RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577498.1

IFT20-204, Transcript of intraflagellar transport 20, humanhuman

TSL 4

Gene IFT20, Length 557 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT20-204ENST00000577498 OR10T2Q8NGX3 314 aa15.94■□□□□ 0.14
IFT20-204ENST00000577498 GOLGA1Q92805 767 aa15.94■□□□□ 0.14
IFT20-204ENST00000577498 PSMB7Q99436 277 aa15.94■□□□□ 0.14
IFT20-204ENST00000577498 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa15.94■□□□□ 0.14
IFT20-204ENST00000577498 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
IFT20-204ENST00000577498 TMEM59LQ9UK28 342 aa15.94■□□□□ 0.14
IFT20-204ENST00000577498 H7C4K7 107 aa15.93■□□□□ 0.14
IFT20-204ENST00000577498 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
IFT20-204ENST00000577498 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
IFT20-204ENST00000577498 AP1G2O75843 785 aa15.93■□□□□ 0.14
IFT20-204ENST00000577498 GABBR2O75899 941 aa15.93■□□□□ 0.14
IFT20-204ENST00000577498 GJB6O95452 261 aa15.93■□□□□ 0.14
IFT20-204ENST00000577498 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
IFT20-204ENST00000577498 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
IFT20-204ENST00000577498 RWDD2BP57060 319 aa15.93■□□□□ 0.14
IFT20-204ENST00000577498 OGDHQ02218 1023 aa15.93■□□□□ 0.14
IFT20-204ENST00000577498 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa15.93■□□□□ 0.14
IFT20-204ENST00000577498 PTPROQ16827 1216 aa15.93■□□□□ 0.14
IFT20-204ENST00000577498 CCDC142Q17RM4 750 aa15.93■□□□□ 0.14
IFT20-204ENST00000577498 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
IFT20-204ENST00000577498 FAM171A1Q5VUB5 890 aa15.93■□□□□ 0.14
IFT20-204ENST00000577498 ZNF280DQ6N043 979 aa15.93■□□□□ 0.14
IFT20-204ENST00000577498 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
IFT20-204ENST00000577498 SLC26A9Q7LBE3 791 aa15.93■□□□□ 0.14
IFT20-204ENST00000577498 RHOT1Q8IXI2 618 aa15.93■□□□□ 0.14
IFT20-204ENST00000577498 JOSD2Q8TAC2 188 aa15.93■□□□□ 0.14
IFT20-204ENST00000577498 KRT35Q92764 455 aa15.93■□□□□ 0.14
IFT20-204ENST00000577498 PLVAPQ9BX97 442 aa15.93■□□□□ 0.14
IFT20-204ENST00000577498 CWH43Q9H720 699 aa15.93■□□□□ 0.14
IFT20-204ENST00000577498 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa15.93■□□□□ 0.14
IFT20-204ENST00000577498 COL4A6Q14031 1691 aa15.92■□□□□ 0.14
IFT20-204ENST00000577498 C2CD4BA6NLJ0 364 aa15.92■□□□□ 0.14
IFT20-204ENST00000577498 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
IFT20-204ENST00000577498 DPYSL4O14531 572 aa15.92■□□□□ 0.14
IFT20-204ENST00000577498 SART1O43290 800 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
IFT20-204ENST00000577498 CEP104O60308 925 aa15.92■□□□□ 0.14
IFT20-204ENST00000577498 FBXO21O94952 628 aa15.92■□□□□ 0.14
IFT20-204ENST00000577498 EFEMP2O95967 443 aa15.92■□□□□ 0.14
IFT20-204ENST00000577498 ACRP10323 421 aa15.92■□□□□ 0.14
IFT20-204ENST00000577498 PSMA2P25787 234 aa15.92■□□□□ 0.14
IFT20-204ENST00000577498 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
IFT20-204ENST00000577498 DEFB103AP81534 67 aa15.92■□□□□ 0.14
IFT20-204ENST00000577498 FPGSQ05932 587 aa15.92■□□□□ 0.14
IFT20-204ENST00000577498 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
IFT20-204ENST00000577498 LRRTM3Q86VH5 581 aa15.92■□□□□ 0.14
IFT20-204ENST00000577498 LRRN4CLQ8ND94 238 aa15.92■□□□□ 0.14
IFT20-204ENST00000577498 UBXN4Q92575 508 aa15.92■□□□□ 0.14
IFT20-204ENST00000577498 ALG3Q92685 438 aa15.92■□□□□ 0.14
