RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261667.7

KPNA3-201, Transcript of karyopherin subunit alpha 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene KPNA3, Length 4,474 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA3-201ENST00000261667 UGT1A7Q9HAW7 530 aa11.04□□□□□ -0.64
KPNA3-201ENST00000261667 UGT1A10Q9HAW8 530 aa11.04□□□□□ -0.64
KPNA3-201ENST00000261667 UGT1A8Q9HAW9 530 aa11.04□□□□□ -0.64
KPNA3-201ENST00000261667 FBXO40Q9UH90 709 aa11.04□□□□□ -0.64
KPNA3-201ENST00000261667 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
KPNA3-201ENST00000261667 VPS51Q9UID3 782 aa11.04□□□□□ -0.64
KPNA3-201ENST00000261667 BAIAP2Q9UQB8 552 aa11.04□□□□□ -0.64
KPNA3-201ENST00000261667 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa11.04□□□□□ -0.64
KPNA3-201ENST00000261667 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
KPNA3-201ENST00000261667 PDGFRBP09619 1106 aa11.04□□□□□ -0.64
KPNA3-201ENST00000261667 CD44P16070 742 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
KPNA3-201ENST00000261667 BGNP21810 368 aa11.04□□□□□ -0.64
KPNA3-201ENST00000261667 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
KPNA3-201ENST00000261667 PTK7Q13308 1070 aa11.04□□□□□ -0.64
KPNA3-201ENST00000261667 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
KPNA3-201ENST00000261667 DSTYKQ6XUX3 929 aa11.04□□□□□ -0.64
KPNA3-201ENST00000261667 PIGWQ7Z7B1 504 aa11.04□□□□□ -0.64
KPNA3-201ENST00000261667 EPB41L1Q9H4G0 881 aa11.04□□□□□ -0.64
KPNA3-201ENST00000261667 SP140LQ9H930 580 aa11.04□□□□□ -0.64
KPNA3-201ENST00000261667 A0A0G2JPF8 293 aa11.03□□□□□ -0.64
KPNA3-201ENST00000261667 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa11.03□□□□□ -0.64
KPNA3-201ENST00000261667 APOL1O14791 398 aa11.03□□□□□ -0.64
KPNA3-201ENST00000261667 OR6B1O95007 311 aa11.03□□□□□ -0.64
KPNA3-201ENST00000261667 FTLP02792 175 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
KPNA3-201ENST00000261667 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa11.03□□□□□ -0.64
KPNA3-201ENST00000261667 PHKG2P15735 406 aa11.03□□□□□ -0.64
KPNA3-201ENST00000261667 ZNF23P17027 643 aa11.03□□□□□ -0.64
KPNA3-201ENST00000261667 ITGALP20701 1170 aa11.03□□□□□ -0.64
KPNA3-201ENST00000261667 SOX6P35712 828 aa11.03□□□□□ -0.64
KPNA3-201ENST00000261667 COILP38432 576 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
KPNA3-201ENST00000261667 NPTX2P47972 431 aa11.03□□□□□ -0.64
KPNA3-201ENST00000261667 NEK3P51956 506 aa11.03□□□□□ -0.64
KPNA3-201ENST00000261667 SLC25A3Q00325 362 aa11.03□□□□□ -0.64
KPNA3-201ENST00000261667 MAP3K10Q02779 954 aa11.03□□□□□ -0.64
KPNA3-201ENST00000261667 ARHGEF6Q15052 776 aa11.03□□□□□ -0.64
KPNA3-201ENST00000261667 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
KPNA3-201ENST00000261667 TYSND1Q2T9J0 566 aa11.03□□□□□ -0.64
KPNA3-201ENST00000261667 IQSEC1Q6DN90 963 aa11.03□□□□□ -0.64
KPNA3-201ENST00000261667 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
KPNA3-201ENST00000261667 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
KPNA3-201ENST00000261667 POMGNT1Q8WZA1 660 aa11.03□□□□□ -0.64
KPNA3-201ENST00000261667 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP11.03□□□□□ -0.64
KPNA3-201ENST00000261667 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
KPNA3-201ENST00000261667 ITPKCQ96DU7 683 aa11.03□□□□□ -0.64
KPNA3-201ENST00000261667 AK8Q96MA6 479 aa11.03□□□□□ -0.64
KPNA3-201ENST00000261667 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
KPNA3-201ENST00000261667 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
