RNA–Protein interactions for RNA: YJL104W

PAM16, Transcript of Subunit of the import motor (PAM complex), yeast

Gene PAM16, Length 450 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PAM16	YJL104W	PKR1	Q03880	122 aa	Known RBP	0.47	□□□□□ -2.33
PAM16	YJL104W	YDL241W	Q07738	123 aa		0.47	□□□□□ -2.33
PAM16	YJL104W	FCF2	Q12035	217 aa	Predicted RBP	0.47	□□□□□ -2.33
PAM16	YJL104W	YOR015W	Q12169	119 aa		0.47	□□□□□ -2.33
PAM16	YJL104W	COA3	Q3E7B2	85 aa		0.47	□□□□□ -2.33
PAM16	YJL104W	YHR139C-A	O13536	103 aa		0.46	□□□□□ -2.34
PAM16	YJL104W	SEC4	P07560	215 aa	Known RBP	0.46	□□□□□ -2.34
PAM16	YJL104W	NTF2	P33331	125 aa	Known RBP	0.46	□□□□□ -2.34
PAM16	YJL104W	MSA2	P36157	363 aa		0.46	□□□□□ -2.34
PAM16	YJL104W	PET8	P38921	284 aa		0.46	□□□□□ -2.34
PAM16	YJL104W	SNL1	P40548	159 aa		0.46	□□□□□ -2.34
PAM16	YJL104W	HIT1	P46973	164 aa		0.46	□□□□□ -2.34
PAM16	YJL104W	YJL009W	P47078	108 aa		0.46	□□□□□ -2.34
PAM16	YJL104W	AIM11	P87275	137 aa		0.46	□□□□□ -2.34
PAM16	YJL104W	GRX5	Q02784	150 aa		0.46	□□□□□ -2.34
PAM16	YJL104W	YML079W	Q03629	201 aa		0.46	□□□□□ -2.34
PAM16	YJL104W	MGR3	Q04472	501 aa		0.46	□□□□□ -2.34
PAM16	YJL104W	GTO3	Q04806	366 aa		0.46	□□□□□ -2.34
PAM16	YJL104W	SYM1	Q06563	197 aa		0.46	□□□□□ -2.34
PAM16	YJL104W	DCN1	Q12395	269 aa		0.46	□□□□□ -2.34
PAM16	YJL104W	YML054C-A	Q3E809	52 aa		0.46	□□□□□ -2.34
PAM16	YJL104W	MED11	Q99278	115 aa		0.46	□□□□□ -2.34
PAM16	YJL104W	POR1	P04840	283 aa	Known RBP	0.45	□□□□□ -2.34
PAM16	YJL104W	HMRA2	P0CY13	119 aa		0.45	□□□□□ -2.34
PAM16	YJL104W	SPT4	P32914	102 aa	Predicted RBP	0.45	□□□□□ -2.34
PAM16	YJL104W	PAU7	P39545	55 aa		0.45	□□□□□ -2.34
PAM16	YJL104W	HPA3	P39979	161 aa		0.45	□□□□□ -2.34
PAM16	YJL104W	MVB12	P42939	101 aa		0.45	□□□□□ -2.34
PAM16	YJL104W	PAU5	P43575	122 aa		0.45	□□□□□ -2.34
PAM16	YJL104W	RIB4	P50861	169 aa	Predicted RBP	0.45	□□□□□ -2.34
PAM16	YJL104W	YGL230C	P53074	147 aa		0.45	□□□□□ -2.34
PAM16	YJL104W	THG1	P53215	237 aa	Known RBP	0.45	□□□□□ -2.34
PAM16	YJL104W	COF1	Q03048	143 aa	Known RBP	0.45	□□□□□ -2.34
PAM16	YJL104W	YMR295C	Q03559	197 aa		0.45	□□□□□ -2.34
PAM16	YJL104W	GPI19	Q04082	140 aa		0.45	□□□□□ -2.34
PAM16	YJL104W	SPC24	Q04477	213 aa		0.45	□□□□□ -2.34
PAM16	YJL104W	YOR072W	Q08486	104 aa		0.45	□□□□□ -2.34
PAM16	YJL104W	YPL257W	Q08974	193 aa		0.45	□□□□□ -2.34
PAM16	YJL104W	HTZ1	Q12692	134 aa	Known RBP	0.45	□□□□□ -2.34
PAM16	YJL104W	YOR020W-A	Q3E824	90 aa		0.45	□□□□□ -2.34
PAM16	YJL104W	SCS22	Q6Q595	175 aa		0.45	□□□□□ -2.34
PAM16	YJL104W	YLR236C	A0A023PZG4	107 aa		0.44	□□□□□ -2.34
PAM16	YJL104W	TAL1	P15019	335 aa	Known RBP	0.44	□□□□□ -2.34
PAM16	YJL104W	YCR016W	P25617	290 aa	Known RBP	0.44	□□□□□ -2.34
PAM16	YJL104W	ACB1	P31787	87 aa		0.44	□□□□□ -2.34
PAM16	YJL104W	ZRT1	P32804	376 aa		0.44	□□□□□ -2.34
PAM16	YJL104W	YKR070W	P36151	352 aa	Known RBP	0.44	□□□□□ -2.34
PAM16	YJL104W	YBR292C	P38357	123 aa		0.44	□□□□□ -2.34
