RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000309641.10

PDE4D-201, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,025 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-201ENST00000309641 MCRS1Q96EZ8 462 aa9.61□□□□□ -0.87
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PDE4D-201ENST00000309641 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
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PDE4D-201ENST00000309641 SLC22A12Q96S37 553 aa9.6□□□□□ -0.87
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PDE4D-201ENST00000309641 OSER1Q9NX31 292 aa9.6□□□□□ -0.87
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PDE4D-201ENST00000309641 ST7Q9NRC1 585 aa9.58□□□□□ -0.88
PDE4D-201ENST00000309641 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP9.58□□□□□ -0.88
PDE4D-201ENST00000309641 LIMD1Q9UGP4 676 aa9.58□□□□□ -0.88
PDE4D-201ENST00000309641 NUDT5Q9UKK9 219 aa9.58□□□□□ -0.88
PDE4D-201ENST00000309641 CDH7Q9ULB5 785 aa9.58□□□□□ -0.88
PDE4D-201ENST00000309641 PCDHGC3Q9UN70 934 aa9.58□□□□□ -0.88
PDE4D-201ENST00000309641 FAM50BQ9Y247 325 aa9.58□□□□□ -0.88
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