RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000335475.5

KCNQ1-202, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene KCNQ1, Length 2,159 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1-202ENST00000335475 DERAQ9Y315 318 aa21.72■■□□□ 1.07
KCNQ1-202ENST00000335475 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
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KCNQ1-202ENST00000335475 FAM47DPA6NHR8 397 aa21.71■■□□□ 1.07
KCNQ1-202ENST00000335475 MCF2LO15068 1137 aa21.71■■□□□ 1.07
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KCNQ1-202ENST00000335475 KIZQ2M2Z5 673 aa21.71■■□□□ 1.07
KCNQ1-202ENST00000335475 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
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KCNQ1-202ENST00000335475 NPNTQ6UXI9 565 aa21.71■■□□□ 1.07
KCNQ1-202ENST00000335475 FAM71DQ8N9W8 422 aa21.71■■□□□ 1.07
KCNQ1-202ENST00000335475 DENND1AQ8TEH3 1009 aa21.71■■□□□ 1.07
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KCNQ1-202ENST00000335475 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP21.71■■□□□ 1.07
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KCNQ1-202ENST00000335475 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
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KCNQ1-202ENST00000335475 SLC40A1Q9NP59 571 aa21.71■■□□□ 1.07
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KCNQ1-202ENST00000335475 GSTA1P08263 222 aa21.7■■□□□ 1.06
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KCNQ1-202ENST00000335475 SLC18A1P54219 525 aa21.7■■□□□ 1.06
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KCNQ1-202ENST00000335475 GJD2Q9UKL4 321 aa21.7■■□□□ 1.06
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KCNQ1-202ENST00000335475 SENP1Q9P0U3 644 aa21.7■■□□□ 1.06
KCNQ1-202ENST00000335475 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
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KCNQ1-202ENST00000335475 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
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KCNQ1-202ENST00000335475 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP21.69■■□□□ 1.06
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KCNQ1-202ENST00000335475 SNX9Q9Y5X1 595 aa21.69■■□□□ 1.06
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KCNQ1-202ENST00000335475 SSTR1P30872 391 aa21.68■■□□□ 1.06
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KCNQ1-202ENST00000335475 SLC35F5Q8WV83 523 aa21.68■■□□□ 1.06
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KCNQ1-202ENST00000335475 TMEM110Q86TL2 294 aa21.68■■□□□ 1.06
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KCNQ1-202ENST00000335475 PYROXD1Q8WU10 500 aa21.68■■□□□ 1.06
KCNQ1-202ENST00000335475 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP21.68■■□□□ 1.06
KCNQ1-202ENST00000335475 RNF157Q96PX1 679 aa21.68■■□□□ 1.06
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