RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370287.7

CSAG1-202, Transcript of chondrosarcoma associated gene 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CSAG1, Length 875 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1-202ENST00000370287 CCDC183Q5T5S1 534 aa15.8■□□□□ 0.12
CSAG1-202ENST00000370287 ARHGAP17Q68EM7 881 aa15.8■□□□□ 0.12
CSAG1-202ENST00000370287 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP15.8■□□□□ 0.12
CSAG1-202ENST00000370287 RRAGAQ7L523 313 aa15.8■□□□□ 0.12
CSAG1-202ENST00000370287 YAF2Q8IY57 180 aa15.8■□□□□ 0.12
CSAG1-202ENST00000370287 IRF7Q92985 503 aa15.8■□□□□ 0.12
CSAG1-202ENST00000370287 KREMEN1Q96MU8 473 aa15.8■□□□□ 0.12
CSAG1-202ENST00000370287 SLITRK1Q96PX8 696 aa15.8■□□□□ 0.12
CSAG1-202ENST00000370287 CRACR2AQ9BSW2 395 aa15.8■□□□□ 0.12
CSAG1-202ENST00000370287 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP15.8■□□□□ 0.12
CSAG1-202ENST00000370287 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP15.8■□□□□ 0.12
CSAG1-202ENST00000370287 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP15.8■□□□□ 0.12
CSAG1-202ENST00000370287 TDP1Q9NUW8 608 aa15.8■□□□□ 0.12
CSAG1-202ENST00000370287 EHD2Q9NZN4 543 aa15.8■□□□□ 0.12
CSAG1-202ENST00000370287 GMIPQ9P107 970 aa15.8■□□□□ 0.12
CSAG1-202ENST00000370287 TMEM63CQ9P1W3 806 aa15.8■□□□□ 0.12
CSAG1-202ENST00000370287 FAM92AA1XBS5 289 aa15.79■□□□□ 0.12
CSAG1-202ENST00000370287 STK25O00506 426 aa15.79■□□□□ 0.12
CSAG1-202ENST00000370287 ABL1P00519 1130 aa15.79■□□□□ 0.12
CSAG1-202ENST00000370287 OAS1P00973 400 aaKnown RBP15.79■□□□□ 0.12
CSAG1-202ENST00000370287 CALCAP01258 141 aa15.79■□□□□ 0.12
CSAG1-202ENST00000370287 CKMP06732 381 aa15.79■□□□□ 0.12
CSAG1-202ENST00000370287 USP17L7P0C7H9 530 aa15.79■□□□□ 0.12
CSAG1-202ENST00000370287 RFX1P22670 979 aa15.79■□□□□ 0.12
CSAG1-202ENST00000370287 CLCN5P51795 746 aa15.79■□□□□ 0.12
CSAG1-202ENST00000370287 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP15.79■□□□□ 0.12
CSAG1-202ENST00000370287 ZXDBP98169 803 aa15.79■□□□□ 0.12
CSAG1-202ENST00000370287 APBA1Q02410 837 aa15.79■□□□□ 0.12
CSAG1-202ENST00000370287 PRKCQQ04759 706 aa15.79■□□□□ 0.12
CSAG1-202ENST00000370287 USP4Q13107 963 aa15.79■□□□□ 0.12
CSAG1-202ENST00000370287 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP15.79■□□□□ 0.12
CSAG1-202ENST00000370287 ZNF77Q15935 545 aa15.79■□□□□ 0.12
CSAG1-202ENST00000370287 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa15.79■□□□□ 0.12
CSAG1-202ENST00000370287 GJB7Q6PEY0 223 aa15.79■□□□□ 0.12
CSAG1-202ENST00000370287 TMEM270Q6UE05 265 aa15.79■□□□□ 0.12
CSAG1-202ENST00000370287 TTC30AQ86WT1 665 aa15.79■□□□□ 0.12
CSAG1-202ENST00000370287 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP15.79■□□□□ 0.12
CSAG1-202ENST00000370287 PRSS33Q8NF86 280 aa15.79■□□□□ 0.12
CSAG1-202ENST00000370287 TTC8Q8TAM2 541 aa15.79■□□□□ 0.12
CSAG1-202ENST00000370287 DUSP16Q9BY84 665 aa15.79■□□□□ 0.12
CSAG1-202ENST00000370287 RNF38Q9H0F5 515 aa15.79■□□□□ 0.12
CSAG1-202ENST00000370287 KIF9Q9HAQ2 790 aa15.79■□□□□ 0.12
CSAG1-202ENST00000370287 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP15.79■□□□□ 0.12
CSAG1-202ENST00000370287 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP15.79■□□□□ 0.12
CSAG1-202ENST00000370287 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa15.79■□□□□ 0.12
CSAG1-202ENST00000370287 MYO16Q9Y6X6 1858 aa15.78■□□□□ 0.12
CSAG1-202ENST00000370287 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP15.78■□□□□ 0.12
