RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534967.1

GOLGA3-204, Transcript of golgin A3, humanhuman

TSL 3

Gene GOLGA3, Length 484 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3-204ENST00000534967 SYCP3Q8IZU3 236 aa28.21■■■□□ 2.11
GOLGA3-204ENST00000534967 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP28.21■■■□□ 2.11
GOLGA3-204ENST00000534967 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP28.2■■■□□ 2.1
GOLGA3-204ENST00000534967 BDNFP23560 247 aa28.2■■■□□ 2.1
GOLGA3-204ENST00000534967 LMO2P25791 158 aa28.2■■■□□ 2.1
GOLGA3-204ENST00000534967 PDE6CP51160 858 aa28.2■■■□□ 2.1
GOLGA3-204ENST00000534967 IRX4P78413 519 aa28.2■■■□□ 2.1
GOLGA3-204ENST00000534967 CRY1Q16526 586 aa28.2■■■□□ 2.1
GOLGA3-204ENST00000534967 C8orf34Q49A92 452 aa28.2■■■□□ 2.1
GOLGA3-204ENST00000534967 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa28.2■■■□□ 2.1
GOLGA3-204ENST00000534967 PIGKQ92643 395 aa28.2■■■□□ 2.1
GOLGA3-204ENST00000534967 SPATA17Q96L03 361 aa28.2■■■□□ 2.1
GOLGA3-204ENST00000534967 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa28.2■■■□□ 2.1
GOLGA3-204ENST00000534967 CRTAC1Q9NQ79 661 aa28.2■■■□□ 2.1
GOLGA3-204ENST00000534967 CCDC39Q9UFE4 941 aa28.2■■■□□ 2.1
GOLGA3-204ENST00000534967 CYP17A1P05093 508 aa28.19■■■□□ 2.1
GOLGA3-204ENST00000534967 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP28.19■■■□□ 2.1
GOLGA3-204ENST00000534967 GRIK1P39086 918 aa28.19■■■□□ 2.1
GOLGA3-204ENST00000534967 UAP1L1Q3KQV9 507 aa28.19■■■□□ 2.1
GOLGA3-204ENST00000534967 TMEM92Q6UXU6 159 aa28.19■■■□□ 2.1
GOLGA3-204ENST00000534967 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa28.19■■■□□ 2.1
GOLGA3-204ENST00000534967 SFTPA1Q8IWL2 248 aa28.19■■■□□ 2.1
GOLGA3-204ENST00000534967 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa28.19■■■□□ 2.1
GOLGA3-204ENST00000534967 CDH9Q9ULB4 789 aa28.19■■■□□ 2.1
GOLGA3-204ENST00000534967 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa28.19■■■□□ 2.1
GOLGA3-204ENST00000534967 CEACAM1P13688 526 aa28.18■■■□□ 2.1
GOLGA3-204ENST00000534967 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP28.18■■■□□ 2.1
GOLGA3-204ENST00000534967 MYO1EQ12965 1108 aa28.18■■■□□ 2.1
GOLGA3-204ENST00000534967 VSTM1Q6UX27 236 aa28.18■■■□□ 2.1
GOLGA3-204ENST00000534967 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa28.18■■■□□ 2.1
GOLGA3-204ENST00000534967 SV2BQ7L1I2 683 aa28.18■■■□□ 2.1
GOLGA3-204ENST00000534967 RLN3Q8WXF3 142 aa28.18■■■□□ 2.1
GOLGA3-204ENST00000534967 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa28.18■■■□□ 2.1
GOLGA3-204ENST00000534967 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP28.18■■■□□ 2.1
GOLGA3-204ENST00000534967 CLIC4Q9Y696 253 aa28.18■■■□□ 2.1
GOLGA3-204ENST00000534967 FAM208BQ5VWN6 2430 aa28.18■■■□□ 2.1
GOLGA3-204ENST00000534967 PTPRJQ12913 1337 aa28.18■■■□□ 2.1
GOLGA3-204ENST00000534967 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP28.17■■■□□ 2.1
GOLGA3-204ENST00000534967 PDGFRBP09619 1106 aa28.17■■■□□ 2.1
GOLGA3-204ENST00000534967 IDEP14735 1019 aa28.17■■■□□ 2.1
GOLGA3-204ENST00000534967 SLC6A11P48066 632 aa28.17■■■□□ 2.1
GOLGA3-204ENST00000534967 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP28.17■■■□□ 2.1
GOLGA3-204ENST00000534967 CYP27A1Q02318 531 aa28.17■■■□□ 2.1
GOLGA3-204ENST00000534967 MESP2Q0VG99 397 aa28.17■■■□□ 2.1
GOLGA3-204ENST00000534967 RRAGBQ5VZM2 374 aa28.17■■■□□ 2.1
GOLGA3-204ENST00000534967 DPH6Q7L8W6 267 aa28.17■■■□□ 2.1
GOLGA3-204ENST00000534967 LIMS2Q7Z4I7 341 aa28.17■■■□□ 2.1
GOLGA3-204ENST00000534967 ALLCQ8N6M5 410 aa28.17■■■□□ 2.1
