RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000294702.5

GFI1-201, Transcript of growth factor independent 1 transcriptional repressor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene GFI1, Length 2,784 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFI1-201ENST00000294702 RRN3Q9NYV6 651 aa20.4■□□□□ 0.86
GFI1-201ENST00000294702 SHANK3Q9BYB0 1731 aa20.39■□□□□ 0.86
GFI1-201ENST00000294702 FAM86B1E9PN63 330 aa20.39■□□□□ 0.85
GFI1-201ENST00000294702 IFNB1P01574 187 aa20.39■□□□□ 0.85
GFI1-201ENST00000294702 FAM86B2P0C5J1 330 aa20.39■□□□□ 0.85
GFI1-201ENST00000294702 PTK7Q13308 1070 aa20.39■□□□□ 0.85
GFI1-201ENST00000294702 C6orf52Q5T4I8 152 aa20.39■□□□□ 0.85
GFI1-201ENST00000294702 RHPN2Q8IUC4 686 aa20.39■□□□□ 0.85
GFI1-201ENST00000294702 RHOT1Q8IXI2 618 aa20.39■□□□□ 0.85
GFI1-201ENST00000294702 DEPTORQ8TB45 409 aa20.39■□□□□ 0.85
GFI1-201ENST00000294702 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
GFI1-201ENST00000294702 MTMR4Q9NYA4 1195 aa20.39■□□□□ 0.85
GFI1-201ENST00000294702 USTQ9Y2C2 406 aa20.39■□□□□ 0.85
GFI1-201ENST00000294702 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
GFI1-201ENST00000294702 ADCY6O43306 1168 aa20.39■□□□□ 0.85
GFI1-201ENST00000294702 CBFA2T3O75081 653 aa20.39■□□□□ 0.85
GFI1-201ENST00000294702 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
GFI1-201ENST00000294702 ZNF543Q08ER8 600 aa20.39■□□□□ 0.85
GFI1-201ENST00000294702 TEX44Q53QW1 395 aa20.39■□□□□ 0.85
GFI1-201ENST00000294702 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa20.39■□□□□ 0.85
GFI1-201ENST00000294702 SLC9A9Q8IVB4 645 aa20.39■□□□□ 0.85
GFI1-201ENST00000294702 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
GFI1-201ENST00000294702 E2F7Q96AV8 911 aa20.39■□□□□ 0.85
GFI1-201ENST00000294702 TMEM121Q9BTD3 319 aa20.39■□□□□ 0.85
GFI1-201ENST00000294702 SELENONQ9NZV5 590 aa20.39■□□□□ 0.85
GFI1-201ENST00000294702 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
GFI1-201ENST00000294702 VAV3Q9UKW4 847 aa20.39■□□□□ 0.85
GFI1-201ENST00000294702 RAB26Q9ULW5 256 aa20.39■□□□□ 0.85
GFI1-201ENST00000294702 ZBTB5O15062 677 aa20.38■□□□□ 0.85
GFI1-201ENST00000294702 TRPA1O75762 1119 aa20.38■□□□□ 0.85
GFI1-201ENST00000294702 LDHBP07195 334 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
GFI1-201ENST00000294702 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
GFI1-201ENST00000294702 CHI3L2Q15782 390 aa20.38■□□□□ 0.85
GFI1-201ENST00000294702 ACTRT2Q8TDY3 377 aa20.38■□□□□ 0.85
GFI1-201ENST00000294702 CRYGNQ8WXF5 182 aa20.38■□□□□ 0.85
GFI1-201ENST00000294702 CCT7Q99832 543 aa20.38■□□□□ 0.85
GFI1-201ENST00000294702 GINM1Q9NU53 330 aa20.38■□□□□ 0.85
GFI1-201ENST00000294702 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
GFI1-201ENST00000294702 EEF2P13639 858 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
GFI1-201ENST00000294702 IRX4P78413 519 aa20.38■□□□□ 0.85
GFI1-201ENST00000294702 CDKL1Q00532 357 aa20.38■□□□□ 0.85
GFI1-201ENST00000294702 PEX6Q13608 980 aa20.38■□□□□ 0.85
GFI1-201ENST00000294702 PDK1Q15118 436 aa20.38■□□□□ 0.85
GFI1-201ENST00000294702 ODR4Q5SWX8 454 aa20.38■□□□□ 0.85
GFI1-201ENST00000294702 TRIM50Q86XT4 487 aa20.38■□□□□ 0.85
GFI1-201ENST00000294702 PQLC1Q8N2U9 271 aa20.38■□□□□ 0.85
GFI1-201ENST00000294702 EXD1Q8NHP7 514 aa20.38■□□□□ 0.85
GFI1-201ENST00000294702 CYP2W1Q8TAV3 490 aa20.38■□□□□ 0.85
GFI1-201ENST00000294702 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
