH3BP4-204ENST00000416021 HHLA1C9JL84 531 aa22.32■■□□□ 1.16
SH3BP4-204ENST00000416021 PDE6CP51160 858 aa22.32■■□□□ 1.16
SH3BP4-204ENST00000416021 PLCB2Q00722 1185 aa22.32■■□□□ 1.16
SH3BP4-204ENST00000416021 ARHGAP17Q68EM7 881 aa22.32■■□□□ 1.16
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF852Q6ZMS4 543 aa22.32■■□□□ 1.16
SH3BP4-204ENST00000416021 TPRG1Q6ZUI0 275 aa22.32■■□□□ 1.16
SH3BP4-204ENST00000416021 PDZD8Q8NEN9 1154 aa22.32■■□□□ 1.16
SH3BP4-204ENST00000416021 KAT5Q92993 513 aa22.32■■□□□ 1.16
SH3BP4-204ENST00000416021 FOXQ1Q9C009 403 aa22.32■■□□□ 1.16
SH3BP4-204ENST00000416021 RNF38Q9H0F5 515 aa22.32■■□□□ 1.16
SH3BP4-204ENST00000416021 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
SH3BP4-204ENST00000416021 FBXO44Q9H4M3 255 aa22.32■■□□□ 1.16
SH3BP4-204ENST00000416021 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa22.32■■□□□ 1.16
SH3BP4-204ENST00000416021 FAM92AA1XBS5 289 aa22.31■■□□□ 1.16
SH3BP4-204ENST00000416021 ACO1P21399 889 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
SH3BP4-204ENST00000416021 NUBP1P53384 320 aa22.31■■□□□ 1.16
SH3BP4-204ENST00000416021 TMEM270Q6UE05 265 aa22.31■■□□□ 1.16
SH3BP4-204ENST00000416021 SASS6Q6UVJ0 657 aa22.31■■□□□ 1.16
SH3BP4-204ENST00000416021 ARHGEF19Q8IW93 802 aa22.31■■□□□ 1.16
SH3BP4-204ENST00000416021 FAM114A1Q8IWE2 563 aa22.31■■□□□ 1.16
SH3BP4-204ENST00000416021 JAKMIP2Q96AA8 810 aa22.31■■□□□ 1.16
SH3BP4-204ENST00000416021 NELL2Q99435 816 aa22.31■■□□□ 1.16
SH3BP4-204ENST00000416021 PRRX2Q99811 253 aa22.31■■□□□ 1.16
SH3BP4-204ENST00000416021 CRACR2AQ9BSW2 395 aa22.31■■□□□ 1.16
SH3BP4-204ENST00000416021 KIAA1257Q9ULG3 409 aa22.31■■□□□ 1.16
SH3BP4-204ENST00000416021 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
SH3BP4-204ENST00000416021 SHISA7A6NL88 538 aa22.3■■□□□ 1.16
SH3BP4-204ENST00000416021 FAM170BA6NMN3 283 aa22.3■■□□□ 1.16
SH3BP4-204ENST00000416021 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
SH3BP4-204ENST00000416021 MAN2B1O00754 1011 aa22.3■■□□□ 1.16
SH3BP4-204ENST00000416021 DCNP07585 359 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
SH3BP4-204ENST00000416021 GLULP15104 373 aa22.3■■□□□ 1.16
SH3BP4-204ENST00000416021 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
SH3BP4-204ENST00000416021 GCNT1Q02742 428 aa22.3■■□□□ 1.16
SH3BP4-204ENST00000416021 SGO2Q562F6 1265 aa22.3■■□□□ 1.16
SH3BP4-204ENST00000416021 SNX30Q5VWJ9 437 aa22.3■■□□□ 1.16
SH3BP4-204ENST00000416021 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
SH3BP4-204ENST00000416021 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa22.3■■□□□ 1.16
SH3BP4-204ENST00000416021 ANKRD52Q8NB46 1076 aa22.3■■□□□ 1.16
SH3BP4-204ENST00000416021 TTC16Q8NEE8 873 aa22.3■■□□□ 1.16
SH3BP4-204ENST00000416021 TTC8Q8TAM2 541 aa22.3■■□□□ 1.16
SH3BP4-204ENST00000416021 RIN3Q8TB24 985 aa22.3■■□□□ 1.16
SH3BP4-204ENST00000416021 FAM83CQ9BQN1 747 aa22.3■■□□□ 1.16
SH3BP4-204ENST00000416021 UBXN6Q9BZV1 441 aa22.3■■□□□ 1.16
SH3BP4-204ENST00000416021 PNPLA8Q9NP80 782 aa22.3■■□□□ 1.16
SH3BP4-204ENST00000416021 GTSE1Q9NYZ3 720 aa22.3■■□□□ 1.16
SH3BP4-204ENST00000416021 GMIPQ9P107 970 aa22.3■■□□□ 1.16
