RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542337.5

DDB1-220, Transcript of damage specific DNA binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene DDB1, Length 558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1-220ENST00000542337 DPYDQ12882 1025 aa21.54■■□□□ 1.04
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DDB1-220ENST00000542337 SUMF1Q8NBK3 374 aa21.54■■□□□ 1.04
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DDB1-220ENST00000542337 TAF4BQ92750 862 aa21.54■■□□□ 1.04
DDB1-220ENST00000542337 SLITRK1Q96PX8 696 aa21.54■■□□□ 1.04
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DDB1-220ENST00000542337 ACOT1Q86TX2 421 aa21.49■■□□□ 1.03
DDB1-220ENST00000542337 LONP2Q86WA8 852 aa21.49■■□□□ 1.03
DDB1-220ENST00000542337 UNC93AQ86WB7 457 aa21.49■■□□□ 1.03
DDB1-220ENST00000542337 DCLK2Q8N568 766 aa21.49■■□□□ 1.03
DDB1-220ENST00000542337 KIAA1958Q8N8K9 716 aa21.49■■□□□ 1.03
DDB1-220ENST00000542337 RIN3Q8TB24 985 aa21.49■■□□□ 1.03
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