GFI1-201ENST00000294702 Q9H521 79 aa20.38■□□□□ 0.85
GFI1-201ENST00000294702 THEGQ9P2T0 379 aa20.38■□□□□ 0.85
GFI1-201ENST00000294702 CLEC11AQ9Y240 323 aa20.38■□□□□ 0.85
GFI1-201ENST00000294702 TMED5Q9Y3A6 229 aa20.38■□□□□ 0.85
GFI1-201ENST00000294702 A0A0B4J269 797 aa20.37■□□□□ 0.85
GFI1-201ENST00000294702 PSTPIP1O43586 416 aa20.37■□□□□ 0.85
GFI1-201ENST00000294702 FAM58BPP0C7Q3 252 aa20.37■□□□□ 0.85
GFI1-201ENST00000294702 PPP4CP60510 307 aa20.37■□□□□ 0.85
GFI1-201ENST00000294702 CREB5Q02930 508 aa20.37■□□□□ 0.85
GFI1-201ENST00000294702 TUBB3Q13509 450 aa20.37■□□□□ 0.85
GFI1-201ENST00000294702 IGDCC3Q8IVU1 814 aa20.37■□□□□ 0.85
GFI1-201ENST00000294702 PALM2Q8IXS6 379 aa20.37■□□□□ 0.85
GFI1-201ENST00000294702 C10orf88Q9H8K7 445 aa20.37■□□□□ 0.85
GFI1-201ENST00000294702 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa20.37■□□□□ 0.85
GFI1-201ENST00000294702 P4HA2O15460 535 aa20.37■□□□□ 0.85
GFI1-201ENST00000294702 UNGP13051 313 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
GFI1-201ENST00000294702 TCF4P15884 667 aa20.37■□□□□ 0.85
GFI1-201ENST00000294702 CDK9P50750 372 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
GFI1-201ENST00000294702 PSMD6Q15008 389 aa20.37■□□□□ 0.85
GFI1-201ENST00000294702 ERFEQ4G0M1 354 aa20.37■□□□□ 0.85
GFI1-201ENST00000294702 MFSD4BQ5TF39 518 aa20.37■□□□□ 0.85
GFI1-201ENST00000294702 OSBPL6Q9BZF3 934 aa20.37■□□□□ 0.85
GFI1-201ENST00000294702 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
GFI1-201ENST00000294702 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa20.36■□□□□ 0.85
GFI1-201ENST00000294702 MSH4O15457 936 aa20.36■□□□□ 0.85
GFI1-201ENST00000294702 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
GFI1-201ENST00000294702 HSPA1LP34931 641 aa20.36■□□□□ 0.85
GFI1-201ENST00000294702 MFAP3P55082 362 aa20.36■□□□□ 0.85
GFI1-201ENST00000294702 OASLQ15646 514 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
GFI1-201ENST00000294702 DEFB107AQ8IZN7 70 aa20.36■□□□□ 0.85
GFI1-201ENST00000294702 LZTR1Q8N653 840 aa20.36■□□□□ 0.85
GFI1-201ENST00000294702 HELQQ8TDG4 1101 aa20.36■□□□□ 0.85
GFI1-201ENST00000294702 CPT1BQ92523 772 aa20.36■□□□□ 0.85
GFI1-201ENST00000294702 CBWD1Q9BRT8 395 aa20.36■□□□□ 0.85
GFI1-201ENST00000294702 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
GFI1-201ENST00000294702 PRDM11Q9NQV5 511 aa20.36■□□□□ 0.85
GFI1-201ENST00000294702 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
GFI1-201ENST00000294702 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa20.36■□□□□ 0.85
GFI1-201ENST00000294702 FUOMA2VDF0 154 aa20.36■□□□□ 0.85
GFI1-201ENST00000294702 FAM155BO75949 473 aa20.36■□□□□ 0.85
GFI1-201ENST00000294702 GSTT2P0CG29 244 aa20.36■□□□□ 0.85
GFI1-201ENST00000294702 GSTT2BP0CG30 244 aa20.36■□□□□ 0.85
GFI1-201ENST00000294702 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
GFI1-201ENST00000294702 COPAP53621 1224 aa20.36■□□□□ 0.85
GFI1-201ENST00000294702 BBS9Q3SYG4 887 aa20.36■□□□□ 0.85
GFI1-201ENST00000294702 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
GFI1-201ENST00000294702 MFSD7Q6UXD7 560 aa20.36■□□□□ 0.85
GFI1-201ENST00000294702 KCTD1Q719H9 257 aa20.36■□□□□ 0.85
GFI1-201ENST00000294702 TPH2Q8IWU9 490 aa20.36■□□□□ 0.85
GFI1-201ENST00000294702 COX4I2Q96KJ9 171 aa20.36■□□□□ 0.85
GFI1-201ENST00000294702 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.3 ms