RNA–Protein interactions for RNA: YKR041W

YKR041W, Transcript of Protein of unknown function, yeast

Gene YKR041W, Length 753 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YKR041W	YKR041W	YCR085W	P25650	117 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YKR041W	YKR041W	YNL194C	P40169	301 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YKR041W	YKR041W	YNL234W	P53857	426 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YKR041W	YKR041W	SNA4	Q07549	140 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YKR041W	YKR041W	MSA1	Q08471	629 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YKR041W	YKR041W	CCW12	Q12127	133 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YKR041W	YKR041W	DFM1	Q12743	341 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
YKR041W	YKR041W	YER175W-A	Q8TGU4	54 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YKR041W	YKR041W	BPH1	P25356	2167 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YKR041W	YKR041W	RPS8A	P0CX39	200 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
YKR041W	YKR041W	RPS8B	P0CX40	200 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
YKR041W	YKR041W	INO4	P13902	151 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YKR041W	YKR041W	PEX17	P40155	199 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YKR041W	YKR041W	AIM11	P87275	137 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YKR041W	YKR041W	DCV1	P43595	202 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YKR041W	YKR041W	YAR1	P46683	200 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YKR041W	YKR041W	YNR077C	P53758	84 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YKR041W	YKR041W	IRC23	Q08416	157 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YKR041W	YKR041W	MRPL23	Q12487	163 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
YKR041W	YKR041W	SPO24	Q3E752	67 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YKR041W	YKR041W	ISD11	Q6Q560	94 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YKR041W	YKR041W	CDC43	P18898	376 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YKR041W	YKR041W	YHR022C	P38763	256 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YKR041W	YKR041W	FCY1	Q12178	158 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YKR041W	YKR041W	TRP1	P00912	224 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YKR041W	YKR041W	Q0255	P03881	472 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YKR041W	YKR041W	QCR8	P08525	94 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YKR041W	YKR041W	COX10	P21592	462 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YKR041W	YKR041W	YEL067C	P39978	195 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YKR041W	YKR041W	AIM34	Q03673	198 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YKR041W	YKR041W	RRG8	Q06109	277 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YKR041W	YKR041W	YBR200W-A	Q3E755	54 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YKR041W	YKR041W	YNL146C-A	Q3E7Z1	64 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YKR041W	YKR041W	YER085C	P40058	173 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YKR041W	YKR041W	YCH1	P42937	148 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YKR041W	YKR041W	YFL065C	P43539	102 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YKR041W	YKR041W	YPR203W	Q08994	102 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YKR041W	YKR041W	YCR075W-A	Q3E830	75 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YKR041W	YKR041W	YOR304C-A	O14468	76 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YKR041W	YKR041W	YDL022C-A	P0C5L6	82 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YKR041W	YKR041W	RPA12	P32529	125 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
YKR041W	YKR041W	YFR057W	P43625	151 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YKR041W	YKR041W	YJR146W	P47174	117 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YKR041W	YKR041W	RPL18A	P0CX49	186 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
YKR041W	YKR041W	RPL18B	P0CX50	186 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
YKR041W	YKR041W	ATP15	P21306	62 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YKR041W	YKR041W	RPL16A	P26784	199 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
YKR041W	YKR041W	YHR130C	P38834	111 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YKR041W	YKR041W	YAR029W	P39549	74 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YKR041W	YKR041W	FIP1	P45976	327 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YKR041W	YKR041W	RAD6	P06104	172 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YKR041W	YKR041W	KRE1	P17260	313 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YKR041W	YKR041W	INO2	P26798	304 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YKR041W	YKR041W	UGX2	P32772	223 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YKR041W	YKR041W	EOS1	P53938	366 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YKR041W	YKR041W	PPT2	Q12036	173 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YKR041W	YKR041W	YFL041W-A	Q3E817	63 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YKR041W	YKR041W	RPL16B	P26785	198 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
YKR041W	YKR041W	NRG2	P38082	220 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YKR041W	YKR041W	SHU1	P38751	150 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YKR041W	YKR041W	VTC1	P40046	129 aa	RIP-Chip data	4.08	□□□□□ -1.76	not detected
YKR041W	YKR041W	VHS2	P40463	436 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YKR041W	YKR041W	YIR020C	P40575	100 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YKR041W	YKR041W	TOS8	P53147	276 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YKR041W	YKR041W	YNL184C	P53876	108 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YKR041W	YKR041W	COX12	Q01519	83 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YKR041W	YKR041W	RPL28	P02406	149 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
YKR041W	YKR041W	SKI6	P46948	246 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
YKR041W	YKR041W	SPG4	Q04438	115 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YKR041W	YKR041W	YLR042C	Q07990	161 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YKR041W	YKR041W	YAL063C-A	Q3E791	96 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YKR041W	YKR041W	YIA6	P40556	373 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YKR041W	YKR041W	VPS55	P47111	140 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YKR041W	YKR041W	MRPS12	P53732	153 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YKR041W	YKR041W	ABF2	Q02486	183 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YKR041W	YKR041W	YML122C	Q03207	126 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YKR041W	YKR041W	HOR7	Q05827	59 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YKR041W	YKR041W	PRM7	Q12459	698 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YKR041W	YKR041W	YOR011W-A	Q3E807	68 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YKR041W	YKR041W	YER135C	P40082	130 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YKR041W	YKR041W	SIM1	P40472	476 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YKR041W	YKR041W	WWM1	P43582	211 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
YKR041W	YKR041W	HUR1	P45820	110 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YKR041W	YKR041W	PMP3	P87284	55 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YKR041W	YKR041W	MRPS8	Q03799	155 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YKR041W	YKR041W	YOR020W-A	Q3E824	90 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YKR041W	YKR041W	YCL021W-A	Q96VH3	125 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YKR041W	YKR041W	SPS100	P13130	326 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YKR041W	YKR041W	MRPL24	P36525	258 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
YKR041W	YKR041W	DSE2	P38844	325 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YKR041W	YKR041W	AIM19	P40502	157 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YKR041W	YKR041W	YDL186W	P48568	277 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YKR041W	YKR041W	YMR317W	Q04893	1140 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YKR041W	YKR041W	YIR021W-A	Q3E739	70 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YKR041W	YKR041W	YOL085C	Q99345	113 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YKR041W	YKR041W	VMA11	P32842	164 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YKR041W	YKR041W	YEL008W	P40001	126 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YKR041W	YKR041W	YGR025W	P53216	100 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YKR041W	YKR041W	RGM1	Q00453	211 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YKR041W	YKR041W	YMR244W	Q04018	355 aa		4.03	□□□□□ -1.76

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 15.3 ms