RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000605833.1

VIM-AS1-202, VIM antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene VIM-AS1, Length 918 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIM-AS1-202ENST00000605833 A0A087X0B3 334 aa22.3■■□□□ 1.16
VIM-AS1-202ENST00000605833 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
VIM-AS1-202ENST00000605833 GIPC1O14908 333 aa22.3■■□□□ 1.16
VIM-AS1-202ENST00000605833 NFATC1O95644 943 aa22.3■■□□□ 1.16
VIM-AS1-202ENST00000605833 BCKDHBP21953 392 aa22.3■■□□□ 1.16
VIM-AS1-202ENST00000605833 OPRD1P41143 372 aa22.3■■□□□ 1.16
VIM-AS1-202ENST00000605833 MAGEA11P43364 429 aa22.3■■□□□ 1.16
VIM-AS1-202ENST00000605833 SHC2P98077 582 aa22.3■■□□□ 1.16
VIM-AS1-202ENST00000605833 GAB4Q2WGN9 574 aa22.3■■□□□ 1.16
VIM-AS1-202ENST00000605833 ANO7Q6IWH7 933 aa22.3■■□□□ 1.16
VIM-AS1-202ENST00000605833 C4orf50Q6ZRC1 276 aa22.3■■□□□ 1.16
VIM-AS1-202ENST00000605833 SFTPA1Q8IWL2 248 aa22.3■■□□□ 1.16
VIM-AS1-202ENST00000605833 GPD1LQ8N335 351 aa22.3■■□□□ 1.16
VIM-AS1-202ENST00000605833 USP33Q8TEY7 942 aa22.3■■□□□ 1.16
VIM-AS1-202ENST00000605833 HPDLQ96IR7 371 aa22.3■■□□□ 1.16
VIM-AS1-202ENST00000605833 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa22.3■■□□□ 1.16
VIM-AS1-202ENST00000605833 PANK4Q9NVE7 773 aa22.3■■□□□ 1.16
VIM-AS1-202ENST00000605833 INTS13Q9NVM9 706 aa22.3■■□□□ 1.16
VIM-AS1-202ENST00000605833 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
VIM-AS1-202ENST00000605833 LNP1A1A4G5 178 aa22.29■■□□□ 1.16
VIM-AS1-202ENST00000605833 FRMD3A2A2Y4 597 aa22.29■■□□□ 1.16
VIM-AS1-202ENST00000605833 C4orf47A7E2U8 309 aa22.29■■□□□ 1.16
VIM-AS1-202ENST00000605833 K7EQS6 105 aa22.29■■□□□ 1.16
VIM-AS1-202ENST00000605833 LEFTY2O00292 366 aa22.29■■□□□ 1.16
VIM-AS1-202ENST00000605833 PDGFRBP09619 1106 aa22.29■■□□□ 1.16
VIM-AS1-202ENST00000605833 GRIK1P39086 918 aa22.29■■□□□ 1.16
VIM-AS1-202ENST00000605833 STAT6P42226 847 aa22.29■■□□□ 1.16
VIM-AS1-202ENST00000605833 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
VIM-AS1-202ENST00000605833 CYP27A1Q02318 531 aa22.29■■□□□ 1.16
VIM-AS1-202ENST00000605833 MYO1EQ12965 1108 aa22.29■■□□□ 1.16
VIM-AS1-202ENST00000605833 NR1H3Q13133 447 aa22.29■■□□□ 1.16
VIM-AS1-202ENST00000605833 PMS2CLQ68D20 193 aa22.29■■□□□ 1.16
VIM-AS1-202ENST00000605833 TTC30AQ86WT1 665 aa22.29■■□□□ 1.16
VIM-AS1-202ENST00000605833 CBWD2Q8IUF1 395 aa22.29■■□□□ 1.16
VIM-AS1-202ENST00000605833 CCDC33Q8N5R6 958 aa22.29■■□□□ 1.16
VIM-AS1-202ENST00000605833 HPS3Q969F9 1004 aa22.29■■□□□ 1.16
VIM-AS1-202ENST00000605833 CDH9Q9ULB4 789 aa22.29■■□□□ 1.16
VIM-AS1-202ENST00000605833 MYOFQ9NZM1 2061 aa22.29■■□□□ 1.16
VIM-AS1-202ENST00000605833 STX6O43752 255 aa22.28■■□□□ 1.16
VIM-AS1-202ENST00000605833 TNNC2P02585 160 aa22.28■■□□□ 1.16
VIM-AS1-202ENST00000605833 TCF3P15923 654 aa22.28■■□□□ 1.16
VIM-AS1-202ENST00000605833 RESTQ13127 1097 aa22.28■■□□□ 1.16
VIM-AS1-202ENST00000605833 ALCAMQ13740 583 aa22.28■■□□□ 1.16
VIM-AS1-202ENST00000605833 LIMS2Q7Z4I7 341 aa22.28■■□□□ 1.16
VIM-AS1-202ENST00000605833 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa22.28■■□□□ 1.16
VIM-AS1-202ENST00000605833 MDGA1Q8NFP4 955 aa22.28■■□□□ 1.16
VIM-AS1-202ENST00000605833 SMPD4Q9NXE4 827 aa22.28■■□□□ 1.16
VIM-AS1-202ENST00000605833 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
VIM-AS1-202ENST00000605833 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
VIM-AS1-202ENST00000605833 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
VIM-AS1-202ENST00000605833 PATE3B3GLJ2 98 aa22.27■■□□□ 1.16
