RNA–Protein interactions for RNA: Q0297

Q0297, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene Q0297, Length 156 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
Q0297	Q0297	TRP1	P00912	224 aa		12.01	□□□□□ -0.49
Q0297	Q0297	PCL2	P25693	308 aa		12.01	□□□□□ -0.49
Q0297	Q0297	YCL021W-A	Q96VH3	125 aa		12.01	□□□□□ -0.49
Q0297	Q0297	TOS6	P48560	102 aa		12	□□□□□ -0.49
Q0297	Q0297	PKR1	Q03880	122 aa	Known RBP	11.99	□□□□□ -0.49
Q0297	Q0297	URM1	P40554	99 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
Q0297	Q0297	ERV14	P53173	138 aa		11.98	□□□□□ -0.49
Q0297	Q0297	BET5	Q03630	159 aa		11.97	□□□□□ -0.49
Q0297	Q0297	YEL008W	P40001	126 aa		11.95	□□□□□ -0.5
Q0297	Q0297	OST3	P48439	350 aa		11.95	□□□□□ -0.5
Q0297	Q0297	ARL3	Q02804	198 aa		11.95	□□□□□ -0.5
Q0297	Q0297	MED7	Q08278	222 aa		11.95	□□□□□ -0.5
Q0297	Q0297	MRP10	O75012	95 aa		11.94	□□□□□ -0.5
Q0297	Q0297	YDR034C-A	P0C289	58 aa		11.94	□□□□□ -0.5
Q0297	Q0297	HMRA2	P0CY13	119 aa		11.94	□□□□□ -0.5
Q0297	Q0297	GSP1	P32835	219 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
Q0297	Q0297	GSP2	P32836	220 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
Q0297	Q0297	YPL229W	Q99395	206 aa		11.94	□□□□□ -0.5
Q0297	Q0297	ENV10	Q99382	181 aa		11.93	□□□□□ -0.5
Q0297	Q0297	HTL1	Q9URQ5	78 aa		11.92	□□□□□ -0.5
Q0297	Q0297	YAL064W	P39711	94 aa		11.91	□□□□□ -0.5
Q0297	Q0297	YER134C	P40081	178 aa		11.91	□□□□□ -0.5
Q0297	Q0297	TPT1	Q12272	230 aa	Known RBP	11.89	□□□□□ -0.51
Q0297	Q0297	RPC10	P40422	70 aa		11.87	□□□□□ -0.51
Q0297	Q0297	TIM11	P81449	96 aa	Predicted RBP	11.87	□□□□□ -0.51
Q0297	Q0297	YML108W	Q03759	105 aa		11.87	□□□□□ -0.51
Q0297	Q0297	YBR219C	P38317	127 aa		11.86	□□□□□ -0.51
Q0297	Q0297	YAR029W	P39549	74 aa		11.86	□□□□□ -0.51
Q0297	Q0297	YBL081W	P38180	368 aa	Known RBP	11.85	□□□□□ -0.51
Q0297	Q0297	NUP42	P49686	430 aa	Known RBP	11.85	□□□□□ -0.51
Q0297	Q0297	YDR042C	Q03205	200 aa		11.85	□□□□□ -0.51
Q0297	Q0297	RPL31A	P0C2H8	113 aa	Known RBP	11.84	□□□□□ -0.51
Q0297	Q0297	POP3	P53833	195 aa	Predicted RBP	11.84	□□□□□ -0.51
Q0297	Q0297	COA3	Q3E7B2	85 aa		11.84	□□□□□ -0.51
Q0297	Q0297	CIN5	P40917	295 aa		11.82	□□□□□ -0.52
Q0297	Q0297	SNA2	P56508	79 aa		11.82	□□□□□ -0.52
Q0297	Q0297	YMR295C	Q03559	197 aa		11.82	□□□□□ -0.52
Q0297	Q0297	SAP30	P38429	201 aa		11.81	□□□□□ -0.52
Q0297	Q0297	YDR029W	Q12111	104 aa		11.81	□□□□□ -0.52
Q0297	Q0297	YLR112W	Q12130	139 aa		11.81	□□□□□ -0.52
Q0297	Q0297	RPL27B	P0C2H7	136 aa	Known RBP	11.8	□□□□□ -0.52
Q0297	Q0297	APS1	P35181	156 aa		11.8	□□□□□ -0.52
Q0297	Q0297	YMR175W-A	Q3E766	64 aa		11.79	□□□□□ -0.52
Q0297	Q0297	ATP15	P21306	62 aa		11.78	□□□□□ -0.52
Q0297	Q0297	YMR103C	Q04436	120 aa		11.76	□□□□□ -0.53
Q0297	Q0297	CMC2	Q3E7A4	109 aa		11.76	□□□□□ -0.53
Q0297	Q0297	MRPL33	P20084	86 aa		11.75	□□□□□ -0.53
Q0297	Q0297	FYV4	P38783	130 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
Q0297	Q0297	YLR194C	Q05777	254 aa		11.74	□□□□□ -0.53
