RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590211.5

CAPNS1-210, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 403 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-210ENST00000590211 OTOP2Q7RTS6 562 aa4.71□□□□□ -1.66
CAPNS1-210ENST00000590211 HEATR4Q86WZ0 1026 aa4.71□□□□□ -1.66
CAPNS1-210ENST00000590211 CPOQ8IVL8 374 aa4.71□□□□□ -1.66
CAPNS1-210ENST00000590211 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa4.71□□□□□ -1.66
CAPNS1-210ENST00000590211 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa4.71□□□□□ -1.66
CAPNS1-210ENST00000590211 SPPL3Q8TCT6 385 aa4.71□□□□□ -1.66
CAPNS1-210ENST00000590211 RUFY2Q8WXA3 655 aa4.71□□□□□ -1.66
CAPNS1-210ENST00000590211 CPA5Q8WXQ8 436 aa4.71□□□□□ -1.66
CAPNS1-210ENST00000590211 ZBTB10Q96DT7 871 aa4.71□□□□□ -1.66
CAPNS1-210ENST00000590211 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
CAPNS1-210ENST00000590211 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
CAPNS1-210ENST00000590211 UIMC1Q96RL1 719 aa4.71□□□□□ -1.66
CAPNS1-210ENST00000590211 TMEM209Q96SK2 561 aa4.71□□□□□ -1.66
CAPNS1-210ENST00000590211 NELL2Q99435 816 aa4.71□□□□□ -1.66
CAPNS1-210ENST00000590211 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
CAPNS1-210ENST00000590211 TMEM8AQ9HCN3 771 aa4.71□□□□□ -1.66
CAPNS1-210ENST00000590211 NECTIN3Q9NQS3 549 aa4.71□□□□□ -1.66
CAPNS1-210ENST00000590211 TBC1D23Q9NUY8 699 aa4.71□□□□□ -1.66
CAPNS1-210ENST00000590211 TMEM140Q9NV12 185 aa4.71□□□□□ -1.66
CAPNS1-210ENST00000590211 Q9UFV3 132 aa4.71□□□□□ -1.66
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC13A4Q9UKG4 626 aa4.71□□□□□ -1.66
CAPNS1-210ENST00000590211 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa4.71□□□□□ -1.66
CAPNS1-210ENST00000590211 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa4.71□□□□□ -1.66
CAPNS1-210ENST00000590211 ASAP1Q9ULH1 1129 aa4.71□□□□□ -1.66
CAPNS1-210ENST00000590211 NWD2Q9ULI1 1742 aa4.71□□□□□ -1.66
CAPNS1-210ENST00000590211 RAD50Q92878 1312 aa4.71□□□□□ -1.66
CAPNS1-210ENST00000590211 IRS2Q9Y4H2 1338 aa4.71□□□□□ -1.66
CAPNS1-210ENST00000590211 A0A087WZ62 844 aa4.7□□□□□ -1.66
CAPNS1-210ENST00000590211 HIP1O00291 1037 aa4.7□□□□□ -1.66
CAPNS1-210ENST00000590211 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
CAPNS1-210ENST00000590211 FAM155BO75949 473 aa4.7□□□□□ -1.66
CAPNS1-210ENST00000590211 KLHL18O94889 574 aa4.7□□□□□ -1.66
CAPNS1-210ENST00000590211 GASTP01350 101 aa4.7□□□□□ -1.66
CAPNS1-210ENST00000590211 CD1AP06126 327 aa4.7□□□□□ -1.66
CAPNS1-210ENST00000590211 IGKV5-2P06315 115 aa4.7□□□□□ -1.66
CAPNS1-210ENST00000590211 FURINP09958 794 aa4.7□□□□□ -1.66
CAPNS1-210ENST00000590211 SBK3P0C264 359 aa4.7□□□□□ -1.66
CAPNS1-210ENST00000590211 ATP1A3P13637 1013 aa4.7□□□□□ -1.66
CAPNS1-210ENST00000590211 POLD1P28340 1107 aa4.7□□□□□ -1.66
CAPNS1-210ENST00000590211 CRHR1P34998 444 aa4.7□□□□□ -1.66
CAPNS1-210ENST00000590211 KRT9P35527 623 aa4.7□□□□□ -1.66
CAPNS1-210ENST00000590211 LIFRP42702 1097 aa4.7□□□□□ -1.66
CAPNS1-210ENST00000590211 NUCB2P80303 420 aa4.7□□□□□ -1.66
CAPNS1-210ENST00000590211 RAB32Q13637 225 aa4.7□□□□□ -1.66
CAPNS1-210ENST00000590211 GCKRQ14397 625 aa4.7□□□□□ -1.66
CAPNS1-210ENST00000590211 PLCL1Q15111 1095 aa4.7□□□□□ -1.66
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF792Q3KQV3 632 aa4.7□□□□□ -1.66
