RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546120.2

UBC-213, Transcript of ubiquitin C, human

TSL 5 BASIC

Gene UBC, Length 718 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBC-213	ENST00000546120	SNN	O75324	88 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
UBC-213	ENST00000546120	TOMM70	O94826	608 aa		10.6	□□□□□ -0.71
UBC-213	ENST00000546120	SERPINB2	P05120	415 aa		10.6	□□□□□ -0.71
UBC-213	ENST00000546120	ENO1	P06733	434 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71
UBC-213	ENST00000546120	CYP3A4	P08684	503 aa		10.6	□□□□□ -0.71
UBC-213	ENST00000546120	CYP19A1	P11511	503 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
UBC-213	ENST00000546120	ALOX15	P16050	662 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
UBC-213	ENST00000546120	PSMC3	P17980	439 aa		10.6	□□□□□ -0.71
UBC-213	ENST00000546120	VARS	P26640	1264 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71
UBC-213	ENST00000546120	PML	P29590	882 aa		10.6	□□□□□ -0.71
UBC-213	ENST00000546120	SERPINB6	P35237	376 aa		10.6	□□□□□ -0.71
UBC-213	ENST00000546120	MAGEA10	P43363	369 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
UBC-213	ENST00000546120	MARCKSL1	P49006	195 aa		10.6	□□□□□ -0.71
UBC-213	ENST00000546120	VAMP7	P51809	220 aa		10.6	□□□□□ -0.71
UBC-213	ENST00000546120	CASP5	P51878	434 aa		10.6	□□□□□ -0.71
UBC-213	ENST00000546120	STAT2	P52630	851 aa		10.6	□□□□□ -0.71
UBC-213	ENST00000546120	ZNF200	P98182	395 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
UBC-213	ENST00000546120	GCNT1	Q02742	428 aa		10.6	□□□□□ -0.71
UBC-213	ENST00000546120	FAAP100	Q0VG06	881 aa		10.6	□□□□□ -0.71
UBC-213	ENST00000546120	PPIL2	Q13356	520 aa		10.6	□□□□□ -0.71
UBC-213	ENST00000546120	MSLN	Q13421	630 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
UBC-213	ENST00000546120	ECM1	Q16610	540 aa		10.6	□□□□□ -0.71
UBC-213	ENST00000546120	MOG	Q16653	247 aa		10.6	□□□□□ -0.71
UBC-213	ENST00000546120	PTPRO	Q16827	1216 aa		10.6	□□□□□ -0.71
UBC-213	ENST00000546120	ARHGAP44	Q17R89	818 aa		10.6	□□□□□ -0.71
UBC-213	ENST00000546120	KCTD21	Q4G0X4	260 aa		10.6	□□□□□ -0.71
UBC-213	ENST00000546120	SFT2D3	Q587I9	215 aa		10.6	□□□□□ -0.71
UBC-213	ENST00000546120	DEPDC1	Q5TB30	811 aa		10.6	□□□□□ -0.71
UBC-213	ENST00000546120	ANGEL2	Q5VTE6	544 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71
UBC-213	ENST00000546120	POTEB	Q6S5H4	581 aa		10.6	□□□□□ -0.71
UBC-213	ENST00000546120	TIFAB	Q6ZNK6	161 aa		10.6	□□□□□ -0.71
UBC-213	ENST00000546120	RAPH1	Q70E73	1250 aa		10.6	□□□□□ -0.71
UBC-213	ENST00000546120	MIER3	Q7Z3K6	550 aa		10.6	□□□□□ -0.71
UBC-213	ENST00000546120	KRT27	Q7Z3Y8	459 aa		10.6	□□□□□ -0.71
UBC-213	ENST00000546120	SLC26A11	Q86WA9	606 aa		10.6	□□□□□ -0.71
UBC-213	ENST00000546120	CATSPER3	Q86XQ3	398 aa		10.6	□□□□□ -0.71
UBC-213	ENST00000546120	SAMD3	Q8N6K7	520 aa		10.6	□□□□□ -0.71
UBC-213	ENST00000546120	PACRGL	Q8N7B6	248 aa		10.6	□□□□□ -0.71
UBC-213	ENST00000546120	DEPTOR	Q8TB45	409 aa		10.6	□□□□□ -0.71
UBC-213	ENST00000546120	PNPT1	Q8TCS8	783 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71
UBC-213	ENST00000546120	TMC2	Q8TDI7	906 aa		10.6	□□□□□ -0.71
UBC-213	ENST00000546120	PPP4R1	Q8TF05	950 aa		10.6	□□□□□ -0.71
UBC-213	ENST00000546120	CHPT1	Q8WUD6	406 aa		10.6	□□□□□ -0.71
UBC-213	ENST00000546120	DCAKD	Q8WVC6	231 aa		10.6	□□□□□ -0.71
UBC-213	ENST00000546120	SPIRE2	Q8WWL2	714 aa		10.6	□□□□□ -0.71
UBC-213	ENST00000546120	NLRP3	Q96P20	1036 aa		10.6	□□□□□ -0.71
UBC-213	ENST00000546120	NACC1	Q96RE7	527 aa		10.6	□□□□□ -0.71