VIM-AS1-202ENST00000605833 CYP17A1P05093 508 aa22.27■■□□□ 1.16
VIM-AS1-202ENST00000605833 MESP2Q0VG99 397 aa22.27■■□□□ 1.16
VIM-AS1-202ENST00000605833 VSTM1Q6UX27 236 aa22.27■■□□□ 1.16
VIM-AS1-202ENST00000605833 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa22.27■■□□□ 1.16
VIM-AS1-202ENST00000605833 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa22.27■■□□□ 1.16
VIM-AS1-202ENST00000605833 PCED1BQ96HM7 432 aa22.27■■□□□ 1.16
VIM-AS1-202ENST00000605833 SPATA17Q96L03 361 aa22.27■■□□□ 1.16
VIM-AS1-202ENST00000605833 MMS19Q96T76 1030 aa22.27■■□□□ 1.16
VIM-AS1-202ENST00000605833 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa22.27■■□□□ 1.16
VIM-AS1-202ENST00000605833 NME7Q9Y5B8 376 aa22.27■■□□□ 1.16
VIM-AS1-202ENST00000605833 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP22.26■■□□□ 1.15
VIM-AS1-202ENST00000605833 ANXA13P27216 316 aa22.26■■□□□ 1.15
VIM-AS1-202ENST00000605833 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
VIM-AS1-202ENST00000605833 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
VIM-AS1-202ENST00000605833 MDH1BQ5I0G3 518 aa22.26■■□□□ 1.15
VIM-AS1-202ENST00000605833 DPH6Q7L8W6 267 aa22.26■■□□□ 1.15
VIM-AS1-202ENST00000605833 CYP2U1Q7Z449 544 aa22.26■■□□□ 1.15
VIM-AS1-202ENST00000605833 RASSF3Q86WH2 238 aa22.26■■□□□ 1.15
VIM-AS1-202ENST00000605833 PDILTQ8N807 584 aa22.26■■□□□ 1.15
VIM-AS1-202ENST00000605833 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
VIM-AS1-202ENST00000605833 RNF38Q9H0F5 515 aa22.26■■□□□ 1.15
VIM-AS1-202ENST00000605833 MMP17Q9ULZ9 603 aa22.26■■□□□ 1.15
VIM-AS1-202ENST00000605833 CPQQ9Y646 472 aa22.26■■□□□ 1.15
VIM-AS1-202ENST00000605833 F8VP50 259 aa22.25■■□□□ 1.15
VIM-AS1-202ENST00000605833 ABL1P00519 1130 aa22.25■■□□□ 1.15
VIM-AS1-202ENST00000605833 WARSP23381 471 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
VIM-AS1-202ENST00000605833 SLC6A11P48066 632 aa22.25■■□□□ 1.15
VIM-AS1-202ENST00000605833 PDE6CP51160 858 aa22.25■■□□□ 1.15
VIM-AS1-202ENST00000605833 CACNA2D1P54289 1103 aa22.25■■□□□ 1.15
VIM-AS1-202ENST00000605833 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa22.25■■□□□ 1.15
VIM-AS1-202ENST00000605833 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
VIM-AS1-202ENST00000605833 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa22.25■■□□□ 1.15
VIM-AS1-202ENST00000605833 TMEM30AQ9NV96 361 aa22.25■■□□□ 1.15
VIM-AS1-202ENST00000605833 HSPBP1Q9NZL4 362 aa22.25■■□□□ 1.15
VIM-AS1-202ENST00000605833 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
VIM-AS1-202ENST00000605833 MTMR6Q9Y217 621 aa22.25■■□□□ 1.15
VIM-AS1-202ENST00000605833 ASPMQ8IZT6 3477 aa22.25■■□□□ 1.15
VIM-AS1-202ENST00000605833 ZNF840PA6NDX5 716 aa22.24■■□□□ 1.15
VIM-AS1-202ENST00000605833 ZNF233A6NK53 670 aa22.24■■□□□ 1.15
VIM-AS1-202ENST00000605833 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
VIM-AS1-202ENST00000605833 FOXC1Q12948 553 aa22.24■■□□□ 1.15
VIM-AS1-202ENST00000605833 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
VIM-AS1-202ENST00000605833 DUOXA2Q1HG44 320 aa22.24■■□□□ 1.15
VIM-AS1-202ENST00000605833 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa22.24■■□□□ 1.15
VIM-AS1-202ENST00000605833 TMEM92Q6UXU6 159 aa22.24■■□□□ 1.15
VIM-AS1-202ENST00000605833 HS2ST1Q7LGA3 356 aa22.24■■□□□ 1.15
VIM-AS1-202ENST00000605833 C12orf40Q86WS4 652 aa22.24■■□□□ 1.15
VIM-AS1-202ENST00000605833 CCDC65Q8IXS2 484 aa22.24■■□□□ 1.15
VIM-AS1-202ENST00000605833 ALLCQ8N6M5 410 aa22.24■■□□□ 1.15
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