RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549306.1

HECTD4-210, Transcript of HECT domain E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 2

Gene HECTD4, Length 543 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4-210ENST00000549306 FPR3P25089 353 aa5.38□□□□□ -1.55
HECTD4-210ENST00000549306 HK3P52790 923 aa5.38□□□□□ -1.55
HECTD4-210ENST00000549306 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa5.38□□□□□ -1.55
HECTD4-210ENST00000549306 PPP1R3BQ86XI6 285 aa5.38□□□□□ -1.55
HECTD4-210ENST00000549306 SLC15A3Q8IY34 581 aa5.38□□□□□ -1.55
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HECTD4-210ENST00000549306 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
HECTD4-210ENST00000549306 PROCRQ9UNN8 238 aa5.38□□□□□ -1.55
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HECTD4-210ENST00000549306 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa5.37□□□□□ -1.55
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HECTD4-210ENST00000549306 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
HECTD4-210ENST00000549306 PIP4P1Q86T03 277 aa5.36□□□□□ -1.55
HECTD4-210ENST00000549306 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP5.36□□□□□ -1.55
HECTD4-210ENST00000549306 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
HECTD4-210ENST00000549306 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP5.36□□□□□ -1.55
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HECTD4-210ENST00000549306 hCG_1984214I3L0E3 225 aa5.35□□□□□ -1.55
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HECTD4-210ENST00000549306 TMEM184CQ9NVA4 438 aa5.35□□□□□ -1.55
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HECTD4-210ENST00000549306 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP5.34□□□□□ -1.55
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HECTD4-210ENST00000549306 CYP1B1Q16678 543 aa5.34□□□□□ -1.55
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HECTD4-210ENST00000549306 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP5.34□□□□□ -1.55
HECTD4-210ENST00000549306 SIRT6Q8N6T7 355 aa5.34□□□□□ -1.55
HECTD4-210ENST00000549306 MAP4K1Q92918 833 aa5.34□□□□□ -1.55
HECTD4-210ENST00000549306 FAM167AQ96KS9 214 aa5.34□□□□□ -1.55
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HECTD4-210ENST00000549306 PNPOQ9NVS9 261 aa5.34□□□□□ -1.55
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HECTD4-210ENST00000549306 T-ENOLP0DO92 83 aa5.33□□□□□ -1.56
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HECTD4-210ENST00000549306 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
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HECTD4-210ENST00000549306 DEF8Q6ZN54 512 aa5.33□□□□□ -1.56
HECTD4-210ENST00000549306 COLCA1Q6ZS62 124 aa5.33□□□□□ -1.56
HECTD4-210ENST00000549306 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa5.33□□□□□ -1.56
HECTD4-210ENST00000549306 SFTPA1Q8IWL2 248 aa5.33□□□□□ -1.56
HECTD4-210ENST00000549306 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP5.33□□□□□ -1.56
HECTD4-210ENST00000549306 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP5.33□□□□□ -1.56
HECTD4-210ENST00000549306 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP5.33□□□□□ -1.56
HECTD4-210ENST00000549306 FAM234AQ9H0X4 552 aa5.33□□□□□ -1.56
HECTD4-210ENST00000549306 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
HECTD4-210ENST00000549306 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
HECTD4-210ENST00000549306 TTC3P53804 2025 aa5.32□□□□□ -1.56
HECTD4-210ENST00000549306 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP5.32□□□□□ -1.56
HECTD4-210ENST00000549306 TULP3O75386 442 aa5.32□□□□□ -1.56
HECTD4-210ENST00000549306 TOMM40O96008 361 aa5.32□□□□□ -1.56
HECTD4-210ENST00000549306 MT-CO3P00414 261 aa5.32□□□□□ -1.56
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