IFT20-204ENST00000577498 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP15.92■□□□□ 0.14
IFT20-204ENST00000577498 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
IFT20-204ENST00000577498 SMOQ99835 787 aa15.92■□□□□ 0.14
IFT20-204ENST00000577498 NCAPGQ9BPX3 1015 aa15.92■□□□□ 0.14
IFT20-204ENST00000577498 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP15.92■□□□□ 0.14
IFT20-204ENST00000577498 CNPY3Q9BT09 278 aa15.92■□□□□ 0.14
IFT20-204ENST00000577498 GPR62Q9BZJ7 368 aa15.92■□□□□ 0.14
IFT20-204ENST00000577498 PNPLA8Q9NP80 782 aa15.92■□□□□ 0.14
IFT20-204ENST00000577498 ASNSD1Q9NWL6 643 aa15.92■□□□□ 0.14
IFT20-204ENST00000577498 GLI1P08151 1106 aa15.91■□□□□ 0.14
IFT20-204ENST00000577498 DESP17661 470 aa15.91■□□□□ 0.14
IFT20-204ENST00000577498 LAG3P18627 525 aa15.91■□□□□ 0.14
IFT20-204ENST00000577498 GPD1P21695 349 aa15.91■□□□□ 0.14
IFT20-204ENST00000577498 MAP3K7CLP57077 242 aa15.91■□□□□ 0.14
IFT20-204ENST00000577498 SMARCB1Q12824 385 aa15.91■□□□□ 0.14
IFT20-204ENST00000577498 RAB41Q5JT25 222 aa15.91■□□□□ 0.14
IFT20-204ENST00000577498 EFHC1Q5JVL4 640 aa15.91■□□□□ 0.14
IFT20-204ENST00000577498 SEL1L2Q5TEA6 688 aa15.91■□□□□ 0.14
IFT20-204ENST00000577498 DCAF12L1Q5VU92 463 aa15.91■□□□□ 0.14
IFT20-204ENST00000577498 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
IFT20-204ENST00000577498 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
IFT20-204ENST00000577498 ANKS3Q6ZW76 656 aa15.91■□□□□ 0.14
IFT20-204ENST00000577498 CPNE8Q86YQ8 564 aa15.91■□□□□ 0.14
IFT20-204ENST00000577498 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
IFT20-204ENST00000577498 SCUBE3Q8IX30 993 aa15.91■□□□□ 0.14
IFT20-204ENST00000577498 KATNAL2Q8IYT4 538 aa15.91■□□□□ 0.14
IFT20-204ENST00000577498 SCML4Q8N228 414 aa15.91■□□□□ 0.14
IFT20-204ENST00000577498 IGSF21Q96ID5 467 aa15.91■□□□□ 0.14
IFT20-204ENST00000577498 MS4A14Q96JA4 679 aa15.91■□□□□ 0.14
IFT20-204ENST00000577498 ZNF558Q96NG5 402 aa15.91■□□□□ 0.14
IFT20-204ENST00000577498 TTPALQ9BTX7 342 aa15.91■□□□□ 0.14
IFT20-204ENST00000577498 LRRC4Q9HBW1 653 aa15.91■□□□□ 0.14
IFT20-204ENST00000577498 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
IFT20-204ENST00000577498 TMLHEQ9NVH6 421 aa15.91■□□□□ 0.14
IFT20-204ENST00000577498 HCSTQ9UBK5 93 aa15.91■□□□□ 0.14
IFT20-204ENST00000577498 HHLA1C9JL84 531 aa15.9■□□□□ 0.14
IFT20-204ENST00000577498 BEST1O76090 585 aa15.9■□□□□ 0.14
IFT20-204ENST00000577498 FGBP02675 491 aa15.9■□□□□ 0.14
IFT20-204ENST00000577498 LCP1P13796 627 aa15.9■□□□□ 0.14
IFT20-204ENST00000577498 MARCKSL1P49006 195 aa15.9■□□□□ 0.14
IFT20-204ENST00000577498 ADIGQ0VDE8 80 aa15.9■□□□□ 0.14
IFT20-204ENST00000577498 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
IFT20-204ENST00000577498 CTXN3Q4LDR2 81 aa15.9■□□□□ 0.14
IFT20-204ENST00000577498 POLNQ7Z5Q5 900 aa15.9■□□□□ 0.14
IFT20-204ENST00000577498 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
IFT20-204ENST00000577498 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa15.9■□□□□ 0.14
IFT20-204ENST00000577498 MMGT1Q8N4V1 131 aa15.9■□□□□ 0.14
IFT20-204ENST00000577498 SPATA4Q8NEY3 305 aa15.9■□□□□ 0.14
IFT20-204ENST00000577498 ZMIZ2Q8NF64 920 aa15.9■□□□□ 0.14
IFT20-204ENST00000577498 RXFP2Q8WXD0 754 aa15.9■□□□□ 0.14
IFT20-204ENST00000577498 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP15.9■□□□□ 0.14
IFT20-204ENST00000577498 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.4 ms