RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000250495.9

NEDD8-201, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 8, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NEDD8, Length 708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-201ENST00000250495 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
NEDD8-201ENST00000250495 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
NEDD8-201ENST00000250495 AKAP3O75969 853 aa22.4■■□□□ 1.18
NEDD8-201ENST00000250495 CLSTN1O94985 981 aa22.4■■□□□ 1.18
NEDD8-201ENST00000250495 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
NEDD8-201ENST00000250495 MYL1P05976 194 aa22.4■■□□□ 1.18
NEDD8-201ENST00000250495 CCDC192P0DO97 292 aa22.4■■□□□ 1.18
NEDD8-201ENST00000250495 ZNF699Q32M78 642 aa22.4■■□□□ 1.18
NEDD8-201ENST00000250495 KMT5BQ4FZB7 885 aa22.4■■□□□ 1.18
NEDD8-201ENST00000250495 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
NEDD8-201ENST00000250495 PRR23CQ6ZRP0 262 aa22.4■■□□□ 1.18
NEDD8-201ENST00000250495 SYT13Q7L8C5 426 aa22.4■■□□□ 1.18
NEDD8-201ENST00000250495 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa22.4■■□□□ 1.18
NEDD8-201ENST00000250495 PLEKHO2Q8TD55 490 aa22.4■■□□□ 1.18
NEDD8-201ENST00000250495 ACDQ96AP0 544 aa22.4■■□□□ 1.18
NEDD8-201ENST00000250495 TNIP3Q96KP6 325 aa22.4■■□□□ 1.18
NEDD8-201ENST00000250495 RNF38Q9H0F5 515 aa22.4■■□□□ 1.18
NEDD8-201ENST00000250495 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
NEDD8-201ENST00000250495 CLDN5O00501 218 aa22.39■■□□□ 1.17
NEDD8-201ENST00000250495 PDXKO00764 312 aa22.39■■□□□ 1.17
NEDD8-201ENST00000250495 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
NEDD8-201ENST00000250495 CMA1P23946 247 aa22.39■■□□□ 1.17
NEDD8-201ENST00000250495 YWHAQP27348 245 aa22.39■■□□□ 1.17
NEDD8-201ENST00000250495 CACNA2D1P54289 1103 aa22.39■■□□□ 1.17
NEDD8-201ENST00000250495 CDH8P55286 799 aa22.39■■□□□ 1.17
NEDD8-201ENST00000250495 ZXDBP98169 803 aa22.39■■□□□ 1.17
NEDD8-201ENST00000250495 NCOA4Q13772 614 aa22.39■■□□□ 1.17
NEDD8-201ENST00000250495 KIAA0895Q8NCT3 520 aa22.39■■□□□ 1.17
NEDD8-201ENST00000250495 PDZD8Q8NEN9 1154 aa22.39■■□□□ 1.17
NEDD8-201ENST00000250495 CPQQ9Y646 472 aa22.39■■□□□ 1.17
NEDD8-201ENST00000250495 SPAG17Q6Q759 2223 aa22.39■■□□□ 1.17
NEDD8-201ENST00000250495 HELZP42694 1942 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
NEDD8-201ENST00000250495 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
NEDD8-201ENST00000250495 A0A1B0GVL5 298 aa22.38■■□□□ 1.17
NEDD8-201ENST00000250495 AXIN1O15169 862 aa22.38■■□□□ 1.17
NEDD8-201ENST00000250495 OLFM2O95897 454 aa22.38■■□□□ 1.17
NEDD8-201ENST00000250495 OAS1P00973 400 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
NEDD8-201ENST00000250495 P4HA1P13674 534 aa22.38■■□□□ 1.17
NEDD8-201ENST00000250495 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
NEDD8-201ENST00000250495 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa22.38■■□□□ 1.17
NEDD8-201ENST00000250495 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP22.38■■□□□ 1.17
NEDD8-201ENST00000250495 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa22.38■■□□□ 1.17
NEDD8-201ENST00000250495 OVCA2Q8WZ82 227 aa22.38■■□□□ 1.17
NEDD8-201ENST00000250495 MED10Q9BTT4 135 aa22.38■■□□□ 1.17
NEDD8-201ENST00000250495 KCTD10Q9H3F6 313 aa22.38■■□□□ 1.17
NEDD8-201ENST00000250495 SMYD3Q9H7B4 428 aa22.38■■□□□ 1.17
NEDD8-201ENST00000250495 TMEM30AQ9NV96 361 aa22.38■■□□□ 1.17
NEDD8-201ENST00000250495 DCDC2BA2VCK2 349 aa22.37■■□□□ 1.17
NEDD8-201ENST00000250495 SLC30A4O14863 429 aa22.37■■□□□ 1.17
