RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233336.6

TTL-201, Transcript of tubulin tyrosine ligase, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTL, Length 14,269 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTL-201ENST00000233336 GGA2Q9UJY4 613 aa10.55□□□□□ -0.72
TTL-201ENST00000233336 TMEM94Q12767 1356 aa10.55□□□□□ -0.72
TTL-201ENST00000233336 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa10.54□□□□□ -0.72
TTL-201ENST00000233336 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP10.54□□□□□ -0.72
TTL-201ENST00000233336 CPS1P31327 1500 aa10.54□□□□□ -0.72
TTL-201ENST00000233336 CENPTQ96BT3 561 aa10.54□□□□□ -0.72
TTL-201ENST00000233336 SGF29Q96ES7 293 aa10.54□□□□□ -0.72
TTL-201ENST00000233336 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa10.54□□□□□ -0.72
TTL-201ENST00000233336 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP10.54□□□□□ -0.72
TTL-201ENST00000233336 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP10.54□□□□□ -0.72
TTL-201ENST00000233336 NDUFS3O75489 264 aa10.54□□□□□ -0.72
TTL-201ENST00000233336 KYAT1Q16773 422 aa10.54□□□□□ -0.72
TTL-201ENST00000233336 FUT11Q495W5 492 aa10.54□□□□□ -0.72
TTL-201ENST00000233336 TRIM69Q86WT6 500 aa10.54□□□□□ -0.72
TTL-201ENST00000233336 P3H2Q8IVL5 708 aa10.54□□□□□ -0.72
TTL-201ENST00000233336 SPON2Q9BUD6 331 aa10.54□□□□□ -0.72
TTL-201ENST00000233336 SAR1AQ9NR31 198 aa10.54□□□□□ -0.72
TTL-201ENST00000233336 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa10.54□□□□□ -0.72
TTL-201ENST00000233336 PRKCBP05771 671 aa10.54□□□□□ -0.72
TTL-201ENST00000233336 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP10.54□□□□□ -0.72
TTL-201ENST00000233336 USP33Q8TEY7 942 aa10.54□□□□□ -0.72
TTL-201ENST00000233336 EPS8L2Q9H6S3 715 aa10.54□□□□□ -0.72
TTL-201ENST00000233336 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP10.54□□□□□ -0.72
TTL-201ENST00000233336 NME5P56597 212 aa10.54□□□□□ -0.72
TTL-201ENST00000233336 C16orf86Q6ZW13 317 aa10.54□□□□□ -0.72
TTL-201ENST00000233336 LDHDQ86WU2 507 aa10.54□□□□□ -0.72
TTL-201ENST00000233336 DAGLBQ8NCG7 672 aa10.54□□□□□ -0.72
TTL-201ENST00000233336 EXD1Q8NHP7 514 aa10.54□□□□□ -0.72
TTL-201ENST00000233336 TBX20Q9UMR3 447 aa10.54□□□□□ -0.72
TTL-201ENST00000233336 SDR42E2A6NKP2 422 aa10.54□□□□□ -0.72
TTL-201ENST00000233336 SARSP49591 514 aaKnown RBP10.54□□□□□ -0.72
TTL-201ENST00000233336 MED15Q96RN5 788 aa10.54□□□□□ -0.72
TTL-201ENST00000233336 TRIM39Q9HCM9 518 aa10.54□□□□□ -0.72
TTL-201ENST00000233336 TRPC7Q9HCX4 862 aa10.54□□□□□ -0.72
TTL-201ENST00000233336 LRFN2Q9ULH4 789 aa10.54□□□□□ -0.72
TTL-201ENST00000233336 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP10.54□□□□□ -0.72
TTL-201ENST00000233336 RWDD3Q9Y3V2 267 aa10.54□□□□□ -0.72
TTL-201ENST00000233336 PCP4L1A6NKN8 68 aa10.54□□□□□ -0.72
TTL-201ENST00000233336 NR5A2O00482 541 aa10.54□□□□□ -0.72
TTL-201ENST00000233336 CUL2Q13617 745 aa10.54□□□□□ -0.72
TTL-201ENST00000233336 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP10.54□□□□□ -0.72
TTL-201ENST00000233336 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP10.54□□□□□ -0.72
TTL-201ENST00000233336 GZMAP12544 262 aa10.54□□□□□ -0.72
TTL-201ENST00000233336 C4BPBP20851 252 aa10.54□□□□□ -0.72
TTL-201ENST00000233336 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa10.54□□□□□ -0.72
TTL-201ENST00000233336 CASP4P49662 377 aa10.54□□□□□ -0.72
TTL-201ENST00000233336 C2CD6Q53TS8 623 aa10.54□□□□□ -0.72
