RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590367.5

EFTUD2-218, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 2

Gene EFTUD2, Length 3,638 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-218ENST00000590367 TMC5Q6UXY8 1006 aa8.09□□□□□ -1.11
EFTUD2-218ENST00000590367 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
EFTUD2-218ENST00000590367 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
EFTUD2-218ENST00000590367 HPS1Q92902 700 aa8.09□□□□□ -1.11
EFTUD2-218ENST00000590367 ZIC5Q96T25 663 aa8.09□□□□□ -1.11
EFTUD2-218ENST00000590367 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP8.09□□□□□ -1.11
EFTUD2-218ENST00000590367 KLC2Q9H0B6 622 aa8.09□□□□□ -1.11
EFTUD2-218ENST00000590367 RNF38Q9H0F5 515 aa8.09□□□□□ -1.11
EFTUD2-218ENST00000590367 GLT8D2Q9H1C3 349 aa8.09□□□□□ -1.11
EFTUD2-218ENST00000590367 RIC8AQ9NPQ8 531 aa8.09□□□□□ -1.11
EFTUD2-218ENST00000590367 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa8.09□□□□□ -1.11
EFTUD2-218ENST00000590367 DTNAQ9Y4J8 743 aa8.09□□□□□ -1.11
EFTUD2-218ENST00000590367 TCP10L2B9ZVM9 353 aa8.09□□□□□ -1.11
EFTUD2-218ENST00000590367 CFAP99D6REC4 459 aa8.09□□□□□ -1.11
EFTUD2-218ENST00000590367 PEX1O43933 1283 aa8.09□□□□□ -1.11
EFTUD2-218ENST00000590367 SERPING1P05155 500 aa8.09□□□□□ -1.11
EFTUD2-218ENST00000590367 PCSK6P29122 969 aa8.09□□□□□ -1.11
EFTUD2-218ENST00000590367 BTDP43251 543 aa8.09□□□□□ -1.11
EFTUD2-218ENST00000590367 NCKAP1LP55160 1127 aa8.09□□□□□ -1.11
EFTUD2-218ENST00000590367 CALCOCO2Q13137 446 aa8.09□□□□□ -1.11
EFTUD2-218ENST00000590367 PSMD6Q15008 389 aa8.09□□□□□ -1.11
EFTUD2-218ENST00000590367 TIGD2Q4W5G0 525 aa8.09□□□□□ -1.11
EFTUD2-218ENST00000590367 DUPD1Q68J44 220 aa8.09□□□□□ -1.11
EFTUD2-218ENST00000590367 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
EFTUD2-218ENST00000590367 BLIDQ8IZY5 108 aa8.09□□□□□ -1.11
EFTUD2-218ENST00000590367 PPP4R1Q8TF05 950 aa8.09□□□□□ -1.11
EFTUD2-218ENST00000590367 GDPD5Q8WTR4 605 aa8.09□□□□□ -1.11
EFTUD2-218ENST00000590367 FAM172AQ8WUF8 416 aa8.09□□□□□ -1.11
EFTUD2-218ENST00000590367 C10orf82Q8WW14 230 aa8.09□□□□□ -1.11
EFTUD2-218ENST00000590367 CAPSLQ8WWF8 208 aa8.09□□□□□ -1.11
EFTUD2-218ENST00000590367 JADE3Q92613 823 aa8.09□□□□□ -1.11
EFTUD2-218ENST00000590367 EEF2KMTQ96G04 330 aa8.09□□□□□ -1.11
EFTUD2-218ENST00000590367 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
EFTUD2-218ENST00000590367 DHRS9Q9BPW9 319 aa8.09□□□□□ -1.11
EFTUD2-218ENST00000590367 TRIM51Q9BSJ1 452 aa8.09□□□□□ -1.11
EFTUD2-218ENST00000590367 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
EFTUD2-218ENST00000590367 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP8.09□□□□□ -1.11
EFTUD2-218ENST00000590367 COMMD10Q9Y6G5 202 aa8.09□□□□□ -1.11
EFTUD2-218ENST00000590367 A0A1W2PQ67 120 aa8.08□□□□□ -1.12
EFTUD2-218ENST00000590367 H3BSA7 217 aa8.08□□□□□ -1.12
EFTUD2-218ENST00000590367 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa8.08□□□□□ -1.12
EFTUD2-218ENST00000590367 CDK2AP1O14519 115 aa8.08□□□□□ -1.12
EFTUD2-218ENST00000590367 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
EFTUD2-218ENST00000590367 EDF1O60869 148 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
EFTUD2-218ENST00000590367 TTLL1O95922 423 aa8.08□□□□□ -1.12
EFTUD2-218ENST00000590367 CCDC130P13994 396 aa8.08□□□□□ -1.12
EFTUD2-218ENST00000590367 PMLP29590 882 aa8.08□□□□□ -1.12
EFTUD2-218ENST00000590367 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
EFTUD2-218ENST00000590367 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