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC44A4Q53GD3 710 aa4.7□□□□□ -1.66
CAPNS1-210ENST00000590211 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa4.7□□□□□ -1.66
CAPNS1-210ENST00000590211 FAM26FQ5R3K3 315 aa4.7□□□□□ -1.66
CAPNS1-210ENST00000590211 ADGRF1Q5T601 910 aa4.7□□□□□ -1.66
CAPNS1-210ENST00000590211 USP49Q70CQ1 688 aa4.7□□□□□ -1.66
CAPNS1-210ENST00000590211 AACSQ86V21 672 aa4.7□□□□□ -1.66
CAPNS1-210ENST00000590211 HERC6Q8IVU3 1022 aa4.7□□□□□ -1.66
CAPNS1-210ENST00000590211 FLAD1Q8NFF5 587 aa4.7□□□□□ -1.66
CAPNS1-210ENST00000590211 OR56A3Q8NH54 315 aa4.7□□□□□ -1.66
CAPNS1-210ENST00000590211 ABHD4Q8TB40 342 aa4.7□□□□□ -1.66
CAPNS1-210ENST00000590211 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa4.7□□□□□ -1.66
CAPNS1-210ENST00000590211 HERVK_113Q902F9 699 aa4.7□□□□□ -1.66
CAPNS1-210ENST00000590211 EID2BQ96D98 161 aa4.7□□□□□ -1.66
CAPNS1-210ENST00000590211 SERINC2Q96SA4 455 aa4.7□□□□□ -1.66
CAPNS1-210ENST00000590211 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
CAPNS1-210ENST00000590211 KATNAL1Q9BW62 490 aa4.7□□□□□ -1.66
CAPNS1-210ENST00000590211 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP4.7□□□□□ -1.663e-7■■■□□ 15.9
CAPNS1-210ENST00000590211 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
CAPNS1-210ENST00000590211 SEMA6BQ9H3T3 888 aa4.7□□□□□ -1.66
CAPNS1-210ENST00000590211 MLXIPQ9HAP2 919 aa4.7□□□□□ -1.66
CAPNS1-210ENST00000590211 SLAMF7Q9NQ25 335 aa4.7□□□□□ -1.66
CAPNS1-210ENST00000590211 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa4.7□□□□□ -1.66
CAPNS1-210ENST00000590211 ECHDC1Q9NTX5 307 aa4.7□□□□□ -1.66
CAPNS1-210ENST00000590211 TBC1D22BQ9NU19 505 aa4.7□□□□□ -1.66
CAPNS1-210ENST00000590211 RGL1Q9NZL6 768 aa4.7□□□□□ -1.66
CAPNS1-210ENST00000590211 KIF17Q9P2E2 1029 aa4.7□□□□□ -1.66
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF212Q9UDV6 495 aa4.7□□□□□ -1.66
CAPNS1-210ENST00000590211 USP16Q9Y5T5 823 aa4.7□□□□□ -1.66
CAPNS1-210ENST00000590211 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
CAPNS1-210ENST00000590211 DISP2A7MBM2 1401 aa4.7□□□□□ -1.66
CAPNS1-210ENST00000590211 MYH7P12883 1935 aa4.7□□□□□ -1.66
CAPNS1-210ENST00000590211 NUP98P52948 1817 aa4.69□□□□□ -1.66
CAPNS1-210ENST00000590211 RFX7Q2KHR2 1363 aa4.69□□□□□ -1.66
CAPNS1-210ENST00000590211 LAMB2P55268 1798 aa4.69□□□□□ -1.66
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CAPNS1-210ENST00000590211 K7ENM7 598 aa4.69□□□□□ -1.66
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CAPNS1-210ENST00000590211 ALDH1A2O94788 518 aa4.69□□□□□ -1.66
CAPNS1-210ENST00000590211 TXNP10599 105 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
CAPNS1-210ENST00000590211 RAC2P15153 192 aa4.69□□□□□ -1.66
CAPNS1-210ENST00000590211 XBP1P17861 261 aa4.69□□□□□ -1.66
CAPNS1-210ENST00000590211 SSTR4P31391 388 aa4.69□□□□□ -1.66
CAPNS1-210ENST00000590211 HSPA4P34932 840 aa4.69□□□□□ -1.66
CAPNS1-210ENST00000590211 PTPN7P35236 360 aa4.69□□□□□ -1.66
CAPNS1-210ENST00000590211 STAT5BP51692 787 aa4.69□□□□□ -1.66
CAPNS1-210ENST00000590211 WNT3AP56704 352 aa4.69□□□□□ -1.66
CAPNS1-210ENST00000590211 NOMO3P69849 1222 aa4.69□□□□□ -1.66
CAPNS1-210ENST00000590211 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
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