CSAG1-202ENST00000370287 OLFM2O95897 454 aa15.78■□□□□ 0.12
CSAG1-202ENST00000370287 HDCP19113 662 aa15.78■□□□□ 0.12
CSAG1-202ENST00000370287 SLC9A1P19634 815 aa15.78■□□□□ 0.12
CSAG1-202ENST00000370287 SOX9P48436 509 aa15.78■□□□□ 0.12
CSAG1-202ENST00000370287 GCNT1Q02742 428 aa15.78■□□□□ 0.12
CSAG1-202ENST00000370287 TNK2Q07912 1038 aa15.78■□□□□ 0.12
CSAG1-202ENST00000370287 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa15.78■□□□□ 0.12
CSAG1-202ENST00000370287 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa15.78■□□□□ 0.12
CSAG1-202ENST00000370287 TRIM68Q6AZZ1 485 aa15.78■□□□□ 0.12
CSAG1-202ENST00000370287 TTC16Q8NEE8 873 aa15.78■□□□□ 0.12
CSAG1-202ENST00000370287 OVCA2Q8WZ82 227 aa15.78■□□□□ 0.12
CSAG1-202ENST00000370287 ZSWIM1Q9BR11 485 aa15.78■□□□□ 0.12
CSAG1-202ENST00000370287 TRPV5Q9NQA5 729 aa15.78■□□□□ 0.12
CSAG1-202ENST00000370287 TSPAN16Q9UKR8 245 aa15.78■□□□□ 0.12
CSAG1-202ENST00000370287 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa15.78■□□□□ 0.12
CSAG1-202ENST00000370287 PIAS3Q9Y6X2 628 aa15.78■□□□□ 0.12
CSAG1-202ENST00000370287 WDFY4Q6ZS81 3184 aa15.78■□□□□ 0.12
CSAG1-202ENST00000370287 HELZP42694 1942 aaKnown RBP15.78■□□□□ 0.12
CSAG1-202ENST00000370287 MUC6Q6W4X9 2439 aa15.77■□□□□ 0.12
CSAG1-202ENST00000370287 KANSL1LA0AUZ9 987 aa15.77■□□□□ 0.12
CSAG1-202ENST00000370287 TULP2O00295 520 aa15.77■□□□□ 0.12
CSAG1-202ENST00000370287 CYP26A1O43174 497 aa15.77■□□□□ 0.12
CSAG1-202ENST00000370287 DCNP07585 359 aaKnown RBP15.77■□□□□ 0.12
CSAG1-202ENST00000370287 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa15.77■□□□□ 0.12
CSAG1-202ENST00000370287 GLULP15104 373 aa15.77■□□□□ 0.12
CSAG1-202ENST00000370287 CD19P15391 556 aa15.77■□□□□ 0.12
CSAG1-202ENST00000370287 TARSP26639 723 aaKnown RBP15.77■□□□□ 0.12
CSAG1-202ENST00000370287 PPP3CCP48454 512 aa15.77■□□□□ 0.12
CSAG1-202ENST00000370287 MTF1Q14872 753 aa15.77■□□□□ 0.12
CSAG1-202ENST00000370287 MAN2A1Q16706 1144 aa15.77■□□□□ 0.12
CSAG1-202ENST00000370287 SGO2Q562F6 1265 aa15.77■□□□□ 0.12
CSAG1-202ENST00000370287 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP15.77■□□□□ 0.12
CSAG1-202ENST00000370287 MIIPQ5JXC2 388 aa15.77■□□□□ 0.12
CSAG1-202ENST00000370287 TRIM65Q6PJ69 517 aa15.77■□□□□ 0.12
CSAG1-202ENST00000370287 SASS6Q6UVJ0 657 aa15.77■□□□□ 0.12
CSAG1-202ENST00000370287 FAM114A1Q8IWE2 563 aa15.77■□□□□ 0.12
CSAG1-202ENST00000370287 CCDC105Q8IYK2 499 aa15.77■□□□□ 0.12
CSAG1-202ENST00000370287 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP15.77■□□□□ 0.12
CSAG1-202ENST00000370287 PDZD8Q8NEN9 1154 aa15.77■□□□□ 0.12
CSAG1-202ENST00000370287 PJA1Q8NG27 643 aa15.77■□□□□ 0.12
CSAG1-202ENST00000370287 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP15.77■□□□□ 0.12
CSAG1-202ENST00000370287 SH3RF2Q8TEC5 729 aa15.77■□□□□ 0.12
CSAG1-202ENST00000370287 TFAP2BQ92481 460 aa15.77■□□□□ 0.12
CSAG1-202ENST00000370287 SHDQ96IW2 340 aa15.77■□□□□ 0.12
CSAG1-202ENST00000370287 DNAI2Q9GZS0 605 aa15.77■□□□□ 0.12
CSAG1-202ENST00000370287 CCSER2Q9H7U1 834 aa15.77■□□□□ 0.12
CSAG1-202ENST00000370287 PNPLA8Q9NP80 782 aa15.77■□□□□ 0.12
CSAG1-202ENST00000370287 LTB4R2Q9NPC1 389 aa15.77■□□□□ 0.12
CSAG1-202ENST00000370287 HPS4Q9NQG7 708 aa15.77■□□□□ 0.12
CSAG1-202ENST00000370287 COMMD8Q9NX08 183 aa15.77■□□□□ 0.12
CSAG1-202ENST00000370287 GTSE1Q9NYZ3 720 aa15.77■□□□□ 0.12
CSAG1-202ENST00000370287 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa15.77■□□□□ 0.12
CSAG1-202ENST00000370287 KCNJ18B7U540 433 aa15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.8 ms