GOLGA3-204ENST00000534967 OR5B17Q8NGF7 314 aa28.17■■■□□ 2.1
GOLGA3-204ENST00000534967 OLIG1Q8TAK6 271 aa28.17■■■□□ 2.1
GOLGA3-204ENST00000534967 HPDLQ96IR7 371 aa28.17■■■□□ 2.1
GOLGA3-204ENST00000534967 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP28.17■■■□□ 2.1
GOLGA3-204ENST00000534967 ADAM33Q9BZ11 813 aa28.17■■■□□ 2.1
GOLGA3-204ENST00000534967 RNF38Q9H0F5 515 aa28.17■■■□□ 2.1
GOLGA3-204ENST00000534967 OLFML3Q9NRN5 406 aa28.17■■■□□ 2.1
GOLGA3-204ENST00000534967 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP28.17■■■□□ 2.1
GOLGA3-204ENST00000534967 PTPRDP23468 1912 aa28.17■■■□□ 2.1
GOLGA3-204ENST00000534967 ZZEF1O43149 2961 aa28.17■■■□□ 2.1
GOLGA3-204ENST00000534967 PFKLP17858 780 aa28.16■■■□□ 2.1
GOLGA3-204ENST00000534967 ANXA13P27216 316 aa28.16■■■□□ 2.1
GOLGA3-204ENST00000534967 ERICH6BQ5W0A0 696 aa28.16■■■□□ 2.1
GOLGA3-204ENST00000534967 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa28.16■■■□□ 2.1
GOLGA3-204ENST00000534967 GPD1LQ8N335 351 aa28.16■■■□□ 2.1
GOLGA3-204ENST00000534967 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP28.16■■■□□ 2.1
GOLGA3-204ENST00000534967 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP28.16■■■□□ 2.1
GOLGA3-204ENST00000534967 DEFB124Q8NES8 71 aa28.16■■■□□ 2.1
GOLGA3-204ENST00000534967 INTS13Q9NVM9 706 aa28.16■■■□□ 2.1
GOLGA3-204ENST00000534967 SMPD4Q9NXE4 827 aa28.16■■■□□ 2.1
GOLGA3-204ENST00000534967 CPQQ9Y646 472 aa28.16■■■□□ 2.1
GOLGA3-204ENST00000534967 ASPMQ8IZT6 3477 aa28.15■■■□□ 2.1
GOLGA3-204ENST00000534967 ZNF840PA6NDX5 716 aa28.15■■■□□ 2.1
GOLGA3-204ENST00000534967 ALDH1A2O94788 518 aa28.15■■■□□ 2.1
GOLGA3-204ENST00000534967 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP28.15■■■□□ 2.1
GOLGA3-204ENST00000534967 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP28.15■■■□□ 2.1
GOLGA3-204ENST00000534967 TIE1P35590 1138 aa28.15■■■□□ 2.1
GOLGA3-204ENST00000534967 SLC7A9P82251 487 aa28.15■■■□□ 2.1
GOLGA3-204ENST00000534967 DHCR24Q15392 516 aa28.15■■■□□ 2.1
GOLGA3-204ENST00000534967 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP28.15■■■□□ 2.1
GOLGA3-204ENST00000534967 ARMCX6Q7L4S7 300 aa28.15■■■□□ 2.1
GOLGA3-204ENST00000534967 FRMD1Q8N878 549 aa28.15■■■□□ 2.1
GOLGA3-204ENST00000534967 CEP295NLQ96MC4 621 aa28.15■■■□□ 2.1
GOLGA3-204ENST00000534967 CLIC6Q96NY7 704 aa28.15■■■□□ 2.1
GOLGA3-204ENST00000534967 TTLL2Q9BWV7 592 aa28.15■■■□□ 2.1
GOLGA3-204ENST00000534967 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP28.15■■■□□ 2.1
GOLGA3-204ENST00000534967 IGF2RP11717 2491 aa28.15■■■□□ 2.1
GOLGA3-204ENST00000534967 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa28.14■■■□□ 2.1
GOLGA3-204ENST00000534967 SGK1O00141 431 aa28.14■■■□□ 2.1
GOLGA3-204ENST00000534967 ABL1P00519 1130 aa28.14■■■□□ 2.1
GOLGA3-204ENST00000534967 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP28.14■■■□□ 2.1
GOLGA3-204ENST00000534967 P2RY2P41231 377 aa28.14■■■□□ 2.1
GOLGA3-204ENST00000534967 ALCAMQ13740 583 aa28.14■■■□□ 2.1
GOLGA3-204ENST00000534967 TRIM61Q5EBN2 209 aa28.14■■■□□ 2.1
GOLGA3-204ENST00000534967 LPCAT2Q7L5N7 544 aa28.14■■■□□ 2.1
GOLGA3-204ENST00000534967 C12orf40Q86WS4 652 aa28.14■■■□□ 2.1
GOLGA3-204ENST00000534967 TMEFF1Q8IYR6 380 aa28.14■■■□□ 2.1
GOLGA3-204ENST00000534967 IL17RCQ8NAC3 791 aa28.14■■■□□ 2.1
GOLGA3-204ENST00000534967 PCED1BQ96HM7 432 aa28.14■■■□□ 2.1
GOLGA3-204ENST00000534967 FNBP1Q96RU3 617 aa28.14■■■□□ 2.1
GOLGA3-204ENST00000534967 PNKPQ96T60 521 aa28.14■■■□□ 2.1
GOLGA3-204ENST00000534967 SCNM1Q9BWG6 230 aa28.14■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.9 ms