RNA–Protein interactions for RNA: YLR117C

CLF1, Transcript of Member of the NineTeen Complex (NTC), yeast

Gene CLF1, Length 2,064 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CLF1	YLR117C	HAL1	Q01766	294 aa		3.81	□□□□□ -1.8
CLF1	YLR117C	PBA1	Q05778	276 aa		3.81	□□□□□ -1.8
CLF1	YLR117C	RPL16B	P26785	198 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
CLF1	YLR117C	MED6	P38782	295 aa		3.8	□□□□□ -1.8
CLF1	YLR117C	ECO1	P43605	281 aa		3.8	□□□□□ -1.8
CLF1	YLR117C	EMC6	Q12431	108 aa		3.8	□□□□□ -1.8
CLF1	YLR117C	TOS6	P48560	102 aa		3.8	□□□□□ -1.8
CLF1	YLR117C	NRM1	P53718	249 aa		3.8	□□□□□ -1.8
CLF1	YLR117C	YAL064W-B	O13512	126 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CLF1	YLR117C	LDB16	P25587	256 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CLF1	YLR117C	HSP150	P32478	413 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CLF1	YLR117C	MPC2	P38857	129 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CLF1	YLR117C	PEX22	P39718	180 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CLF1	YLR117C	RSM19	P53733	91 aa	Predicted RBP	3.79	□□□□□ -1.8
CLF1	YLR117C	YMR181C	Q03231	154 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CLF1	YLR117C	TRS23	Q03784	219 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CLF1	YLR117C	FPR1	P20081	114 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
CLF1	YLR117C	YCR022C	P25620	114 aa		3.78	□□□□□ -1.8
CLF1	YLR117C	SPI1	P40092	148 aa		3.78	□□□□□ -1.8
CLF1	YLR117C	YIL029C	P40538	142 aa		3.78	□□□□□ -1.8
CLF1	YLR117C	NIP7	Q08962	181 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
CLF1	YLR117C	NCE102	Q12207	173 aa	RIP-Chip data	3.78	□□□□□ -1.8	not detected
CLF1	YLR117C	ARF1	P11076	181 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
CLF1	YLR117C	YBR209W	P38311	105 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CLF1	YLR117C	YFL019C	P43576	117 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CLF1	YLR117C	YGR018C	P53211	109 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CLF1	YLR117C	PRM7	Q12459	698 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CLF1	YLR117C	RPL11B	Q3E757	174 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
CLF1	YLR117C	RPS14A	P06367	137 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
CLF1	YLR117C	YSF3	P0C074	85 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
CLF1	YLR117C	RPL11A	P0C0W9	174 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
CLF1	YLR117C	CTR2	P38865	189 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CLF1	YLR117C	RPS14B	P39516	138 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
CLF1	YLR117C	RPS26A	P39938	119 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
CLF1	YLR117C	RPS26B	P39939	119 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
CLF1	YLR117C	DCV1	P43595	202 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CLF1	YLR117C	YNL046W	P53956	172 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CLF1	YLR117C	YDR246W-A	Q3E763	66 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CLF1	YLR117C	TDA8	Q6B2U8	126 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CLF1	YLR117C	YHR213W	P0CI67	198 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CLF1	YLR117C	YKL097C	P34245	136 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CLF1	YLR117C	MTC6	P38849	526 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CLF1	YLR117C	PCP1	P53259	346 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CLF1	YLR117C	RRT15	Q3E811	62 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CLF1	YLR117C	RPL28	P02406	149 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