EFTUD2-218ENST00000590367 ACTR3P61158 418 aa8.08□□□□□ -1.12
EFTUD2-218ENST00000590367 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
EFTUD2-218ENST00000590367 STX1BP61266 288 aa8.08□□□□□ -1.12
EFTUD2-218ENST00000590367 KCNA1Q09470 495 aa8.08□□□□□ -1.12
EFTUD2-218ENST00000590367 FCHO2Q0JRZ9 810 aa8.08□□□□□ -1.12
EFTUD2-218ENST00000590367 MOGSQ13724 837 aa8.08□□□□□ -1.12
EFTUD2-218ENST00000590367 TRIP10Q15642 601 aa8.08□□□□□ -1.12
EFTUD2-218ENST00000590367 MAPK6Q16659 721 aa8.08□□□□□ -1.12
EFTUD2-218ENST00000590367 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa8.08□□□□□ -1.12
EFTUD2-218ENST00000590367 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
EFTUD2-218ENST00000590367 PEX13Q92968 403 aa8.08□□□□□ -1.12
EFTUD2-218ENST00000590367 TAMM41Q96BW9 452 aa8.08□□□□□ -1.12
EFTUD2-218ENST00000590367 TTC25Q96NG3 672 aa8.08□□□□□ -1.12
EFTUD2-218ENST00000590367 VPS45Q9NRW7 570 aa8.08□□□□□ -1.12
EFTUD2-218ENST00000590367 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa8.08□□□□□ -1.12
EFTUD2-218ENST00000590367 SNX24Q9Y343 169 aa8.08□□□□□ -1.12
EFTUD2-218ENST00000590367 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa8.08□□□□□ -1.12
EFTUD2-218ENST00000590367 CEPT1Q9Y6K0 416 aa8.08□□□□□ -1.12
EFTUD2-218ENST00000590367 DLEC1Q9Y238 1755 aa8.08□□□□□ -1.12
EFTUD2-218ENST00000590367 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa8.08□□□□□ -1.12
EFTUD2-218ENST00000590367 FADS2P1A8MWK0 482 aa8.08□□□□□ -1.12
EFTUD2-218ENST00000590367 DENRO43583 198 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
EFTUD2-218ENST00000590367 TFPTP0C1Z6 253 aa8.08□□□□□ -1.12
EFTUD2-218ENST00000590367 PCP11498 1178 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
EFTUD2-218ENST00000590367 STT3AP46977 705 aa8.08□□□□□ -1.12
EFTUD2-218ENST00000590367 SLC5A3P53794 718 aa8.08□□□□□ -1.12
EFTUD2-218ENST00000590367 DSTNP60981 165 aa8.08□□□□□ -1.12
EFTUD2-218ENST00000590367 ATP6V0D1P61421 351 aa8.08□□□□□ -1.12
EFTUD2-218ENST00000590367 TSPY1Q01534 308 aa8.08□□□□□ -1.12
EFTUD2-218ENST00000590367 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
EFTUD2-218ENST00000590367 RALGDSQ12967 914 aa8.08□□□□□ -1.12
EFTUD2-218ENST00000590367 INSCQ1MX18 579 aa8.08□□□□□ -1.12
EFTUD2-218ENST00000590367 RGS9BPQ6ZS82 235 aa8.08□□□□□ -1.12
EFTUD2-218ENST00000590367 TAS2R42Q7RTR8 314 aa8.08□□□□□ -1.12
EFTUD2-218ENST00000590367 GPR141Q7Z602 305 aa8.08□□□□□ -1.12
EFTUD2-218ENST00000590367 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
EFTUD2-218ENST00000590367 CFAP36Q96G28 342 aa8.08□□□□□ -1.12
EFTUD2-218ENST00000590367 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
EFTUD2-218ENST00000590367 DEFB129Q9H1M3 183 aa8.08□□□□□ -1.12
EFTUD2-218ENST00000590367 SEMA4AQ9H3S1 761 aa8.08□□□□□ -1.12
EFTUD2-218ENST00000590367 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
EFTUD2-218ENST00000590367 SALL4Q9UJQ4 1053 aa8.08□□□□□ -1.12
EFTUD2-218ENST00000590367 RAB26Q9ULW5 256 aa8.08□□□□□ -1.12
EFTUD2-218ENST00000590367 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa8.08□□□□□ -1.12
EFTUD2-218ENST00000590367 ZNF536O15090 1300 aa8.08□□□□□ -1.12
EFTUD2-218ENST00000590367 WDR90Q96KV7 1748 aa8.08□□□□□ -1.12
EFTUD2-218ENST00000590367 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
EFTUD2-218ENST00000590367 SFI1A8K8P3 1242 aa8.08□□□□□ -1.12
EFTUD2-218ENST00000590367 BTNL10A8MVZ5 291 aa8.08□□□□□ -1.12
EFTUD2-218ENST00000590367 CYP1A2P05177 515 aa8.08□□□□□ -1.12
EFTUD2-218ENST00000590367 FDFT1P37268 417 aa8.08□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.3 ms