RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564743.1

AC009088.2-201, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene AC009088.2, Length 463 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC009088.2-201ENST00000564743 CEP135Q66GS9 1140 aa15.49■□□□□ 0.07
AC009088.2-201ENST00000564743 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa15.49■□□□□ 0.07
AC009088.2-201ENST00000564743 RIN3Q8TB24 985 aa15.49■□□□□ 0.07
AC009088.2-201ENST00000564743 TMEM174Q8WUU8 243 aa15.49■□□□□ 0.07
AC009088.2-201ENST00000564743 ATP2A3Q93084 1043 aa15.49■□□□□ 0.07
AC009088.2-201ENST00000564743 EXOC4Q96A65 974 aa15.49■□□□□ 0.07
AC009088.2-201ENST00000564743 C8orf48Q96LL4 319 aa15.49■□□□□ 0.07
AC009088.2-201ENST00000564743 SMYD3Q9H7B4 428 aa15.49■□□□□ 0.07
AC009088.2-201ENST00000564743 VRTNQ9H8Y1 702 aa15.49■□□□□ 0.07
AC009088.2-201ENST00000564743 GCNT4Q9P109 453 aa15.49■□□□□ 0.07
AC009088.2-201ENST00000564743 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa15.49■□□□□ 0.07
AC009088.2-201ENST00000564743 NME7Q9Y5B8 376 aa15.49■□□□□ 0.07
AC009088.2-201ENST00000564743 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
AC009088.2-201ENST00000564743 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
AC009088.2-201ENST00000564743 ABL1P00519 1130 aa15.48■□□□□ 0.07
AC009088.2-201ENST00000564743 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
AC009088.2-201ENST00000564743 P4HA1P13674 534 aa15.48■□□□□ 0.07
AC009088.2-201ENST00000564743 PPP3CCP48454 512 aa15.48■□□□□ 0.07
AC009088.2-201ENST00000564743 USP46P62068 366 aa15.48■□□□□ 0.07
AC009088.2-201ENST00000564743 NOP14P78316 857 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
AC009088.2-201ENST00000564743 CLDN10P78369 228 aa15.48■□□□□ 0.07
AC009088.2-201ENST00000564743 USP4Q13107 963 aa15.48■□□□□ 0.07
AC009088.2-201ENST00000564743 SH3RF2Q8TEC5 729 aa15.48■□□□□ 0.07
AC009088.2-201ENST00000564743 OSCP1Q8WVF1 389 aa15.48■□□□□ 0.07
AC009088.2-201ENST00000564743 TNIP3Q96KP6 325 aa15.48■□□□□ 0.07
AC009088.2-201ENST00000564743 MED10Q9BTT4 135 aa15.48■□□□□ 0.07
AC009088.2-201ENST00000564743 TTLL2Q9BWV7 592 aa15.48■□□□□ 0.07
AC009088.2-201ENST00000564743 B3GNT5Q9BYG0 378 aa15.48■□□□□ 0.07
AC009088.2-201ENST00000564743 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa15.48■□□□□ 0.07
AC009088.2-201ENST00000564743 GMEB2Q9UKD1 530 aa15.48■□□□□ 0.07
AC009088.2-201ENST00000564743 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa15.48■□□□□ 0.07
AC009088.2-201ENST00000564743 WNT6Q9Y6F9 365 aa15.48■□□□□ 0.07
AC009088.2-201ENST00000564743 SPTBN4Q9H254 2564 aa15.47■□□□□ 0.07
AC009088.2-201ENST00000564743 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa15.47■□□□□ 0.07
AC009088.2-201ENST00000564743 A0A1W2PQ27 194 aa15.47■□□□□ 0.07
AC009088.2-201ENST00000564743 A0A1W2PQ64 194 aa15.47■□□□□ 0.07
AC009088.2-201ENST00000564743 A0A1W2PQD8 194 aa15.47■□□□□ 0.07
AC009088.2-201ENST00000564743 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa15.47■□□□□ 0.07
AC009088.2-201ENST00000564743 CLDN5O00501 218 aa15.47■□□□□ 0.07
AC009088.2-201ENST00000564743 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
AC009088.2-201ENST00000564743 PRR29P0C7W0 189 aa15.47■□□□□ 0.07
AC009088.2-201ENST00000564743 PFKLP17858 780 aa15.47■□□□□ 0.07
AC009088.2-201ENST00000564743 RAP1GAPP47736 663 aa15.47■□□□□ 0.07
AC009088.2-201ENST00000564743 FNTBP49356 437 aa15.47■□□□□ 0.07
AC009088.2-201ENST00000564743 CDH8P55286 799 aa15.47■□□□□ 0.07
AC009088.2-201ENST00000564743 DLG4P78352 724 aa15.47■□□□□ 0.07
AC009088.2-201ENST00000564743 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
AC009088.2-201ENST00000564743 NR1H3Q13133 447 aa15.47■□□□□ 0.07