CLF1	YLR117C	MSA2	P36157	363 aa		3.75	□□□□□ -1.81
CLF1	YLR117C	YNL190W	P53872	204 aa		3.75	□□□□□ -1.81
CLF1	YLR117C	YML122C	Q03207	126 aa		3.75	□□□□□ -1.81
CLF1	YLR117C	PPT2	Q12036	173 aa		3.75	□□□□□ -1.81
CLF1	YLR117C	YLR342W-A	Q3E810	57 aa		3.75	□□□□□ -1.81
CLF1	YLR117C	YDR034W-B	Q6Q5X2	51 aa		3.75	□□□□□ -1.81
CLF1	YLR117C	MXR2	P25566	168 aa		3.75	□□□□□ -1.81
CLF1	YLR117C	YBL071C	P38185	102 aa		3.75	□□□□□ -1.81
CLF1	YLR117C	MRPS12	P53732	153 aa		3.75	□□□□□ -1.81
CLF1	YLR117C	YHR022C	P38763	256 aa		3.74	□□□□□ -1.81
CLF1	YLR117C	PBP4	Q07362	185 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
CLF1	YLR117C	HUR1	P45820	110 aa		3.74	□□□□□ -1.81
CLF1	YLR117C	MIC10	Q96VH5	97 aa		3.74	□□□□□ -1.81
CLF1	YLR117C	CCW14	O13547	238 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CLF1	YLR117C	ATP15	P21306	62 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CLF1	YLR117C	SPT4	P32914	102 aa	Predicted RBP	3.73	□□□□□ -1.81
CLF1	YLR117C	AIM4	P38305	123 aa	Predicted RBP	3.73	□□□□□ -1.81
CLF1	YLR117C	GLO1	P50107	326 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CLF1	YLR117C	YDL009C	Q12210	107 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CLF1	YLR117C	YLR285C-A	Q3E771	56 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CLF1	YLR117C	YOR008C-A	Q3E7B9	74 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CLF1	YLR117C	SPS100	P13130	326 aa		3.72	□□□□□ -1.81
CLF1	YLR117C	RPS27A	P35997	82 aa	Known RBP	3.72	□□□□□ -1.81
CLF1	YLR117C	RPS27B	P38711	82 aa		3.72	□□□□□ -1.81
CLF1	YLR117C	GAT4	P40569	121 aa		3.72	□□□□□ -1.81
CLF1	YLR117C	PIR5	P46999	287 aa		3.72	□□□□□ -1.81
CLF1	YLR117C	ICY1	Q04329	127 aa		3.72	□□□□□ -1.81
CLF1	YLR117C	NAG1	Q8TGN9	163 aa		3.72	□□□□□ -1.81
CLF1	YLR117C	URM1	P40554	99 aa	Predicted RBP	3.72	□□□□□ -1.81
CLF1	YLR117C	KEG1	P43614	200 aa		3.72	□□□□□ -1.81
CLF1	YLR117C	YOR268C	Q08734	132 aa		3.72	□□□□□ -1.81
CLF1	YLR117C	YHR214C-D	P0CX93	97 aa		3.71	□□□□□ -1.82
CLF1	YLR117C	SUT1	P53032	299 aa	Known RBP	3.71	□□□□□ -1.82
CLF1	YLR117C	ERI1	P62651	68 aa	Known RBP	3.71	□□□□□ -1.82
CLF1	YLR117C	YLR156W	P0CE96	114 aa		3.71	□□□□□ -1.82
CLF1	YLR117C	YLR159W	P0CE97	114 aa		3.71	□□□□□ -1.82
CLF1	YLR117C	YLR161W	P0CE98	114 aa		3.71	□□□□□ -1.82
CLF1	YLR117C	MIG3	P39943	394 aa		3.71	□□□□□ -1.82
CLF1	YLR117C	ATP20	Q12233	115 aa		3.71	□□□□□ -1.82
CLF1	YLR117C	RPL16A	P26784	199 aa	Known RBP	3.7	□□□□□ -1.82
CLF1	YLR117C	PEX17	P40155	199 aa		3.7	□□□□□ -1.82
CLF1	YLR117C	IMP2	P46972	177 aa		3.7	□□□□□ -1.82
CLF1	YLR117C	ICS3	P47034	131 aa		3.7	□□□□□ -1.82
CLF1	YLR117C	FAB1	P34756	2278 aa		3.7	□□□□□ -1.82
CLF1	YLR117C	YBL081W	P38180	368 aa	Known RBP	3.69	□□□□□ -1.82
CLF1	YLR117C	SHU1	P38751	150 aa		3.69	□□□□□ -1.82
CLF1	YLR117C	PGU1	P47180	361 aa		3.69	□□□□□ -1.82
CLF1	YLR117C	YNL234W	P53857	426 aa		3.69	□□□□□ -1.82
CLF1	YLR117C	SMD1	Q02260	146 aa	Predicted RBP	3.69	□□□□□ -1.82
CLF1	YLR117C	YKR073C	P36153	106 aa		3.69	□□□□□ -1.82
CLF1	YLR117C	YMR295C	Q03559	197 aa		3.69	□□□□□ -1.82
CLF1	YLR117C	IRC21	Q04772	201 aa		3.68	□□□□□ -1.82
CLF1	YLR117C	BLM10	P43583	2143 aa		3.68	□□□□□ -1.82
CLF1	YLR117C	YAL065C	O13511	128 aa		3.67	□□□□□ -1.82
CLF1	YLR117C	KRE9	P39005	276 aa		3.67	□□□□□ -1.82

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