RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568900.5

SPNS1-212, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 2

Gene SPNS1, Length 2,253 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-212ENST00000568900 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
SPNS1-212ENST00000568900 ZBTB9Q96C00 473 aa21.95■■□□□ 1.1
SPNS1-212ENST00000568900 SLITRK1Q96PX8 696 aa21.95■■□□□ 1.1
SPNS1-212ENST00000568900 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
SPNS1-212ENST00000568900 TRIM31Q9BZY9 425 aa21.95■■□□□ 1.1
SPNS1-212ENST00000568900 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
SPNS1-212ENST00000568900 PCYOX1Q9UHG3 505 aa21.95■■□□□ 1.1
SPNS1-212ENST00000568900 DAPK3O43293 454 aa21.94■■□□□ 1.1
SPNS1-212ENST00000568900 RNF8O76064 485 aa21.94■■□□□ 1.1
SPNS1-212ENST00000568900 LCP1P13796 627 aa21.94■■□□□ 1.1
SPNS1-212ENST00000568900 IL1R2P27930 398 aa21.94■■□□□ 1.1
SPNS1-212ENST00000568900 PTGIRP43119 386 aa21.94■■□□□ 1.1
SPNS1-212ENST00000568900 KCNJ1P48048 391 aa21.94■■□□□ 1.1
SPNS1-212ENST00000568900 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP21.94■■□□□ 1.1
SPNS1-212ENST00000568900 HADHQ16836 314 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
SPNS1-212ENST00000568900 GLB1LQ6UWU2 654 aa21.94■■□□□ 1.1
SPNS1-212ENST00000568900 MFSD7Q6UXD7 560 aa21.94■■□□□ 1.1
SPNS1-212ENST00000568900 CCDC105Q8IYK2 499 aa21.94■■□□□ 1.1
SPNS1-212ENST00000568900 RAPGEF5Q92565 580 aa21.94■■□□□ 1.1
SPNS1-212ENST00000568900 RAB17Q9H0T7 212 aa21.94■■□□□ 1.1
SPNS1-212ENST00000568900 DPH5Q9H2P9 285 aa21.94■■□□□ 1.1
SPNS1-212ENST00000568900 ASNSD1Q9NWL6 643 aa21.94■■□□□ 1.1
SPNS1-212ENST00000568900 FAM187AA6NFU0 413 aa21.94■■□□□ 1.1
SPNS1-212ENST00000568900 EOMESO95936 686 aa21.94■■□□□ 1.1
SPNS1-212ENST00000568900 CCL5P13501 91 aa21.94■■□□□ 1.1
SPNS1-212ENST00000568900 BRCC3P46736 316 aa21.94■■□□□ 1.1
SPNS1-212ENST00000568900 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
SPNS1-212ENST00000568900 BFSP2Q13515 415 aa21.94■■□□□ 1.1
SPNS1-212ENST00000568900 SNX1Q13596 522 aa21.94■■□□□ 1.1
SPNS1-212ENST00000568900 CUL1Q13616 776 aa21.94■■□□□ 1.1
SPNS1-212ENST00000568900 POLNQ7Z5Q5 900 aa21.94■■□□□ 1.1
SPNS1-212ENST00000568900 ATG4AQ8WYN0 398 aa21.94■■□□□ 1.1
SPNS1-212ENST00000568900 SYT15Q9BQS2 421 aa21.94■■□□□ 1.1
SPNS1-212ENST00000568900 MED10Q9BTT4 135 aa21.94■■□□□ 1.1
SPNS1-212ENST00000568900 LRRC19Q9H756 370 aa21.94■■□□□ 1.1
SPNS1-212ENST00000568900 CRTAC1Q9NQ79 661 aa21.94■■□□□ 1.1
SPNS1-212ENST00000568900 PCSK1NQ9UHG2 260 aa21.94■■□□□ 1.1
SPNS1-212ENST00000568900 LRRD1A4D1F6 860 aa21.93■■□□□ 1.1
SPNS1-212ENST00000568900 FAM153BP0C7A2 387 aa21.93■■□□□ 1.1
SPNS1-212ENST00000568900 KRT10P13645 584 aa21.93■■□□□ 1.1
SPNS1-212ENST00000568900 ACAP1Q15027 740 aa21.93■■□□□ 1.1
SPNS1-212ENST00000568900 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
SPNS1-212ENST00000568900 FAM153CQ494X1 144 aa21.93■■□□□ 1.1
SPNS1-212ENST00000568900 KCNT1Q5JUK3 1230 aa21.93■■□□□ 1.1
SPNS1-212ENST00000568900 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa21.93■■□□□ 1.1
SPNS1-212ENST00000568900 KAZNQ674X7 775 aa21.93■■□□□ 1.1
SPNS1-212ENST00000568900 KRT222Q8N1A0 295 aa21.93■■□□□ 1.1
SPNS1-212ENST00000568900 CLEC4CQ8WTT0 213 aa21.93■■□□□ 1.1
SPNS1-212ENST00000568900 CNPY3Q9BT09 278 aa21.93■■□□□ 1.1
