RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000569270.5

CHTF18-218, Transcript of chromosome transmission fidelity factor 18, humanhuman

TSL 5

Gene CHTF18, Length 711 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTF18-218ENST00000569270 ATICP31939 592 aa20.61■□□□□ 0.89
CHTF18-218ENST00000569270 CNR2P34972 360 aa20.61■□□□□ 0.89
CHTF18-218ENST00000569270 GJA4P35212 333 aa20.61■□□□□ 0.89
CHTF18-218ENST00000569270 PXNP49023 591 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
CHTF18-218ENST00000569270 GALK1P51570 392 aa20.61■□□□□ 0.89
CHTF18-218ENST00000569270 CACNA2D1P54289 1103 aa20.61■□□□□ 0.89
CHTF18-218ENST00000569270 LMNB2Q03252 620 aa20.61■□□□□ 0.89
CHTF18-218ENST00000569270 SPEM2Q0P670 501 aa20.61■□□□□ 0.89
CHTF18-218ENST00000569270 KMT5BQ4FZB7 885 aa20.61■□□□□ 0.89
CHTF18-218ENST00000569270 KIAA0895Q8NCT3 520 aa20.61■□□□□ 0.89
CHTF18-218ENST00000569270 ATP2A3Q93084 1043 aa20.61■□□□□ 0.89
CHTF18-218ENST00000569270 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
CHTF18-218ENST00000569270 C8orf48Q96LL4 319 aa20.61■□□□□ 0.89
CHTF18-218ENST00000569270 CEP295NLQ96MC4 621 aa20.61■□□□□ 0.89
CHTF18-218ENST00000569270 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa20.61■□□□□ 0.89
CHTF18-218ENST00000569270 EHD2Q9NZN4 543 aa20.61■□□□□ 0.89
CHTF18-218ENST00000569270 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa20.61■□□□□ 0.89
CHTF18-218ENST00000569270 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa20.6■□□□□ 0.89
CHTF18-218ENST00000569270 A0A1B0GVL5 298 aa20.6■□□□□ 0.89
CHTF18-218ENST00000569270 CLDN5O00501 218 aa20.6■□□□□ 0.89
CHTF18-218ENST00000569270 ATG13O75143 517 aa20.6■□□□□ 0.89
CHTF18-218ENST00000569270 RNF40O75150 1001 aa20.6■□□□□ 0.89
CHTF18-218ENST00000569270 STAU1O95793 577 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
CHTF18-218ENST00000569270 ABL1P00519 1130 aa20.6■□□□□ 0.89
CHTF18-218ENST00000569270 RETP07949 1114 aa20.6■□□□□ 0.89
CHTF18-218ENST00000569270 PFKFB1P16118 471 aa20.6■□□□□ 0.89
CHTF18-218ENST00000569270 HOXA6P31267 233 aa20.6■□□□□ 0.89
CHTF18-218ENST00000569270 PDE6CP51160 858 aa20.6■□□□□ 0.89
CHTF18-218ENST00000569270 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
CHTF18-218ENST00000569270 CEP68Q76N32 757 aa20.6■□□□□ 0.89
CHTF18-218ENST00000569270 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
CHTF18-218ENST00000569270 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa20.6■□□□□ 0.89
CHTF18-218ENST00000569270 ELMO3Q96BJ8 720 aa20.6■□□□□ 0.89
CHTF18-218ENST00000569270 CHAMP1Q96JM3 812 aa20.6■□□□□ 0.89
CHTF18-218ENST00000569270 ELOVL4Q9GZR5 314 aa20.6■□□□□ 0.89
CHTF18-218ENST00000569270 LINC00597Q9H2U6 94 aa20.6■□□□□ 0.89
CHTF18-218ENST00000569270 SMYD3Q9H7B4 428 aa20.6■□□□□ 0.89
CHTF18-218ENST00000569270 SLC8A2Q9UPR5 921 aa20.6■□□□□ 0.89
CHTF18-218ENST00000569270 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa20.6■□□□□ 0.89
CHTF18-218ENST00000569270 FRYLO94915 3013 aa20.59■□□□□ 0.89
CHTF18-218ENST00000569270 ZNF840PA6NDX5 716 aa20.59■□□□□ 0.89
CHTF18-218ENST00000569270 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
CHTF18-218ENST00000569270 DRD1P21728 446 aa20.59■□□□□ 0.89
CHTF18-218ENST00000569270 RAP1GAPP47736 663 aa20.59■□□□□ 0.89
CHTF18-218ENST00000569270 CDH8P55286 799 aa20.59■□□□□ 0.89
CHTF18-218ENST00000569270 NOP14P78316 857 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
CHTF18-218ENST00000569270 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
