RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000306324.3

HOXD4-201, Transcript of homeobox D4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD4, Length 1,464 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD4-201ENST00000306324 ITIH6Q6UXX5 1313 aa23.59■■□□□ 1.37
HOXD4-201ENST00000306324 LRRC53A6NM62 1247 aa23.58■■□□□ 1.37
HOXD4-201ENST00000306324 FGF19O95750 216 aa23.58■■□□□ 1.37
HOXD4-201ENST00000306324 YWHAQP27348 245 aa23.58■■□□□ 1.37
HOXD4-201ENST00000306324 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
HOXD4-201ENST00000306324 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa23.58■■□□□ 1.37
HOXD4-201ENST00000306324 DENND1BQ6P3S1 775 aa23.58■■□□□ 1.37
HOXD4-201ENST00000306324 EPS8L1Q8TE68 723 aa23.58■■□□□ 1.37
HOXD4-201ENST00000306324 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa23.58■■□□□ 1.37
HOXD4-201ENST00000306324 EDEM3Q9BZQ6 932 aa23.58■■□□□ 1.37
HOXD4-201ENST00000306324 MYO6Q9UM54 1294 aa23.58■■□□□ 1.37
HOXD4-201ENST00000306324 VCANP13611 3396 aa23.57■■□□□ 1.36
HOXD4-201ENST00000306324 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
HOXD4-201ENST00000306324 BMP1P13497 986 aa23.57■■□□□ 1.36
HOXD4-201ENST00000306324 CEBPBP17676 345 aa23.57■■□□□ 1.36
HOXD4-201ENST00000306324 CDC25CP30307 473 aa23.57■■□□□ 1.36
HOXD4-201ENST00000306324 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
HOXD4-201ENST00000306324 PASD1Q8IV76 773 aa23.57■■□□□ 1.36
HOXD4-201ENST00000306324 VSTM4Q8IW00 320 aa23.57■■□□□ 1.36
HOXD4-201ENST00000306324 SHKBP1Q8TBC3 707 aa23.57■■□□□ 1.36
HOXD4-201ENST00000306324 IQCDQ96DY2 449 aa23.57■■□□□ 1.36
HOXD4-201ENST00000306324 TTLL2Q9BWV7 592 aa23.57■■□□□ 1.36
HOXD4-201ENST00000306324 UBXN6Q9BZV1 441 aa23.57■■□□□ 1.36
HOXD4-201ENST00000306324 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP23.57■■□□□ 1.36
HOXD4-201ENST00000306324 A0A1W2PQJ5 194 aa23.56■■□□□ 1.36
HOXD4-201ENST00000306324 FERP16591 822 aa23.56■■□□□ 1.36
HOXD4-201ENST00000306324 PLA2G4AP47712 749 aa23.56■■□□□ 1.36
HOXD4-201ENST00000306324 RGS7P49802 495 aa23.56■■□□□ 1.36
HOXD4-201ENST00000306324 TAF10Q12962 218 aa23.56■■□□□ 1.36
HOXD4-201ENST00000306324 TEAD2Q15562 447 aa23.56■■□□□ 1.36
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
HOXD4-201ENST00000306324 SLC35F5Q8WV83 523 aa23.56■■□□□ 1.36
HOXD4-201ENST00000306324 FGF13Q92913 245 aa23.56■■□□□ 1.36
HOXD4-201ENST00000306324 FBXO32Q969P5 355 aa23.56■■□□□ 1.36
HOXD4-201ENST00000306324 SLITRK1Q96PX8 696 aa23.56■■□□□ 1.36
HOXD4-201ENST00000306324 FBXO44Q9H4M3 255 aa23.56■■□□□ 1.36
HOXD4-201ENST00000306324 PCDHGC3Q9UN70 934 aa23.56■■□□□ 1.36
HOXD4-201ENST00000306324 A0A0C4DFX4 3053 aa23.56■■□□□ 1.36
HOXD4-201ENST00000306324 MYO10Q9HD67 2058 aa23.56■■□□□ 1.36
HOXD4-201ENST00000306324 MOSPD3O75425 235 aa23.56■■□□□ 1.36
HOXD4-201ENST00000306324 F11P03951 625 aa23.56■■□□□ 1.36
HOXD4-201ENST00000306324 GYPCP04921 128 aa23.56■■□□□ 1.36
HOXD4-201ENST00000306324 CCDC172P0C7W6 258 aa23.56■■□□□ 1.36
HOXD4-201ENST00000306324 GPD2P43304 727 aa23.56■■□□□ 1.36
HOXD4-201ENST00000306324 CYP4F8P98187 520 aa23.56■■□□□ 1.36
HOXD4-201ENST00000306324 MEA1Q16626 185 aa23.56■■□□□ 1.36
HOXD4-201ENST00000306324 SFMBT2Q5VUG0 894 aa23.56■■□□□ 1.36
HOXD4-201ENST00000306324 PMF1Q6P1K2 205 aa23.56■■□□□ 1.36
HOXD4-201ENST00000306324 OTOP3Q7RTS5 596 aa23.56■■□□□ 1.36
HOXD4-201ENST00000306324 TMEM150AQ86TG1 271 aa23.56■■□□□ 1.36