SH3BP4-204ENST00000416021 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa22.3■■□□□ 1.16
SH3BP4-204ENST00000416021 OAS1P00973 400 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
SH3BP4-204ENST00000416021 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa22.29■■□□□ 1.16
SH3BP4-204ENST00000416021 VDRP11473 427 aa22.29■■□□□ 1.16
SH3BP4-204ENST00000416021 CD19P15391 556 aa22.29■■□□□ 1.16
SH3BP4-204ENST00000416021 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
SH3BP4-204ENST00000416021 SLC7A9P82251 487 aa22.29■■□□□ 1.16
SH3BP4-204ENST00000416021 TNK2Q07912 1038 aa22.29■■□□□ 1.16
SH3BP4-204ENST00000416021 UBXN2BQ14CS0 331 aa22.29■■□□□ 1.16
SH3BP4-204ENST00000416021 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa22.29■■□□□ 1.16
SH3BP4-204ENST00000416021 HECTD3Q5T447 861 aa22.29■■□□□ 1.16
SH3BP4-204ENST00000416021 CCDC183Q5T5S1 534 aa22.29■■□□□ 1.16
SH3BP4-204ENST00000416021 PJA1Q8NG27 643 aa22.29■■□□□ 1.16
SH3BP4-204ENST00000416021 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
SH3BP4-204ENST00000416021 SH3RF2Q8TEC5 729 aa22.29■■□□□ 1.16
SH3BP4-204ENST00000416021 LTB4R2Q9NPC1 389 aa22.29■■□□□ 1.16
SH3BP4-204ENST00000416021 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
SH3BP4-204ENST00000416021 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
SH3BP4-204ENST00000416021 SCML2Q9UQR0 700 aa22.29■■□□□ 1.16
SH3BP4-204ENST00000416021 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
SH3BP4-204ENST00000416021 PIAS3Q9Y6X2 628 aa22.29■■□□□ 1.16
SH3BP4-204ENST00000416021 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
SH3BP4-204ENST00000416021 PAEPP09466 180 aa22.28■■□□□ 1.16
SH3BP4-204ENST00000416021 SLC9A1P19634 815 aa22.28■■□□□ 1.16
SH3BP4-204ENST00000416021 PGFP49763 221 aa22.28■■□□□ 1.16
SH3BP4-204ENST00000416021 SLC8A3P57103 927 aa22.28■■□□□ 1.16
SH3BP4-204ENST00000416021 ZXDBP98169 803 aa22.28■■□□□ 1.16
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF77Q15935 545 aa22.28■■□□□ 1.16
SH3BP4-204ENST00000416021 MAN2A1Q16706 1144 aa22.28■■□□□ 1.16
SH3BP4-204ENST00000416021 GBP6Q6ZN66 633 aa22.28■■□□□ 1.16
SH3BP4-204ENST00000416021 PRSS33Q8NF86 280 aa22.28■■□□□ 1.16
SH3BP4-204ENST00000416021 FAM3CQ92520 227 aa22.28■■□□□ 1.16
SH3BP4-204ENST00000416021 KREMEN1Q96MU8 473 aa22.28■■□□□ 1.16
SH3BP4-204ENST00000416021 OSBPL6Q9BZF3 934 aa22.28■■□□□ 1.16
SH3BP4-204ENST00000416021 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
SH3BP4-204ENST00000416021 OLFM2O95897 454 aa22.27■■□□□ 1.16
SH3BP4-204ENST00000416021 TCF3P15923 654 aa22.27■■□□□ 1.16
SH3BP4-204ENST00000416021 KIF11P52732 1056 aa22.27■■□□□ 1.16
SH3BP4-204ENST00000416021 MTF1Q14872 753 aa22.27■■□□□ 1.16
SH3BP4-204ENST00000416021 EXOC3L4Q17RC7 722 aa22.27■■□□□ 1.16
SH3BP4-204ENST00000416021 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa22.27■■□□□ 1.16
SH3BP4-204ENST00000416021 VWA3BQ502W6 1294 aa22.27■■□□□ 1.16
SH3BP4-204ENST00000416021 TRIM68Q6AZZ1 485 aa22.27■■□□□ 1.16
SH3BP4-204ENST00000416021 TTC30AQ86WT1 665 aa22.27■■□□□ 1.16
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