PAM16	YJL104W	RPB11	P38902	120 aa		0.44	□□□□□ -2.34
PAM16	YJL104W	YEA6	P39953	335 aa		0.44	□□□□□ -2.34
PAM16	YJL104W	YEL008W	P40001	126 aa		0.44	□□□□□ -2.34
PAM16	YJL104W	YER134C	P40081	178 aa		0.44	□□□□□ -2.34
PAM16	YJL104W	YER187W	P40102	141 aa		0.44	□□□□□ -2.34
PAM16	YJL104W	HUA1	P40325	198 aa		0.44	□□□□□ -2.34
PAM16	YJL104W	YGR269W	P40326	108 aa		0.44	□□□□□ -2.34
PAM16	YJL104W	FMP33	P46998	180 aa		0.44	□□□□□ -2.34
PAM16	YJL104W	DAN1	P47178	298 aa		0.44	□□□□□ -2.34
PAM16	YJL104W	MRPL50	P53724	139 aa		0.44	□□□□□ -2.34
PAM16	YJL104W	BSC4	P53841	131 aa		0.44	□□□□□ -2.34
PAM16	YJL104W	YCL001W-A	P87012	153 aa		0.44	□□□□□ -2.34
PAM16	YJL104W	CWC27	Q02770	301 aa		0.44	□□□□□ -2.34
PAM16	YJL104W	YOR385W	Q08909	290 aa		0.44	□□□□□ -2.34
PAM16	YJL104W	POM33	Q12164	279 aa		0.44	□□□□□ -2.34
PAM16	YJL104W	TPT1	Q12272	230 aa	Known RBP	0.44	□□□□□ -2.34
PAM16	YJL104W	SME1	Q12330	94 aa	Predicted RBP	0.44	□□□□□ -2.34
PAM16	YJL104W	RPS22B	Q3E7Y3	130 aa	Known RBP	0.44	□□□□□ -2.34
PAM16	YJL104W	COA2	Q3E823	68 aa		0.44	□□□□□ -2.34
PAM16	YJL104W	YAL065C	O13511	128 aa		0.43	□□□□□ -2.34
PAM16	YJL104W	STF1	P01098	86 aa		0.43	□□□□□ -2.34
PAM16	YJL104W	RPS22A	P0C0W1	130 aa	Known RBP	0.43	□□□□□ -2.34
PAM16	YJL104W	YHR073W-A	P0C5N7	58 aa		0.43	□□□□□ -2.34
PAM16	YJL104W	PAU19	P0CE85	124 aa		0.43	□□□□□ -2.34
PAM16	YJL104W	PAU21	P0CE86	164 aa		0.43	□□□□□ -2.34
PAM16	YJL104W	PAU22	P0CE87	164 aa		0.43	□□□□□ -2.34
PAM16	YJL104W	PAU3	P25610	124 aa		0.43	□□□□□ -2.34
PAM16	YJL104W	PAM17	P36147	197 aa		0.43	□□□□□ -2.34
PAM16	YJL104W	YBR027C	P38220	110 aa		0.43	□□□□□ -2.34
PAM16	YJL104W	YBR219C	P38317	127 aa		0.43	□□□□□ -2.34
PAM16	YJL104W	CYB5	P40312	120 aa		0.43	□□□□□ -2.34
PAM16	YJL104W	YIA6	P40556	373 aa		0.43	□□□□□ -2.34
PAM16	YJL104W	PAU15	P40585	124 aa		0.43	□□□□□ -2.34
PAM16	YJL104W	YAR1	P46683	200 aa		0.43	□□□□□ -2.34
PAM16	YJL104W	MOG1	P47123	218 aa		0.43	□□□□□ -2.34
PAM16	YJL104W	YJR128W	P47162	119 aa		0.43	□□□□□ -2.34
PAM16	YJL104W	YNL190W	P53872	204 aa		0.43	□□□□□ -2.34
PAM16	YJL104W	TIM11	P81449	96 aa	Predicted RBP	0.43	□□□□□ -2.34
PAM16	YJL104W	ATP19	P81451	68 aa		0.43	□□□□□ -2.34
PAM16	YJL104W	FYV7	Q12247	151 aa		0.43	□□□□□ -2.34
PAM16	YJL104W	SMT3	Q12306	101 aa	Known RBP	0.43	□□□□□ -2.34
PAM16	YJL104W	WIP1	Q2V2P8	89 aa		0.43	□□□□□ -2.34
PAM16	YJL104W	YOR008C-A	Q3E7B9	74 aa		0.43	□□□□□ -2.34
PAM16	YJL104W	YJL127C-B	Q3E828	52 aa		0.43	□□□□□ -2.34
PAM16	YJL104W	RPL31A	P0C2H8	113 aa	Known RBP	0.42	□□□□□ -2.34
PAM16	YJL104W	FUN14	P18411	198 aa		0.42	□□□□□ -2.34
PAM16	YJL104W	PAU16	P35994	123 aa		0.42	□□□□□ -2.34
PAM16	YJL104W	MRPL11	P36521	249 aa	Predicted RBP	0.42	□□□□□ -2.34
PAM16	YJL104W	YBR016W	P38216	128 aa		0.42	□□□□□ -2.34
PAM16	YJL104W	MBA1	P38300	278 aa		0.42	□□□□□ -2.34
PAM16	YJL104W	SMD3	P43321	101 aa	Known RBP	0.42	□□□□□ -2.34
PAM16	YJL104W	ERV14	P53173	138 aa		0.42	□□□□□ -2.34

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