HOXD4-201ENST00000306324 FMNL3Q8IVF7 1028 aa23.56■■□□□ 1.36
HOXD4-201ENST00000306324 SLC20A1Q8WUM9 679 aa23.56■■□□□ 1.36
HOXD4-201ENST00000306324 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
HOXD4-201ENST00000306324 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
HOXD4-201ENST00000306324 MYADMQ96S97 322 aa23.56■■□□□ 1.36
HOXD4-201ENST00000306324 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa23.56■■□□□ 1.36
HOXD4-201ENST00000306324 LRRC4Q9HBW1 653 aa23.56■■□□□ 1.36
HOXD4-201ENST00000306324 COMMD8Q9NX08 183 aa23.56■■□□□ 1.36
HOXD4-201ENST00000306324 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
HOXD4-201ENST00000306324 CAPN11Q9UMQ6 739 aa23.56■■□□□ 1.36
HOXD4-201ENST00000306324 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
HOXD4-201ENST00000306324 NR2E1Q9Y466 385 aa23.56■■□□□ 1.36
HOXD4-201ENST00000306324 CEP83Q9Y592 693 aa23.56■■□□□ 1.36
HOXD4-201ENST00000306324 ABL1P00519 1130 aa23.55■■□□□ 1.36
HOXD4-201ENST00000306324 MMEP08473 750 aa23.55■■□□□ 1.36
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF75DP51815 510 aa23.55■■□□□ 1.36
HOXD4-201ENST00000306324 KIF11P52732 1056 aa23.55■■□□□ 1.36
HOXD4-201ENST00000306324 ASIC2Q16515 512 aa23.55■■□□□ 1.36
HOXD4-201ENST00000306324 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa23.55■■□□□ 1.36
HOXD4-201ENST00000306324 NPAS3Q8IXF0 933 aa23.55■■□□□ 1.36
HOXD4-201ENST00000306324 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
HOXD4-201ENST00000306324 MCRS1Q96EZ8 462 aa23.55■■□□□ 1.36
HOXD4-201ENST00000306324 ST7Q9NRC1 585 aa23.55■■□□□ 1.36
HOXD4-201ENST00000306324 IL37Q9NZH6 218 aa23.55■■□□□ 1.36
HOXD4-201ENST00000306324 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa23.55■■□□□ 1.36
HOXD4-201ENST00000306324 CDH7Q9ULB5 785 aa23.55■■□□□ 1.36
HOXD4-201ENST00000306324 USTQ9Y2C2 406 aa23.55■■□□□ 1.36
HOXD4-201ENST00000306324 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
HOXD4-201ENST00000306324 PIK3R2O00459 728 aa23.54■■□□□ 1.36
HOXD4-201ENST00000306324 TADA3O75528 432 aa23.54■■□□□ 1.36
HOXD4-201ENST00000306324 CASP14P31944 242 aa23.54■■□□□ 1.36
HOXD4-201ENST00000306324 TKTL1P51854 596 aa23.54■■□□□ 1.36
HOXD4-201ENST00000306324 ZBED6P86452 979 aa23.54■■□□□ 1.36
HOXD4-201ENST00000306324 ADIGQ0VDE8 80 aa23.54■■□□□ 1.36
HOXD4-201ENST00000306324 RAB41Q5JT25 222 aa23.54■■□□□ 1.36
HOXD4-201ENST00000306324 TJAP1Q5JTD0 557 aa23.54■■□□□ 1.36
HOXD4-201ENST00000306324 STXBP5Q5T5C0 1151 aa23.54■■□□□ 1.36
HOXD4-201ENST00000306324 TMC6Q7Z403 805 aa23.54■■□□□ 1.36
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF677Q86XU0 584 aa23.54■■□□□ 1.36
HOXD4-201ENST00000306324 ADHFE1Q8IWW8 467 aa23.54■■□□□ 1.36
HOXD4-201ENST00000306324 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
HOXD4-201ENST00000306324 PRKAG3Q9UGI9 489 aa23.54■■□□□ 1.36
HOXD4-201ENST00000306324 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
HOXD4-201ENST00000306324 C2CD4DB7Z1M9 353 aa23.53■■□□□ 1.36
HOXD4-201ENST00000306324 LCP1P13796 627 aa23.53■■□□□ 1.36
HOXD4-201ENST00000306324 CDR2Q01850 454 aa23.53■■□□□ 1.36
HOXD4-201ENST00000306324 TRIM14Q14142 442 aa23.53■■□□□ 1.36
HOXD4-201ENST00000306324 GPR158Q5T848 1215 aa23.53■■□□□ 1.36
HOXD4-201ENST00000306324 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa23.53■■□□□ 1.36
HOXD4-201ENST00000306324 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.9 ms