RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616768.4

MLH1-223, Transcript of mutL homolog 1, human

TSL 2

Gene MLH1, Length 721 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MLH1-223	ENST00000616768	VCPKMT	Q9H867	229 aa		5.78	□□□□□ -1.48
MLH1-223	ENST00000616768	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	5.78	□□□□□ -1.48
MLH1-223	ENST00000616768	NCOA5	Q9HCD5	579 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
MLH1-223	ENST00000616768	RAVER2	Q9HCJ3	691 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
MLH1-223	ENST00000616768	TRIM39	Q9HCM9	518 aa		5.78	□□□□□ -1.48
MLH1-223	ENST00000616768	RIC8B	Q9NVN3	520 aa		5.78	□□□□□ -1.48
MLH1-223	ENST00000616768	GALNT8	Q9NY28	637 aa		5.78	□□□□□ -1.48
MLH1-223	ENST00000616768	C9orf78	Q9NZ63	289 aa	Predicted RBP	5.78	□□□□□ -1.48
MLH1-223	ENST00000616768	SFMBT1	Q9UHJ3	866 aa		5.78	□□□□□ -1.48
MLH1-223	ENST00000616768	UBR5	O95071	2799 aa	Predicted RBP	5.78	□□□□□ -1.48
MLH1-223	ENST00000616768	EMSY	Q7Z589	1322 aa		5.77	□□□□□ -1.49
MLH1-223	ENST00000616768	LOC107983988	A0A1B0GUW6	1196 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
MLH1-223	ENST00000616768	TCRBV16S1A1N1	A0A5B0	115 aa		5.77	□□□□□ -1.49
MLH1-223	ENST00000616768	NPEPPSL1	A6NEC2	478 aa		5.77	□□□□□ -1.49
MLH1-223	ENST00000616768	RSPH10B2	B2RC85	870 aa		5.77	□□□□□ -1.49
MLH1-223	ENST00000616768	PATE3	B3GLJ2	98 aa		5.77	□□□□□ -1.49
MLH1-223	ENST00000616768	GPR42	O15529	346 aa		5.77	□□□□□ -1.49
MLH1-223	ENST00000616768	CNOT4	O95628	575 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
MLH1-223	ENST00000616768	RSPH10B	P0C881	870 aa		5.77	□□□□□ -1.49
MLH1-223	ENST00000616768	SDHA	P31040	664 aa		5.77	□□□□□ -1.49
MLH1-223	ENST00000616768	THPO	P40225	353 aa		5.77	□□□□□ -1.49
MLH1-223	ENST00000616768	CCR10	P46092	362 aa		5.77	□□□□□ -1.49
MLH1-223	ENST00000616768	GLRB	P48167	497 aa		5.77	□□□□□ -1.49
MLH1-223	ENST00000616768	DYNLL1	P63167	89 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
MLH1-223	ENST00000616768	ITIH3	Q06033	890 aa		5.77	□□□□□ -1.49
MLH1-223	ENST00000616768	SRSF5	Q13243	272 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
MLH1-223	ENST00000616768	UBXN2B	Q14CS0	331 aa		5.77	□□□□□ -1.49
MLH1-223	ENST00000616768	RALBP1	Q15311	655 aa		5.77	□□□□□ -1.49
MLH1-223	ENST00000616768	FNDC3B	Q53EP0	1204 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
MLH1-223	ENST00000616768	FAM83B	Q5T0W9	1011 aa		5.77	□□□□□ -1.49
MLH1-223	ENST00000616768	BEND3	Q5T5X7	828 aa		5.77	□□□□□ -1.49
MLH1-223	ENST00000616768	DCLRE1A	Q6PJP8	1040 aa		5.77	□□□□□ -1.49
MLH1-223	ENST00000616768	CIR1	Q86X95	450 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
MLH1-223	ENST00000616768	DVL3	Q92997	716 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
MLH1-223	ENST00000616768	TACO1	Q9BSH4	297 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
MLH1-223	ENST00000616768	BTBD2	Q9BX70	525 aa		5.77	□□□□□ -1.49
MLH1-223	ENST00000616768	WDR11	Q9BZH6	1224 aa		5.77	□□□□□ -1.49
MLH1-223	ENST00000616768	MEGF9	Q9H1U4	602 aa		5.77	□□□□□ -1.49
MLH1-223	ENST00000616768	CD248	Q9HCU0	757 aa		5.77	□□□□□ -1.49
MLH1-223	ENST00000616768	SLC39A2	Q9NP94	309 aa		5.77	□□□□□ -1.49
MLH1-223	ENST00000616768	KCNH7	Q9NS40	1196 aa		5.77	□□□□□ -1.49
MLH1-223	ENST00000616768	ARHGAP28	Q9P2N2	729 aa		5.77	□□□□□ -1.49
MLH1-223	ENST00000616768	HDAC6	Q9UBN7	1215 aa		5.77	□□□□□ -1.49
MLH1-223	ENST00000616768	NDOR1	Q9UHB4	597 aa		5.77	□□□□□ -1.49
MLH1-223	ENST00000616768	SERPINB13	Q9UIV8	391 aa		5.77	□□□□□ -1.49
MLH1-223	ENST00000616768	ZDHHC9	Q9Y397	364 aa		5.77	□□□□□ -1.49
MLH1-223	ENST00000616768	MTF2	Q9Y483	593 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