AC009088.2-201ENST00000564743 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa15.47■□□□□ 0.07
AC009088.2-201ENST00000564743 TMEM196Q5HYL7 178 aa15.47■□□□□ 0.07
AC009088.2-201ENST00000564743 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
AC009088.2-201ENST00000564743 FSTL4Q6MZW2 842 aa15.47■□□□□ 0.07
AC009088.2-201ENST00000564743 PRR23BQ6ZRT6 265 aa15.47■□□□□ 0.07
AC009088.2-201ENST00000564743 FANCMQ8IYD8 2048 aa15.47■□□□□ 0.07
AC009088.2-201ENST00000564743 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
AC009088.2-201ENST00000564743 TMC2Q8TDI7 906 aa15.47■□□□□ 0.07
AC009088.2-201ENST00000564743 SLITRK1Q96PX8 696 aa15.47■□□□□ 0.07
AC009088.2-201ENST00000564743 ECT2Q9H8V3 914 aa15.47■□□□□ 0.07
AC009088.2-201ENST00000564743 ZNF840PA6NDX5 716 aa15.46■□□□□ 0.07
AC009088.2-201ENST00000564743 K7ESF4 209 aa15.46■□□□□ 0.07
AC009088.2-201ENST00000564743 ATG13O75143 517 aa15.46■□□□□ 0.07
AC009088.2-201ENST00000564743 RHOBTB3O94955 611 aa15.46■□□□□ 0.07
AC009088.2-201ENST00000564743 VNN1O95497 513 aa15.46■□□□□ 0.07
AC009088.2-201ENST00000564743 DRD1P21728 446 aa15.46■□□□□ 0.07
AC009088.2-201ENST00000564743 GJA4P35212 333 aa15.46■□□□□ 0.07
AC009088.2-201ENST00000564743 PIK3CAP42336 1068 aa15.46■□□□□ 0.07
AC009088.2-201ENST00000564743 CACNA2D1P54289 1103 aa15.46■□□□□ 0.07
AC009088.2-201ENST00000564743 DMWDQ09019 674 aa15.46■□□□□ 0.07
AC009088.2-201ENST00000564743 DPYDQ12882 1025 aa15.46■□□□□ 0.07
AC009088.2-201ENST00000564743 TAF10Q12962 218 aa15.46■□□□□ 0.07
AC009088.2-201ENST00000564743 LPAL2Q16609 132 aa15.46■□□□□ 0.07
AC009088.2-201ENST00000564743 ZACNQ401N2 412 aa15.46■□□□□ 0.07
AC009088.2-201ENST00000564743 KRBA2Q6ZNG9 492 aa15.46■□□□□ 0.07
AC009088.2-201ENST00000564743 LONP2Q86WA8 852 aa15.46■□□□□ 0.07
AC009088.2-201ENST00000564743 NUP93Q8N1F7 819 aa15.46■□□□□ 0.07
AC009088.2-201ENST00000564743 ELMO3Q96BJ8 720 aa15.46■□□□□ 0.07
AC009088.2-201ENST00000564743 CCDC34Q96HJ3 373 aa15.46■□□□□ 0.07
AC009088.2-201ENST00000564743 P2RY13Q9BPV8 354 aa15.46■□□□□ 0.07
AC009088.2-201ENST00000564743 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa15.46■□□□□ 0.07
AC009088.2-201ENST00000564743 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa15.46■□□□□ 0.07
AC009088.2-201ENST00000564743 GPR179Q6PRD1 2367 aa15.46■□□□□ 0.06
AC009088.2-201ENST00000564743 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa15.45■□□□□ 0.06
AC009088.2-201ENST00000564743 LEFTY2O00292 366 aa15.45■□□□□ 0.06
AC009088.2-201ENST00000564743 IKBKBO14920 756 aa15.45■□□□□ 0.06
AC009088.2-201ENST00000564743 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
AC009088.2-201ENST00000564743 EGFP01133 1207 aa15.45■□□□□ 0.06
AC009088.2-201ENST00000564743 TCF3P15923 654 aa15.45■□□□□ 0.06
AC009088.2-201ENST00000564743 NR2F2P24468 414 aa15.45■□□□□ 0.06
AC009088.2-201ENST00000564743 YWHAQP27348 245 aa15.45■□□□□ 0.06
AC009088.2-201ENST00000564743 CNR2P34972 360 aa15.45■□□□□ 0.06
AC009088.2-201ENST00000564743 GALK1P51570 392 aa15.45■□□□□ 0.06
AC009088.2-201ENST00000564743 VAMP7P51809 220 aa15.45■□□□□ 0.06
AC009088.2-201ENST00000564743 FOXK2Q01167 660 aa15.45■□□□□ 0.06
AC009088.2-201ENST00000564743 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
AC009088.2-201ENST00000564743 EML3Q32P44 896 aa15.45■□□□□ 0.06
AC009088.2-201ENST00000564743 LAIR1Q6GTX8 287 aa15.45■□□□□ 0.06
AC009088.2-201ENST00000564743 SV2AQ7L0J3 742 aa15.45■□□□□ 0.06
AC009088.2-201ENST00000564743 FAM35AQ86V20 835 aa15.45■□□□□ 0.06
AC009088.2-201ENST00000564743 TAF4BQ92750 862 aa15.45■□□□□ 0.06
AC009088.2-201ENST00000564743 CHFRQ96EP1 664 aa15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.5 ms