TTL-201ENST00000233336 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa10.54□□□□□ -0.72
TTL-201ENST00000233336 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP10.54□□□□□ -0.72
TTL-201ENST00000233336 GMEB1Q9Y692 573 aa10.54□□□□□ -0.72
TTL-201ENST00000233336 TROAPQ12815 778 aa10.54□□□□□ -0.72
TTL-201ENST00000233336 TNIP3Q96KP6 325 aa10.54□□□□□ -0.72
TTL-201ENST00000233336 AGAP1Q9UPQ3 857 aa10.54□□□□□ -0.72
TTL-201ENST00000233336 AXIN2Q9Y2T1 843 aa10.54□□□□□ -0.72
TTL-201ENST00000233336 A0A0U1RQJ8 604 aa10.54□□□□□ -0.72
TTL-201ENST00000233336 GSNP06396 782 aa10.54□□□□□ -0.72
TTL-201ENST00000233336 FDFT1P37268 417 aa10.54□□□□□ -0.72
TTL-201ENST00000233336 TATDN2Q93075 761 aa10.54□□□□□ -0.72
TTL-201ENST00000233336 GCNAQ96QF7 691 aa10.54□□□□□ -0.72
TTL-201ENST00000233336 KLHL20Q9Y2M5 609 aa10.54□□□□□ -0.72
TTL-201ENST00000233336 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP10.53□□□□□ -0.72
TTL-201ENST00000233336 PSMG1O95456 288 aa10.53□□□□□ -0.72
TTL-201ENST00000233336 LRRC74AQ0VAA2 488 aa10.53□□□□□ -0.72
TTL-201ENST00000233336 SLC8A2Q9UPR5 921 aa10.53□□□□□ -0.72
TTL-201ENST00000233336 GLRBP48167 497 aa10.53□□□□□ -0.72
TTL-201ENST00000233336 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP10.53□□□□□ -0.72
TTL-201ENST00000233336 POU5F2Q8N7G0 328 aa10.53□□□□□ -0.72
TTL-201ENST00000233336 SPATA2Q9UM82 520 aa10.53□□□□□ -0.72
TTL-201ENST00000233336 MYRFQ9Y2G1 1151 aa10.53□□□□□ -0.72
TTL-201ENST00000233336 TBKBP1A7MCY6 615 aa10.53□□□□□ -0.72
TTL-201ENST00000233336 ANGPT1Q15389 498 aa10.53□□□□□ -0.72
TTL-201ENST00000233336 GALNTL6Q49A17 601 aa10.53□□□□□ -0.72
TTL-201ENST00000233336 IL31Q6EBC2 164 aa10.53□□□□□ -0.72
TTL-201ENST00000233336 KIAA0895Q8NCT3 520 aa10.53□□□□□ -0.72
TTL-201ENST00000233336 NIF3L1Q9GZT8 377 aa10.53□□□□□ -0.72
TTL-201ENST00000233336 KLHL31Q9H511 634 aa10.53□□□□□ -0.72
TTL-201ENST00000233336 PKP3Q9Y446 797 aa10.53□□□□□ -0.72
TTL-201ENST00000233336 STIP1P31948 543 aaKnown RBP10.53□□□□□ -0.72
TTL-201ENST00000233336 RBP5P82980 135 aa10.53□□□□□ -0.72
TTL-201ENST00000233336 TCP10LQ8TDR4 215 aa10.53□□□□□ -0.72
TTL-201ENST00000233336 FCGR1AP12314 374 aa10.53□□□□□ -0.72
TTL-201ENST00000233336 BNIPLQ7Z465 357 aa10.53□□□□□ -0.72
TTL-201ENST00000233336 PYDC1Q8WXC3 89 aa10.53□□□□□ -0.72
TTL-201ENST00000233336 TBC1D12O60347 775 aa10.53□□□□□ -0.72
TTL-201ENST00000233336 NCKAP1LP55160 1127 aa10.53□□□□□ -0.72
TTL-201ENST00000233336 PSMC6P62333 389 aa10.53□□□□□ -0.72
TTL-201ENST00000233336 PLIN5Q00G26 463 aa10.53□□□□□ -0.72
TTL-201ENST00000233336 SLC9A5Q14940 896 aa10.53□□□□□ -0.72
TTL-201ENST00000233336 C17orf50Q8WW18 174 aa10.53□□□□□ -0.72
TTL-201ENST00000233336 ZNF560Q96MR9 790 aa10.53□□□□□ -0.72
TTL-201ENST00000233336 DEPDC7Q96QD5 511 aa10.53□□□□□ -0.72
TTL-201ENST00000233336 IL12RB1P42701 662 aa10.53□□□□□ -0.72
TTL-201ENST00000233336 SLC1A6P48664 564 aa10.53□□□□□ -0.72
TTL-201ENST00000233336 NEDD8Q15843 81 aa10.53□□□□□ -0.72
TTL-201ENST00000233336 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP10.53□□□□□ -0.72
TTL-201ENST00000233336 CD302Q8IX05 232 aa10.53□□□□□ -0.72
TTL-201ENST00000233336 RIC8BQ9NVN3 520 aa10.53□□□□□ -0.72
TTL-201ENST00000233336 STK39Q9UEW8 545 aa10.53□□□□□ -0.72
TTL-201ENST00000233336 SPDYE5A6NIY4 337 aa10.53□□□□□ -0.72
TTL-201ENST00000233336 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP10.53□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.1 ms