SPNS1-212ENST00000568900 DUSP16Q9BY84 665 aa21.93■■□□□ 1.1
SPNS1-212ENST00000568900 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa21.93■■□□□ 1.1
SPNS1-212ENST00000568900 CHST7Q9NS84 486 aa21.93■■□□□ 1.1
SPNS1-212ENST00000568900 FAM153AQ9UHL3 310 aa21.93■■□□□ 1.1
SPNS1-212ENST00000568900 RASAL2Q9UJF2 1139 aa21.93■■□□□ 1.1
SPNS1-212ENST00000568900 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
SPNS1-212ENST00000568900 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
SPNS1-212ENST00000568900 NBNO60934 754 aa21.92■■□□□ 1.1
SPNS1-212ENST00000568900 KRT7P08729 469 aa21.92■■□□□ 1.1
SPNS1-212ENST00000568900 ODC1P11926 461 aa21.92■■□□□ 1.1
SPNS1-212ENST00000568900 MIPP30301 263 aa21.92■■□□□ 1.1
SPNS1-212ENST00000568900 FNTAP49354 379 aa21.92■■□□□ 1.1
SPNS1-212ENST00000568900 CDO1Q16878 200 aa21.92■■□□□ 1.1
SPNS1-212ENST00000568900 CLLU1OSQ5K130 101 aa21.92■■□□□ 1.1
SPNS1-212ENST00000568900 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa21.92■■□□□ 1.1
SPNS1-212ENST00000568900 PAQR9Q6ZVX9 377 aa21.92■■□□□ 1.1
SPNS1-212ENST00000568900 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa21.92■■□□□ 1.1
SPNS1-212ENST00000568900 UROC1Q96N76 676 aa21.92■■□□□ 1.1
SPNS1-212ENST00000568900 ERP44Q9BS26 406 aa21.92■■□□□ 1.1
SPNS1-212ENST00000568900 FTHL17Q9BXU8 183 aa21.92■■□□□ 1.1
SPNS1-212ENST00000568900 TSC2P49815 1807 aa21.92■■□□□ 1.1
SPNS1-212ENST00000568900 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
SPNS1-212ENST00000568900 INPPL1O15357 1258 aa21.92■■□□□ 1.1
SPNS1-212ENST00000568900 SLC8A3P57103 927 aa21.92■■□□□ 1.1
SPNS1-212ENST00000568900 FAM189BP81408 668 aa21.92■■□□□ 1.1
SPNS1-212ENST00000568900 CD300LGQ6UXG3 332 aa21.92■■□□□ 1.1
SPNS1-212ENST00000568900 SEC14L1Q92503 715 aa21.92■■□□□ 1.1
SPNS1-212ENST00000568900 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP21.92■■□□□ 1.1
SPNS1-212ENST00000568900 CAVIN3Q969G5 261 aa21.92■■□□□ 1.1
SPNS1-212ENST00000568900 CFAP57Q96MR6 1250 aa21.92■■□□□ 1.1
SPNS1-212ENST00000568900 RUNDC3BQ96NL0 473 aa21.92■■□□□ 1.1
SPNS1-212ENST00000568900 OGDHLQ9ULD0 1010 aa21.92■■□□□ 1.1
SPNS1-212ENST00000568900 NPR3P17342 541 aa21.91■■□□□ 1.1
SPNS1-212ENST00000568900 ECHS1P30084 290 aa21.91■■□□□ 1.1
SPNS1-212ENST00000568900 RPL34P49207 117 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
SPNS1-212ENST00000568900 PIGZQ86VD9 579 aa21.91■■□□□ 1.1
SPNS1-212ENST00000568900 HSFY1Q96LI6 401 aa21.91■■□□□ 1.1
SPNS1-212ENST00000568900 DCLK3Q9C098 648 aa21.91■■□□□ 1.1
SPNS1-212ENST00000568900 CYLDQ9NQC7 956 aa21.91■■□□□ 1.1
SPNS1-212ENST00000568900 USP18Q9UMW8 372 aa21.91■■□□□ 1.1
SPNS1-212ENST00000568900 MYBPHLA2RUH7 354 aa21.91■■□□□ 1.1
SPNS1-212ENST00000568900 F8W810 466 aa21.91■■□□□ 1.1
SPNS1-212ENST00000568900 BEST1O76090 585 aa21.91■■□□□ 1.1
SPNS1-212ENST00000568900 ITGB1P05556 798 aa21.91■■□□□ 1.1
SPNS1-212ENST00000568900 ACADSBP45954 432 aa21.91■■□□□ 1.1
SPNS1-212ENST00000568900 CBX1P83916 185 aa21.91■■□□□ 1.1
SPNS1-212ENST00000568900 ATP11AP98196 1134 aa21.91■■□□□ 1.1
SPNS1-212ENST00000568900 ADCY2Q08462 1091 aa21.91■■□□□ 1.1
SPNS1-212ENST00000568900 CCDC14Q49A88 953 aa21.91■■□□□ 1.1
SPNS1-212ENST00000568900 RAB6CQ53S08 254 aa21.91■■□□□ 1.1
SPNS1-212ENST00000568900 DUPD1Q68J44 220 aa21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.4 ms