CHTF18-218ENST00000569270 ZNF699Q32M78 642 aa20.59■□□□□ 0.89
CHTF18-218ENST00000569270 EML3Q32P44 896 aa20.59■□□□□ 0.89
CHTF18-218ENST00000569270 WDR5BQ86VZ2 330 aa20.59■□□□□ 0.89
CHTF18-218ENST00000569270 PARD3BQ8TEW8 1205 aa20.59■□□□□ 0.89
CHTF18-218ENST00000569270 EXOC4Q96A65 974 aa20.59■□□□□ 0.89
CHTF18-218ENST00000569270 TTLL2Q9BWV7 592 aa20.59■□□□□ 0.89
CHTF18-218ENST00000569270 B3GNT5Q9BYG0 378 aa20.59■□□□□ 0.89
CHTF18-218ENST00000569270 TMEM30AQ9NV96 361 aa20.59■□□□□ 0.89
CHTF18-218ENST00000569270 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
CHTF18-218ENST00000569270 SPTBN4Q9H254 2564 aa20.59■□□□□ 0.89
CHTF18-218ENST00000569270 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
CHTF18-218ENST00000569270 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa20.58■□□□□ 0.89
CHTF18-218ENST00000569270 CMA1P23946 247 aa20.58■□□□□ 0.89
CHTF18-218ENST00000569270 AP3M2P53677 418 aa20.58■□□□□ 0.89
CHTF18-218ENST00000569270 ARHGAP8P85298 464 aa20.58■□□□□ 0.89
CHTF18-218ENST00000569270 ZXDBP98169 803 aa20.58■□□□□ 0.89
CHTF18-218ENST00000569270 TAF10Q12962 218 aa20.58■□□□□ 0.89
CHTF18-218ENST00000569270 PSMD2Q13200 908 aa20.58■□□□□ 0.89
CHTF18-218ENST00000569270 NCOA4Q13772 614 aa20.58■□□□□ 0.89
CHTF18-218ENST00000569270 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa20.58■□□□□ 0.89
CHTF18-218ENST00000569270 CD101Q93033 1021 aa20.58■□□□□ 0.89
CHTF18-218ENST00000569270 SPATA32Q96LK8 384 aa20.58■□□□□ 0.89
CHTF18-218ENST00000569270 DMAC2Q9NW81 257 aa20.58■□□□□ 0.89
CHTF18-218ENST00000569270 SMPD4Q9NXE4 827 aa20.58■□□□□ 0.89
CHTF18-218ENST00000569270 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
CHTF18-218ENST00000569270 DCHS1Q96JQ0 3298 aa20.58■□□□□ 0.88
CHTF18-218ENST00000569270 LEFTY2O00292 366 aa20.57■□□□□ 0.88
CHTF18-218ENST00000569270 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
CHTF18-218ENST00000569270 SDHBP21912 280 aa20.57■□□□□ 0.88
CHTF18-218ENST00000569270 DLG4P78352 724 aa20.57■□□□□ 0.88
CHTF18-218ENST00000569270 CLDN10P78369 228 aa20.57■□□□□ 0.88
CHTF18-218ENST00000569270 NR1H3Q13133 447 aa20.57■□□□□ 0.88
CHTF18-218ENST00000569270 ZNF667Q5HYK9 610 aa20.57■□□□□ 0.88
CHTF18-218ENST00000569270 MED10Q9BTT4 135 aa20.57■□□□□ 0.88
CHTF18-218ENST00000569270 RNF38Q9H0F5 515 aa20.57■□□□□ 0.88
CHTF18-218ENST00000569270 KCTD10Q9H3F6 313 aa20.57■□□□□ 0.88
CHTF18-218ENST00000569270 VRTNQ9H8Y1 702 aa20.57■□□□□ 0.88
CHTF18-218ENST00000569270 USP25Q9UHP3 1055 aa20.57■□□□□ 0.88
CHTF18-218ENST00000569270 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
CHTF18-218ENST00000569270 VNN1O95497 513 aa20.56■□□□□ 0.88
CHTF18-218ENST00000569270 NFATC1O95644 943 aa20.56■□□□□ 0.88
CHTF18-218ENST00000569270 NR3C1P04150 777 aa20.56■□□□□ 0.88
CHTF18-218ENST00000569270 TCF3P15923 654 aa20.56■□□□□ 0.88
CHTF18-218ENST00000569270 PFKLP17858 780 aa20.56■□□□□ 0.88
CHTF18-218ENST00000569270 PPP3CCP48454 512 aa20.56■□□□□ 0.88
CHTF18-218ENST00000569270 KRT85P78386 507 aa20.56■□□□□ 0.88
CHTF18-218ENST00000569270 FBXO43Q4G163 708 aa20.56■□□□□ 0.88
CHTF18-218ENST00000569270 CEP135Q66GS9 1140 aa20.56■□□□□ 0.88
CHTF18-218ENST00000569270 SLC9A9Q8IVB4 645 aa20.56■□□□□ 0.88
CHTF18-218ENST00000569270 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
CHTF18-218ENST00000569270 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa20.56■□□□□ 0.88
CHTF18-218ENST00000569270 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
CHTF18-218ENST00000569270 SLITRK1Q96PX8 696 aa20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.9 ms