NEDD8-201ENST00000250495 KIF20AO95235 890 aa22.37■■□□□ 1.17
NEDD8-201ENST00000250495 RPN1P04843 607 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
NEDD8-201ENST00000250495 PFKFB1P16118 471 aa22.37■■□□□ 1.17
NEDD8-201ENST00000250495 DMC1Q14565 340 aa22.37■■□□□ 1.17
NEDD8-201ENST00000250495 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa22.37■■□□□ 1.17
NEDD8-201ENST00000250495 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
NEDD8-201ENST00000250495 HHIPQ96QV1 700 aa22.37■■□□□ 1.17
NEDD8-201ENST00000250495 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa22.37■■□□□ 1.17
NEDD8-201ENST00000250495 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
NEDD8-201ENST00000250495 APBB3O95704 486 aa22.36■■□□□ 1.17
NEDD8-201ENST00000250495 NR3C1P04150 777 aa22.36■■□□□ 1.17
NEDD8-201ENST00000250495 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
NEDD8-201ENST00000250495 RAP1GAPP47736 663 aa22.36■■□□□ 1.17
NEDD8-201ENST00000250495 KBTBD6Q86V97 674 aa22.36■■□□□ 1.17
NEDD8-201ENST00000250495 TMC2Q8TDI7 906 aa22.36■■□□□ 1.17
NEDD8-201ENST00000250495 TAF4BQ92750 862 aa22.36■■□□□ 1.17
NEDD8-201ENST00000250495 FBXO32Q969P5 355 aa22.36■■□□□ 1.17
NEDD8-201ENST00000250495 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
NEDD8-201ENST00000250495 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
NEDD8-201ENST00000250495 SPATA32Q96LK8 384 aa22.36■■□□□ 1.17
NEDD8-201ENST00000250495 KCNK16Q96T55 309 aa22.36■■□□□ 1.17
NEDD8-201ENST00000250495 COMMD8Q9NX08 183 aa22.36■■□□□ 1.17
NEDD8-201ENST00000250495 SMPD4Q9NXE4 827 aa22.36■■□□□ 1.17
NEDD8-201ENST00000250495 TBC1D14Q9P2M4 693 aa22.36■■□□□ 1.17
NEDD8-201ENST00000250495 EBF1Q9UH73 591 aa22.36■■□□□ 1.17
NEDD8-201ENST00000250495 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
NEDD8-201ENST00000250495 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa22.36■■□□□ 1.17
NEDD8-201ENST00000250495 IKBKBO14920 756 aa22.35■■□□□ 1.17
NEDD8-201ENST00000250495 CALUO43852 315 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
NEDD8-201ENST00000250495 EPN2O95208 641 aa22.35■■□□□ 1.17
NEDD8-201ENST00000250495 VNN1O95497 513 aa22.35■■□□□ 1.17
NEDD8-201ENST00000250495 OPRD1P41143 372 aa22.35■■□□□ 1.17
NEDD8-201ENST00000250495 KRT85P78386 507 aa22.35■■□□□ 1.17
NEDD8-201ENST00000250495 ZACNQ401N2 412 aa22.35■■□□□ 1.17
NEDD8-201ENST00000250495 PAQR9Q6ZVX9 377 aa22.35■■□□□ 1.17
NEDD8-201ENST00000250495 FAM35AQ86V20 835 aa22.35■■□□□ 1.17
NEDD8-201ENST00000250495 SMARCD1Q96GM5 515 aa22.35■■□□□ 1.17
NEDD8-201ENST00000250495 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
NEDD8-201ENST00000250495 CFAP97Q9P2B7 532 aa22.35■■□□□ 1.17
NEDD8-201ENST00000250495 HPSEQ9Y251 543 aa22.35■■□□□ 1.17
NEDD8-201ENST00000250495 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa22.35■■□□□ 1.17
NEDD8-201ENST00000250495 K7EQS6 105 aa22.34■■□□□ 1.17
NEDD8-201ENST00000250495 CYP17A1P05093 508 aa22.34■■□□□ 1.17
NEDD8-201ENST00000250495 ZNF806P0C7X5 589 aa22.34■■□□□ 1.17
NEDD8-201ENST00000250495 DLG4P78352 724 aa22.34■■□□□ 1.17
NEDD8-201ENST00000250495 DHCR24Q15392 516 aa22.34■■□□□ 1.17
NEDD8-201ENST00000250495 HECTD3Q5T447 861 aa22.34■■□□□ 1.17
NEDD8-201ENST00000250495 SNX30Q5VWJ9 437 aa22.34■■□□□ 1.17
NEDD8-201ENST00000250495 CEP135Q66GS9 1140 aa22.34■■□□□ 1.17
NEDD8-201ENST00000250495 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa22.34■■□□□ 1.17
NEDD8-201ENST00000250495 ACOT1Q86TX2 421 aa22.34■■□□□ 1.17
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