RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556356.1

LRP1-211, Transcript of LDL receptor related protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene LRP1, Length 5,114 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Exosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1-211ENST00000556356 CCR1P32246 355 aa15.91■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 RPL9P32969 192 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 NCKAP1LP55160 1127 aa15.91■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 CRLF3Q8IUI8 442 aa15.91■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 TSPAN18Q96SJ8 248 aa15.91■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 DOLKQ9UPQ8 538 aa15.91■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 TMTC4Q5T4D3 741 aa15.91■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 SYCP2LQ5T4T6 812 aa15.91■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa15.91■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 CARD9Q9H257 536 aa15.91■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 GRM5P41594 1212 aa15.91■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 TBX4P57082 545 aa15.91■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 GRIK3Q13003 919 aa15.91■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 RCN2Q14257 317 aa15.91■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 ANKMY2Q8IV38 441 aa15.91■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 C7orf43Q8WVR3 580 aa15.91■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 LPPQ93052 612 aa15.91■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 CYTH2Q99418 400 aa15.91■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 FAM105AQ9NUU6 356 aa15.91■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 VPS28Q9UK41 221 aa15.91■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 C2CD2Q9Y426 696 aa15.91■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa15.9■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 CAPN15O75808 1086 aa15.9■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 NFICP08651 508 aa15.9■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 GIPC2Q8TF65 315 aa15.9■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 BTBD6Q96KE9 485 aa15.9■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 AOC2O75106 756 aa15.9■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 CASP5P51878 434 aa15.9■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 IL17AQ16552 155 aa15.9■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 LINC00523Q86TU6 105 aa15.9■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 CALML6Q8TD86 181 aa15.9■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 RUBCNQ92622 972 aa15.9■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 SERPINB11Q96P15 392 aa15.9■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa15.9■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 FOXP3Q9BZS1 431 aa15.9■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 TLL1O43897 1013 aa15.9■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 GJB1P08034 283 aa15.9■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP15.9■□□□□ 0.147e-7■□□□□ 9.8
LRP1-211ENST00000556356 STIP1P31948 543 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 APLP1P51693 650 aa15.9■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 HYIQ5T013 277 aa15.9■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 ANKS3Q6ZW76 656 aa15.9■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 EDEM1Q92611 657 aa15.9■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 TNFRSF25Q93038 417 aa15.9■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 FOPNLQ96NB1 174 aa15.9■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 ZBTB18Q99592 522 aa15.9■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 COL20A1Q9P218 1284 aa15.9■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 USP18Q9UMW8 372 aa15.9■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 PROSCO94903 275 aa15.9■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 DARSP14868 501 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 GEMP55040 296 aa15.9■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 WSCD1Q658N2 575 aa15.9■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 EMC1Q8N766 993 aa15.9■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 FAM118BQ9BPY3 351 aa15.9■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 GOLPH3Q9H4A6 298 aa15.9■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 TMEM51Q9NW97 253 aa15.9■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 C10orf71Q711Q0 1435 aa15.9■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 SMIM24O75264 130 aa15.89■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 BDNFP23560 247 aa15.89■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 STAT4Q14765 748 aa15.89■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 CCNYL1Q8N7R7 359 aa15.89■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 APBB2Q92870 758 aa15.89■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 PTPRN2Q92932 1015 aa15.89■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 TRIM51Q9BSJ1 452 aa15.89■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 NUF2Q9BZD4 464 aa15.89■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 KCNF1Q9H3M0 494 aa15.89■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa15.89■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 PKP3Q9Y446 797 aa15.89■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
LRP1-211ENST00000556356 FDFT1P37268 417 aa15.89■□□□□ 0.13
LRP1-211ENST00000556356 USP41Q3LFD5 358 aa15.89■□□□□ 0.13
LRP1-211ENST00000556356 PALB2Q86YC2 1186 aa15.89■□□□□ 0.13
LRP1-211ENST00000556356 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
LRP1-211ENST00000556356 RNF135Q8IUD6 432 aa15.89■□□□□ 0.13
LRP1-211ENST00000556356 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
LRP1-211ENST00000556356 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
LRP1-211ENST00000556356 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP15.89■□□□□ 0.13
LRP1-211ENST00000556356 RNF19AQ9NV58 838 aa15.89■□□□□ 0.13
LRP1-211ENST00000556356 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa15.89■□□□□ 0.13
LRP1-211ENST00000556356 GPR25O00155 361 aa15.89■□□□□ 0.13
LRP1-211ENST00000556356 B4GALT5O43286 388 aa15.89■□□□□ 0.13
LRP1-211ENST00000556356 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
LRP1-211ENST00000556356 OCRLQ01968 901 aa15.89■□□□□ 0.13
LRP1-211ENST00000556356 FSTL1Q12841 308 aa15.89■□□□□ 0.13
LRP1-211ENST00000556356 CES5AQ6NT32 575 aa15.89■□□□□ 0.13
LRP1-211ENST00000556356 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa15.89■□□□□ 0.13
LRP1-211ENST00000556356 LRRC43Q8N309 656 aa15.89■□□□□ 0.13
LRP1-211ENST00000556356 FAM71DQ8N9W8 422 aa15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48 ms