Q0297	Q0297	SSS1	P35179	80 aa		11.7	□□□□□ -0.54
Q0297	Q0297	YKL070W	P36087	169 aa		11.7	□□□□□ -0.54
Q0297	Q0297	VTC1	P40046	129 aa	RIP-Chip data	11.7	□□□□□ -0.54	not detected
Q0297	Q0297	CUE4	Q04201	117 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
Q0297	Q0297	DFM1	Q12743	341 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
Q0297	Q0297	YAL065C	O13511	128 aa		11.67	□□□□□ -0.54
Q0297	Q0297	SHU1	P38751	150 aa		11.65	□□□□□ -0.54
Q0297	Q0297	AIM11	P87275	137 aa		11.65	□□□□□ -0.54
Q0297	Q0297	SMP1	P38128	452 aa		11.64	□□□□□ -0.55
Q0297	Q0297	MRPL11	P36521	249 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
Q0297	Q0297	SEN15	Q04675	128 aa		11.62	□□□□□ -0.55
Q0297	Q0297	YDL241W	Q07738	123 aa		11.62	□□□□□ -0.55
Q0297	Q0297	YLR307C-A	Q3E825	87 aa		11.62	□□□□□ -0.55
Q0297	Q0297	YPL261C	Q08976	102 aa		11.61	□□□□□ -0.55
Q0297	Q0297	PAU16	P35994	123 aa		11.6	□□□□□ -0.55
Q0297	Q0297	COX14	P39103	70 aa		11.6	□□□□□ -0.55
Q0297	Q0297	PPT2	Q12036	173 aa		11.6	□□□□□ -0.55
Q0297	Q0297	YIL134C-A	Q45U18	67 aa		11.6	□□□□□ -0.55
Q0297	Q0297	LCL1	Q02786	101 aa		11.59	□□□□□ -0.55
Q0297	Q0297	YLR050C	Q12155	161 aa	Known RBP	11.59	□□□□□ -0.55
Q0297	Q0297	PEX22	P39718	180 aa		11.58	□□□□□ -0.56
Q0297	Q0297	CNL1	Q06333	122 aa		11.58	□□□□□ -0.56
Q0297	Q0297	SCS22	Q6Q595	175 aa		11.58	□□□□□ -0.56
Q0297	Q0297	RPL18A	P0CX49	186 aa	Known RBP	11.57	□□□□□ -0.56
Q0297	Q0297	RPL18B	P0CX50	186 aa	Known RBP	11.57	□□□□□ -0.56
Q0297	Q0297	PEX17	P40155	199 aa		11.56	□□□□□ -0.56
Q0297	Q0297	AQY2	P0CD90	149 aa		11.55	□□□□□ -0.56
Q0297	Q0297	TOA2	P32774	122 aa		11.55	□□□□□ -0.56
Q0297	Q0297	SMD1	Q02260	146 aa	Predicted RBP	11.55	□□□□□ -0.56
Q0297	Q0297	RPL32	P38061	130 aa	Known RBP	11.54	□□□□□ -0.56
Q0297	Q0297	ATP16	Q12165	160 aa		11.54	□□□□□ -0.56
Q0297	Q0297	YGL041C-B	Q3E750	60 aa		11.53	□□□□□ -0.56
Q0297	Q0297	YDL022C-A	P0C5L6	82 aa		11.52	□□□□□ -0.57
Q0297	Q0297	OXA1	P39952	402 aa		11.52	□□□□□ -0.57
Q0297	Q0297	CWP2	P43497	92 aa		11.52	□□□□□ -0.57
Q0297	Q0297	ECM12	O13529	151 aa		11.51	□□□□□ -0.57
Q0297	Q0297	ADH1	P00330	348 aa	Known RBP	11.51	□□□□□ -0.57
Q0297	Q0297	RPF1	P38805	295 aa	Known RBP	11.51	□□□□□ -0.57
Q0297	Q0297	COA6	Q3E846	104 aa		11.51	□□□□□ -0.57
Q0297	Q0297	YKR041W	P36134	250 aa		11.5	□□□□□ -0.57
Q0297	Q0297	ABF2	Q02486	183 aa		11.5	□□□□□ -0.57
Q0297	Q0297	HAC1	P41546	238 aa		11.48	□□□□□ -0.57
Q0297	Q0297	MMS2	P53152	137 aa		11.48	□□□□□ -0.57
Q0297	Q0297	QCR8	P08525	94 aa		11.47	□□□□□ -0.57
Q0297	Q0297	RPL28	P02406	149 aa	Known RBP	11.44	□□□□□ -0.58
Q0297	Q0297	SEC11	P15367	167 aa		11.44	□□□□□ -0.58
Q0297	Q0297	YFL067W	P43537	175 aa		11.44	□□□□□ -0.58
Q0297	Q0297	Q0032	Q9ZZX7	96 aa		11.44	□□□□□ -0.58
Q0297	Q0297	CDC43	P18898	376 aa		11.43	□□□□□ -0.58
Q0297	Q0297	MVB12	P42939	101 aa		11.43	□□□□□ -0.58
Q0297	Q0297	HAP3	P13434	144 aa		11.41	□□□□□ -0.58

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 40.3 ms