KPNA3-201ENST00000261667 PNPLA3Q9NST1 481 aa11.03□□□□□ -0.64
KPNA3-201ENST00000261667 DNAJC12Q9UKB3 198 aa11.03□□□□□ -0.64
KPNA3-201ENST00000261667 V9GYQ6 96 aa11.03□□□□□ -0.64
KPNA3-201ENST00000261667 CCDC162PA2VCL2 907 aa11.03□□□□□ -0.64
KPNA3-201ENST00000261667 ERVV-2B6SEH9 535 aa11.03□□□□□ -0.64
KPNA3-201ENST00000261667 LSM3P62310 102 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
KPNA3-201ENST00000261667 MTM1Q13496 603 aa11.03□□□□□ -0.64
KPNA3-201ENST00000261667 DMC1Q14565 340 aa11.03□□□□□ -0.64
KPNA3-201ENST00000261667 PODNQ7Z5L7 613 aa11.03□□□□□ -0.64
KPNA3-201ENST00000261667 SLC43A3Q8NBI5 491 aa11.03□□□□□ -0.64
KPNA3-201ENST00000261667 GSTCDQ8NEC7 633 aa11.03□□□□□ -0.64
KPNA3-201ENST00000261667 ENKURQ8TC29 256 aa11.03□□□□□ -0.64
KPNA3-201ENST00000261667 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
KPNA3-201ENST00000261667 PROX1Q92786 737 aa11.03□□□□□ -0.64
KPNA3-201ENST00000261667 DMRTB1Q96MA1 342 aa11.03□□□□□ -0.64
KPNA3-201ENST00000261667 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
KPNA3-201ENST00000261667 EMILIN3Q9NT22 766 aa11.03□□□□□ -0.64
KPNA3-201ENST00000261667 DNAJC11Q9NVH1 559 aa11.03□□□□□ -0.64
KPNA3-201ENST00000261667 A0A087X0T9 212 aa11.03□□□□□ -0.64
KPNA3-201ENST00000261667 CLDN25C9JDP6 229 aa11.03□□□□□ -0.64
KPNA3-201ENST00000261667 THRAP10827 490 aa11.03□□□□□ -0.64
KPNA3-201ENST00000261667 SERPINB5P36952 375 aa11.03□□□□□ -0.64
KPNA3-201ENST00000261667 NT5C2P49902 561 aa11.03□□□□□ -0.64
KPNA3-201ENST00000261667 RUNDC3AQ59EK9 446 aa11.03□□□□□ -0.64
KPNA3-201ENST00000261667 ACSBG2Q5FVE4 666 aa11.03□□□□□ -0.64
KPNA3-201ENST00000261667 DDIASQ8IXT1 998 aa11.03□□□□□ -0.64
KPNA3-201ENST00000261667 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
KPNA3-201ENST00000261667 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa11.03□□□□□ -0.64
KPNA3-201ENST00000261667 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa11.03□□□□□ -0.64
KPNA3-201ENST00000261667 ZNF304Q9HCX3 659 aa11.03□□□□□ -0.64
KPNA3-201ENST00000261667 CLRN2A0PK11 232 aa11.03□□□□□ -0.64
KPNA3-201ENST00000261667 SH3PXD2BA1X283 911 aa11.03□□□□□ -0.64
KPNA3-201ENST00000261667 H3BNX3 289 aa11.03□□□□□ -0.64
KPNA3-201ENST00000261667 H3BSA7 217 aa11.03□□□□□ -0.64
KPNA3-201ENST00000261667 TLR2O60603 784 aa11.03□□□□□ -0.64
KPNA3-201ENST00000261667 FGFR3P22607 806 aa11.03□□□□□ -0.64
KPNA3-201ENST00000261667 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
KPNA3-201ENST00000261667 IL4RP24394 825 aa11.03□□□□□ -0.64
KPNA3-201ENST00000261667 CLK3P49761 638 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
KPNA3-201ENST00000261667 TUBP50607 506 aa11.03□□□□□ -0.64
KPNA3-201ENST00000261667 TRAF3Q13114 568 aa11.03□□□□□ -0.64
KPNA3-201ENST00000261667 NCOA4Q13772 614 aa11.03□□□□□ -0.64
KPNA3-201ENST00000261667 CCDC142Q17RM4 750 aa11.03□□□□□ -0.64
KPNA3-201ENST00000261667 PAGE2BQ5JRK9 111 aa11.03□□□□□ -0.64
KPNA3-201ENST00000261667 CDKAL1Q5VV42 579 aa11.03□□□□□ -0.64
KPNA3-201ENST00000261667 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
KPNA3-201ENST00000261667 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa11.03□□□□□ -0.64
KPNA3-201ENST00000261667 FAM178BQ8IXR5 827 aa11.03□□□□□ -0.64
KPNA3-201ENST00000261667 PLEKHO2Q8TD55 490 aa11.03□□□□□ -0.64
KPNA3-201ENST00000261667 STARD8Q92502 1023 aa11.03□□□□□ -0.64
KPNA3-201ENST00000261667 FAF2Q96CS3 445 aa11.03□□□□□ -0.64
KPNA3-201ENST00000261667 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
KPNA3-201ENST00000261667 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 70.5 ms