UBC-213	ENST00000546120	TUBA1C	Q9BQE3	449 aa		10.6	□□□□□ -0.71
UBC-213	ENST00000546120	IMPG2	Q9BZV3	1241 aa		10.6	□□□□□ -0.71
UBC-213	ENST00000546120	HIPK3	Q9H422	1215 aa		10.6	□□□□□ -0.71
UBC-213	ENST00000546120	PFDN4	Q9NQP4	134 aa		10.6	□□□□□ -0.71
UBC-213	ENST00000546120	ARHGEF4	Q9NR80	690 aa		10.6	□□□□□ -0.71
UBC-213	ENST00000546120	PNPLA3	Q9NST1	481 aa		10.6	□□□□□ -0.71
UBC-213	ENST00000546120	GID8	Q9NWU2	228 aa		10.6	□□□□□ -0.71
UBC-213	ENST00000546120	TAS2R14	Q9NYV8	317 aa		10.6	□□□□□ -0.71
UBC-213	ENST00000546120	CDH22	Q9UJ99	828 aa		10.6	□□□□□ -0.71
UBC-213	ENST00000546120	ANAPC7	Q9UJX3	599 aa		10.6	□□□□□ -0.71
UBC-213	ENST00000546120	AJAP1	Q9UKB5	411 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
UBC-213	ENST00000546120	MYRF	Q9Y2G1	1151 aa		10.6	□□□□□ -0.71
UBC-213	ENST00000546120	PCDHB2	Q9Y5E7	798 aa		10.6	□□□□□ -0.71
UBC-213	ENST00000546120	KIAA1551	Q9HCM1	1747 aa		10.59	□□□□□ -0.71
UBC-213	ENST00000546120	TRIM64C	A6NLI5	447 aa		10.59	□□□□□ -0.71
UBC-213	ENST00000546120	KPNA4	O00629	521 aa	Predicted RBP	10.59	□□□□□ -0.71
UBC-213	ENST00000546120	TXNDC9	O14530	226 aa		10.59	□□□□□ -0.71
UBC-213	ENST00000546120	DKC1	O60832	514 aa	Known RBP eCLIP	10.59	□□□□□ -0.71
UBC-213	ENST00000546120	H2AFY	O75367	372 aa	Known RBP	10.59	□□□□□ -0.71
UBC-213	ENST00000546120	H6PD	O95479	791 aa		10.59	□□□□□ -0.71
UBC-213	ENST00000546120	POLR2M	P0CAP2	368 aa		10.59	□□□□□ -0.71
UBC-213	ENST00000546120	THRA	P10827	490 aa		10.59	□□□□□ -0.71
UBC-213	ENST00000546120	CYP11B1	P15538	503 aa		10.59	□□□□□ -0.71
UBC-213	ENST00000546120	CRHR1	P34998	444 aa		10.59	□□□□□ -0.71
UBC-213	ENST00000546120	GRIA2	P42262	883 aa		10.59	□□□□□ -0.71
UBC-213	ENST00000546120	HAL	P42357	657 aa		10.59	□□□□□ -0.71
UBC-213	ENST00000546120	CASP4	P49662	377 aa		10.59	□□□□□ -0.71
UBC-213	ENST00000546120	BCAP31	P51572	246 aa		10.59	□□□□□ -0.71
UBC-213	ENST00000546120	GPC3	P51654	580 aa		10.59	□□□□□ -0.71
UBC-213	ENST00000546120	ARSE	P51690	589 aa		10.59	□□□□□ -0.71
UBC-213	ENST00000546120	AQP4	P55087	323 aa		10.59	□□□□□ -0.71
UBC-213	ENST00000546120	PLOD1	Q02809	727 aa	Predicted RBP	10.59	□□□□□ -0.71
UBC-213	ENST00000546120	C1QBP	Q07021	282 aa	Known RBP	10.59	□□□□□ -0.71
UBC-213	ENST00000546120	DLG1	Q12959	904 aa		10.59	□□□□□ -0.71
UBC-213	ENST00000546120	NFX1	Q12986	1120 aa	Known RBP	10.59	□□□□□ -0.71
UBC-213	ENST00000546120	STX3	Q13277	289 aa		10.59	□□□□□ -0.71
UBC-213	ENST00000546120	NAB1	Q13506	487 aa		10.59	□□□□□ -0.71
UBC-213	ENST00000546120	MYLK3	Q32MK0	819 aa		10.59	□□□□□ -0.71
UBC-213	ENST00000546120	GRAMD1B	Q3KR37	738 aa		10.59	□□□□□ -0.71
UBC-213	ENST00000546120	ZBED5	Q49AG3	693 aa		10.59	□□□□□ -0.71
UBC-213	ENST00000546120	RABGAP1L	Q5R372	815 aa		10.59	□□□□□ -0.71
UBC-213	ENST00000546120	CYP2U1	Q7Z449	544 aa		10.59	□□□□□ -0.71
UBC-213	ENST00000546120	POLN	Q7Z5Q5	900 aa		10.59	□□□□□ -0.71
UBC-213	ENST00000546120	TICAM1	Q8IUC6	712 aa		10.59	□□□□□ -0.71
UBC-213	ENST00000546120	NUDCD3	Q8IVD9	361 aa		10.59	□□□□□ -0.71
UBC-213	ENST00000546120	FAM178B	Q8IXR5	827 aa		10.59	□□□□□ -0.71
UBC-213	ENST00000546120	MCOLN2	Q8IZK6	566 aa		10.59	□□□□□ -0.71
UBC-213	ENST00000546120	MYCT1	Q8N699	235 aa		10.59	□□□□□ -0.71
UBC-213	ENST00000546120	TSPAN14	Q8NG11	270 aa		10.59	□□□□□ -0.71
UBC-213	ENST00000546120	CABLES1	Q8TDN4	633 aa		10.59	□□□□□ -0.71
UBC-213	ENST00000546120	PRPF31	Q8WWY3	499 aa	Known RBP	10.59	□□□□□ -0.71
UBC-213	ENST00000546120	SPOCK2	Q92563	424 aa		10.59	□□□□□ -0.71
UBC-213	ENST00000546120	ATP2A3	Q93084	1043 aa		10.59	□□□□□ -0.71

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