MLH1-223	ENST00000616768	NEUROG3	Q9Y4Z2	214 aa		5.77	□□□□□ -1.49
MLH1-223	ENST00000616768	B3GALT1	Q9Y5Z6	326 aa		5.77	□□□□□ -1.49
MLH1-223	ENST00000616768	LCT	P09848	1927 aa		5.77	□□□□□ -1.49
MLH1-223	ENST00000616768	NBPF19	A0A087WUL8	3843 aa		5.77	□□□□□ -1.49
MLH1-223	ENST00000616768	SDK1	Q7Z5N4	2213 aa		5.76	□□□□□ -1.49
MLH1-223	ENST00000616768	DOPEY2	Q9Y3R5	2298 aa		5.76	□□□□□ -1.49
MLH1-223	ENST00000616768	FSD2	A1L4K1	749 aa		5.76	□□□□□ -1.49
MLH1-223	ENST00000616768	ASB14	A6NK59	587 aa		5.76	□□□□□ -1.49
MLH1-223	ENST00000616768	HIDE1	A8MVS5	230 aa		5.76	□□□□□ -1.49
MLH1-223	ENST00000616768		B4E1Z4	1266 aa		5.76	□□□□□ -1.49
MLH1-223	ENST00000616768	RASGRP1	O95267	797 aa		5.76	□□□□□ -1.49
MLH1-223	ENST00000616768	ZNF20	P17024	532 aa		5.76	□□□□□ -1.49
MLH1-223	ENST00000616768	KRT15	P19012	456 aa		5.76	□□□□□ -1.49
MLH1-223	ENST00000616768	ETV4	P43268	484 aa		5.76	□□□□□ -1.49
MLH1-223	ENST00000616768	GATM	P50440	423 aa		5.76	□□□□□ -1.49
MLH1-223	ENST00000616768	RIPPLY3	P57055	190 aa		5.76	□□□□□ -1.49
MLH1-223	ENST00000616768	SIM2	Q14190	667 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
MLH1-223	ENST00000616768	USP10	Q14694	798 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
MLH1-223	ENST00000616768	BRDT	Q58F21	947 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
MLH1-223	ENST00000616768	KIAA1841	Q6NSI8	718 aa		5.76	□□□□□ -1.49
MLH1-223	ENST00000616768	LIMS2	Q7Z4I7	341 aa		5.76	□□□□□ -1.49
MLH1-223	ENST00000616768	ADGRA1	Q86SQ6	560 aa		5.76	□□□□□ -1.49
MLH1-223	ENST00000616768	GGN	Q86UU5	652 aa		5.76	□□□□□ -1.49
MLH1-223	ENST00000616768	CASP10	Q92851	521 aa		5.76	□□□□□ -1.49
MLH1-223	ENST00000616768	ZNF689	Q96CS4	500 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
MLH1-223	ENST00000616768	LOXL4	Q96JB6	756 aa		5.76	□□□□□ -1.49
MLH1-223	ENST00000616768	SCYL1	Q96KG9	808 aa		5.76	□□□□□ -1.49
MLH1-223	ENST00000616768	NUP88	Q99567	741 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
MLH1-223	ENST00000616768	GPR20	Q99678	358 aa		5.76	□□□□□ -1.49
MLH1-223	ENST00000616768	ASB1	Q9Y576	335 aa		5.76	□□□□□ -1.49
MLH1-223	ENST00000616768	FRMPD2	Q68DX3	1309 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
MLH1-223	ENST00000616768	RAD50	Q92878	1312 aa		5.75	□□□□□ -1.49
MLH1-223	ENST00000616768	ACACA	Q13085	2346 aa		5.75	□□□□□ -1.49
MLH1-223	ENST00000616768	C2orf16	Q68DN1	1984 aa		5.75	□□□□□ -1.49
MLH1-223	ENST00000616768	LAMA1	P25391	3075 aa		5.75	□□□□□ -1.49
MLH1-223	ENST00000616768	ENO4	A6NNW6	628 aa		5.75	□□□□□ -1.49
MLH1-223	ENST00000616768	EYA2	O00167	538 aa		5.75	□□□□□ -1.49
MLH1-223	ENST00000616768	BAG3	O95817	575 aa		5.75	□□□□□ -1.49
MLH1-223	ENST00000616768	MPIG6B	O95866	241 aa		5.75	□□□□□ -1.49
MLH1-223	ENST00000616768	NBPF7	P0C2Y1	421 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
MLH1-223	ENST00000616768	ZNF853	P0CG23	659 aa		5.75	□□□□□ -1.49
MLH1-223	ENST00000616768	IBSP	P21815	317 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
MLH1-223	ENST00000616768	CD72	P21854	359 aa		5.75	□□□□□ -1.49
MLH1-223	ENST00000616768	DNM2	P50570	870 aa		5.75	□□□□□ -1.49
MLH1-223	ENST00000616768	ICA1	Q05084	483 aa		5.75	□□□□□ -1.49
MLH1-223	ENST00000616768	SCAP	Q12770	1279 aa		5.75	□□□□□ -1.49
MLH1-223	ENST00000616768	SEC23A	Q15436	765 aa		5.75	□□□□□ -1.49
MLH1-223	ENST00000616768	PTPN14	Q15678	1187 aa		5.75	□□□□□ -1.49
MLH1-223	ENST00000616768	ATAT1	Q5SQI0	421 aa		5.75	□□□□□ -1.49
MLH1-223	ENST00000616768	PHF19	Q5T6S3	580 aa		5.75	□□□□□ -1.49
MLH1-223	ENST00000616768	CCDC149	Q6ZUS6	474 aa		5.75	□□□□□ -1.49
MLH1-223	ENST00000616768	BRAP	Q7Z569	592 aa		5.75	□□□□□ -1.49
MLH1-223	ENST00000616768	SESTD1	Q86VW0	696 aa		5.75	□□□□□ -1.49

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